About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Slc22a6
solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 6
MGI:892001

107 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs38993389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8691021fSlc22a6 : Locus-Region1SNPG GGG G AGGGG      GG    GGGA/G
rs37590271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8691341fSlc22a6 : Locus-Region1SNPC CCC C TCCTC      CC    CTCC/T
rs37485346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8691463fSlc22a6 : Locus-Region1SNPA AAA A GAAGA      AA    AGAA/G
rs37601487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692135fSlc22a6 : Locus-Region1SNPA AAA A TAATA      AA    ATAA/T
rs8264763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692201fSlc22a6 : Locus-Region2SNPA AAAAAATAATAA T AAAA  AAATAA/T
rs8264764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692302fSlc22a6 : Locus-Region1SNP  TTTTTTCT   T T TT    TT   C/T
rs8264765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692319fSlc22a6 : Locus-Region1SNP  TTTTTTC    T C TT    TT   C/T
rs36277612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692344fSlc22a6 : Locus-Region1SNPG GGG G AGGAG      GG    GAGA/G
rs8264766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692365fSlc22a6 : Locus-Region1SNP  TTTTTTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692379fSlc22a6 : Locus-Region2SNP  CCCCCC C   CCT CC  CCCC   C/T
rs8264742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692388fSlc22a6 : Locus-Region1SNP  CCCC CT    C C C     CC   C/T
rs8264743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692489fSlc22a6 : Locus-Region2SNPC CCCCCCACCACC A C CC  CCCACA/C
rs8264744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692623fSlc22a6 : mRNA-UTR1SNP  CCCCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs8264745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692626fSlc22a6 : mRNA-UTR2SNP GGGGGGGGA   G G GG    GG   A/G
rs8264746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692633fSlc22a6 : mRNA-UTR1SNP  CCCCCCCC   C G CC    CC   C/G
rs16784022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692737rSlc22a6 : mRNA-UTR1SNP  GGGGGGGG   GGA GG  GGGG   A/G
rs8264747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8692757rSlc22a6 : mRNA-UTR1SNP  CCCCCCAC   C A CC    CC   A/C
rs8264749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693064rSlc22a6 : Coding-Synonymous2SNPG GGG G TGG GG    GGG  GGG GG/T
rs8264748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693173rSlc22a6 : Intron2SNPA AAAAAAGAAGAA G AAAA  AAAGAA/G
rs36346854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693254fSlc22a6 : Intron1SNPG GGG G GGGCG      GG    GGGC/G
rs8264755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693341rSlc22a6 : Intron1SNP  T T TTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693416rSlc22a6 : Intron2SNPC CCC CCTCCCCC T CCCC  CCCCCC/T
rs8264753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693436rSlc22a6 : Intron1SNP  TTT TTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693440rSlc22a6 : Intron1SNP  AAA AAAA   A G AA    AA   A/G
rs8264751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693567rSlc22a6 : Coding-Synonymous1SNP  TTT TTTT   T A TT    TT   A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8264750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693667rSlc22a6 : Intron1SNP  TTT TTTT   T C TT     T   C/T
rs16795506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693789rSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   GGA GG  GGGG   A/G
rs16795505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693799rSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   AAG AA  AAAA   A/G
rs16795504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8693800rSlc22a6 : Intron1IN-DEL  --------   --A --  ----   -/A
rs8264762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694077rSlc22a6 : Intron2SNP  AAAAAAAA   AAG AA  AAAA   A/G
rs8264761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694108rSlc22a6 : Intron2SNP  TTTTTTTT   TTG TT  TTTT   G/T
rs8264760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694109rSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A G AA    AA   A/G
rs8264759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694112rSlc22a6 : Intron2SNPA AAAAAAGAGGAA G AAAA  AAAGGA/G
rs8264758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694157rSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G A GG    GG   A/G
rs8264757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694249rSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8694274rSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A T AA    AA   A/T
rs8264768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695472fSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A C AA    AA   A/C
rs8264769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695489fSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G A GG    GG   A/G
rs8264770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695567fSlc22a6 : Intron1Mixed  CCCCCCCC   C T C-    CC   -/C/T
rs8264771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695582fSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G A GG    GG   A/G
rs8264772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695585fSlc22a6 : Intron2SNPA AAAAAAGAAGAA G AAAA  AAAGAA/G
rs8264773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695700fSlc22a6 : Coding-Synonymous2SNPT TTTTTT?TTCTT C TTTT  TTTCTC/T
rs8264781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8695914fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696033fSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G C GG    GG   C/G
rs8264783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696118fSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A G AA    AA   A/G
rs8264784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696132fSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A T AA    AA   A/T
rs8264785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696135fSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A G AA    AA   A/G
rs8264786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696142fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T A TT    TT   A/T
rs8264787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696143fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696219fSlc22a6 : Intron1SNP  AAA  AAA   A G AA    AA   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8264775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696440fSlc22a6 : Intron1SNP  CCC CCCC   C A CC    CC   A/C
rs8264776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696486fSlc22a6 : Intron1SNP   TT TTTT   T G TT    TT   G/T
rs8264792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696620rSlc22a6 : Coding-NonSynonymous1SNP  CCCCC CC   C T CC    CC   C/T
rs8264791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696712rSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAA AA   A C AA    AA   A/C
rs8264790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696715rSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTT TT   T C TT    TT   C/T
rs8264789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696734rSlc22a6 : Intron1SNP  CCCCC CC   C T CC    CC   C/T
rs8264788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696775rSlc22a6 : Intron1SNP  AAAAA AA   A G AA    AA   A/G
rs8264777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696924fSlc22a6 : Intron1SNP  C CCCCCC   C G CC    CC   C/G
rs36775456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8696982fSlc22a6 : Intron1SNPG GGG G GGGGG      GG    GGAA/G
rs8264778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697026fSlc22a6 : Intron3Mixed    ----A-   - A --    --   -/A/C
rs8264793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697520fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T C TT    TT   C/T
rs8264794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697630fSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G T GG    GG   G/T
rs8264795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697632fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T G TT    TT   G/T
rs8264796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697633fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T G TT    TT   G/T
rs8264797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697668fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T G TT    TT   G/T
rs8264798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697669fSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G A GG    GG   A/G
rs8264799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697670fSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G T GG    GG   G/T
rs8264800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697689fSlc22a6 : Intron12Mixed  ------T-   - T --    --   -/G/T
rs8264815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697818rSlc22a6 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs8264814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697895rSlc22a6 : Intron2SNPA AAAAAAGAAAAA A AAAA  AAAAAA/G
rs8264813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8697909rSlc22a6 : Intron2SNPA AAAAAAGAAAAA A AAAA  AAAAAA/G
rs8264812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698017rSlc22a6 : Coding-NonSynonymous1SNP  CCCCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs38167898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698146fSlc22a6 : Coding-Synonymous1SNPA AAA A GAAAA      AA    AAAA/G
rs8264819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698271rSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGTG   G T GG    GG   G/T
rs8264816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698461fSlc22a6 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T G TT    TT   G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8264817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698462fSlc22a6 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs36351555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698628fSlc22a6 : Intron1SNPA AAA A GAAAA      AA    AAAA/G
rs8264818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698645fSlc22a6 : Intron2SNP  GGGGGGGG   GGA GG  GGGG   A/G
rs8264820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698837fSlc22a6 : Intron2SNPT TTTTTTCTTCTT C TTTT  TTTCTC/T
rs36801796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8698984fSlc22a6 : Intron1SNPC CCC C TCCCC      CC    CCCC/T
rs8264824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8699729rSlc22a6 : Intron1SNP  TTT TTCT   T C TT    TT   C/T
rs8264823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8699748rSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGAG   G G GG    GG   A/G
rs8264822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8699864rSlc22a6 : Intron1SNP  GGGGGGAG   G G GG    GG   A/G
rs8264821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8699927rSlc22a6 : Intron1SNP   AA AACA   A A AA     A   A/C
rs8264829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700010rSlc22a6 : Intron2Mixed  ------?-   - - --    --   -/A/G
rs8264828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700089rSlc22a6 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs8264827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700129rSlc22a6 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCCTC   C T CC    CC   C/T
rs8264826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700171rSlc22a6 : Coding-Synonymous1SNP  TTTTTTGT   T G TT    TT   G/T
rs8264825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700243rSlc22a6 : Coding-Synonymous1SNP  GGGGGGCG   G G GG    GG   C/G
rs36247281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700256fSlc22a6 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGG G GGGGG      GG    GAGA/G
rs8264846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700338rSlc22a6 : Intron2SNP  GGG   G    G T     GGGG   G/T
rs8264845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700423rSlc22a6 : Intron1SNP  GGG   GG   G A       GG   A/G
rs8264844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700427rSlc22a6 : Intron1SNP  CCC   GC   C C       CC   C/G
rs8264843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700433rSlc22a6 : Intron1SNP  GGG   AG   G A G     GG   A/G
rs8264842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700511rSlc22a6 : Intron2SNPC CCC C TCCCCC C C CC  CCCCCC/T
rs8264841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700561rSlc22a6 : Intron1SNP  GGG   GG   G A       GG   A/G
rs8264831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700678fSlc22a6 : Coding-NonSynonymous1SNP  A A AAGA   A A  A    A    A/G
rs8264832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700754fSlc22a6 : mRNA-UTR1SNP  AAAAAAGA   A G AA    AA   A/G
rs16795507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700949rSlc22a6 : mRNA-UTR1SNP  AAA AAAA   AAT AA  AAAA   A/T
rs8264840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700989rSlc22a6 : mRNA-UTR1IN-DEL  TTT TTTT   T - TT    TT   -/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8264839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8700991rSlc22a6 : mRNA-UTR1IN-DEL  AAA AAAA   A - AA    AA   -/A
rs8264838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8701019rSlc22a6 : Locus-Region1SNP  CCC CCCC   C A CC    CC   A/C
rs8264837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8701088rSlc22a6 : Locus-Region2SNPA AAA AACAAAAA A AAAA  AAAAAA/C
rs8264836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8701108rSlc22a6 : Locus-Region2SNPA AAA AAGAAGAA G AAAA  AAAGAA/G
rs8264835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8701144rSlc22a6 : Locus-Region1SNP  CCC CCCC   C A CC    CC   A/C
rs8264834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8701154rSlc22a6 : Locus-Region1SNP  GGG GGGG   G A GG    GG   A/G
rs8264833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:8701243rSlc22a6 : Locus-Region1SNP  CCC CCTC   C  C C    CC   C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory