About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Stx4a
syntaxin 4A (placental)
MGI:893577

74 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33171252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127823298frhg : within coordinates of
Stx1b : Intron
Stx4a : 996 bp upstream of
2SNPCCCCCC C CCTC CC TCTCC/T
rs48568755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127823337frhg : within coordinates of
Stx1b : Intron
Stx4a : 957 bp upstream of
1SNP  G              A   A/G
rs33172095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127824117frhg : within coordinates of
Stx1b : Intron
Stx4a : 177 bp upstream of
1SNPG  GTG G GGTG GG    GG/T
rs33172098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127824835frhg : within coordinates of
Stx1b : Locus-Region
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AATA AA  A AA/T
rs33172101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127824941frhg : within coordinates of
Stx1b : Locus-Region
Stx4a : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs33172924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127826192frhg : within coordinates of
Stx1b : Locus-Region
Stx4a : within coordinates of
2SNPAAGAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs33172927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127826635frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33172929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127828387frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs51480138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127828521frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
2SNP AG      A   A  G    A/G
rs33172932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127829421frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33173885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127829665frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33173888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127831080frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs33173891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127831326frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCT CC  CCCC/T
rs33173893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127831387frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33174726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127831455frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs6356783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127831935frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNP      C T            C/T
rs31604765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127831981frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
3SNP  T   C  C   T  T    C/T
rs6357797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127832125frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
2SNPT TTTTTCCTTCC TT  TCTC/T
rs33167556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127833605frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA T AA T AA  A AA/T
rs33167559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834223frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCT CC  CCCC/T
rs33167562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834299frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs33168245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834502frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33168248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834526frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC T CC T CC  C CC/T
rs33168251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834527frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGTG GG  GTGG/T
rs32517246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834606frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
3SNPCCTCCCCC CCCC CC  CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs220338527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127834811frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs33169126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127835140frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs33169129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127835169frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33169132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127835183frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPG GGGG A GG A GG  G GA/G
rs33169905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127835342frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33169908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127835665frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs33169911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127835851frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCC TT  TCTC/T
rs33169913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127836002frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs33170785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127836341frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCA CC  CCCA/C
rs33170788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127836464frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33170791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127836509frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33171494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127836581frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33171496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127837373frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33171499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127837675frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33171502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127837706frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTGT TT  TGTG/T
rs33172355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127837762frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCT CC  CCCC/T
rs33172358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127837783frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs33172361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838199frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs33172363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838345frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33173305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838402frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33173308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838459frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
2SNPG GAAA A GG AGGGA A GA/G
rs33173311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838500frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs33173794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838735frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCAC CC  CACA/C
rs33173797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838855frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs33173800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127838885frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTGT TT  TGTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33173803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127839552frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33174596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127839680frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33170616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127839754frhg : within coordinates of
Stx4a : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs33170619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127839839frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs33170622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127840846frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33171425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127840886frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33171428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127840908frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPC CCCC T CCCT CC  CCCC/T
rs33171431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127840930frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs33172284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127840969frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPG GGGG A GGGA GG  GGGA/G
rs33172287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127841546frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPG GGGG G GGAG GG  G GA/G
rs33172290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127841618frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNPG GGGG G GGTG GG  GTGG/T
rs51687720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127841777frhg : within coordinates of
Stx4a : Locus-Region
1SNP  T              T   T
rs33172293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127842033frhg : within coordinates of
Stx4a : mRNA-UTR
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs33173156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127842130frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs33173159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127842216frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs6187536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127842777frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNP      T A            A/T
rs33173162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127844515frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNPG GGGG A GG A GG  G GA/G
rs33173965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127845789frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNPT TTTT T TT T TT  T CC/T
rs33173968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127846389frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNPG GGGG A GG A GG  G GA/G
rs33173971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127846811frhg : within coordinates of
Stx4a : Intron
1SNPA AAAA G AA G AA  A AA/G
rs33174744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127849596frhg : within coordinates of
Stx4a : 577 bp downstream of
2SNPA AGGG G AA GAAAG G AA/G
rs33174747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127849835frhg : within coordinates of
Stx4a : 816 bp downstream of
1SNPA AAAA G AA A AA  A AA/G
rs33174750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127850351frhg : within coordinates of
Stx4a : 1332 bp downstream of
1SNPG GGGG A GG A GG  G GA/G
rs31436144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:127850360frhg : within coordinates of
Stx4a : 1341 bp downstream of
3SNPCCACCCCC CC C CC  C CA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory