About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Cxcr4
chemokine (C-X-C motif) receptor 4
MGI:109563

112 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51392395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586290fCxcr4 : 1909 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP AA      A    A      A      A
rs47210323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586291fCxcr4 : 1908 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
3SNPTTTTT T TTTGT T    TTT   TTTG/T
rs32492153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586575fCxcr4 : 1624 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP TT    C T                  C/T
rs31577007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586652fCxcr4 : 1547 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
4SNPGGGGG GCCGGCG G    GGG   GCGC/G
rs32284224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586690fCxcr4 : 1509 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
3SNPCCCCC CAACCAA      AC    AAAA/C
rs47899118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586875fCxcr4 : 1324 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
3SNPGGGGG G GGGAG G    GGG   GAGA/G
rs49677738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128586919fCxcr4 : 1280 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
3SNPGGGGG G GGGAG G    GGG   GAGA/G
rs52301453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587164fCxcr4 : 1035 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP C       C    C      C      C
rs50131114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587335fCxcr4 : 864 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
1SNP TT      T                  T
rs48221988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587390fCxcr4 : 809 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP GG      G    G      G      G
rs45758168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587475fCxcr4 : 724 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP A       A    A      A      A
rs46459244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587606fCxcr4 : 593 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP  A      A    A      A      A
rs265347311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587631fCxcr4 : 568 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
1SNP              T      C      C/T
rs48912127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587662fCxcr4 : 537 bp downstream of
Tli1 : within coordinates of
2SNP  A      A    A      A      A
rs48368549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587757fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  T      T    T      T      T
rs50839362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587814fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  A      A    A      A      A
rs50055459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587838fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  T      T    T      T      T
rs51406210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587874fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  C      C    C      C      C
rs48929350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587875fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  C      C    C      C      C
rs50427947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587921fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  C      C    C      C      C
rs48560244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128587925fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  A      A    G      A      A/G
rs219864621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588132fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP              T      C      C/T
rs47834136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588192fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  C           C      C      C
rs254059578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588206fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP              T      C      C/T
rs45706648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588257fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
2SNP CC           C      C      C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46192538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588262fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
2SNP  G           A      G      A/G
rs52093470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588306fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
2SNP AA           A      A      A
rs222442905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588370fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP              C      A      A/C
rs246780266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588376fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP              C      A      A/C
rs52157852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588379fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP CC      C                  C
rs47717003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588630fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
2SNP GG      G    G      G      G
rs228498655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588661fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP              C      C      C
rs243113335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588663fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      A      A
rs108798048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588727fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP T                          T
rs47482859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588827fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
2SNP AA      A    T      A      A/T
rs47107861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588841fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
2SNP GG      G    G      G      G
rs245603473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588852fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      A      A
rs8256198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128588966rCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
1SNP  TT TTTTT   T CTTT    TT   C/T
rs8256197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589065rCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
2SNP TTT TTCCT   T CTTC    CC   C/T
rs8256196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589098rCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
3SNP AAA AAGGA   AAGAAG  A AA   A/G
rs8256195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589128rCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
2SNP  GG GGGGG   GAGGGG  G GA   A/G
rs8256191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589277fCxcr4 : Coding-NonSynonymous
Tli1 : within coordinates of
3SNP TT  T C T   TTC  C  T      C/T
rs8256192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589359fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
1SNP  A  A A A     G  A     A   A/G
rs8256193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589482fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
4SNP  T  T C T    TC  C  T  T   C/T
rs8256194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589506fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
4SNP  G  G A G   GGG  A  G  G   A/G
rs254006315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589548fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      A      A
rs8256190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589593fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
2SNP  CC  CCCC   CCTC C   C     C/T
rs31721069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589866fCxcr4 : Coding-Synonymous
Tli1 : within coordinates of
3SNP CC    A C    C      C      A/C
rs233531756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128589953fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP              T      C      C/T
rs51875499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590041fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  C      C    C      C      C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8243514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590076rCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP       TC         T         C/T
rs32706502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590139fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP AA    G A    A      A      A/G
rs243935892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590161fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP              T      G      G/T
rs31574519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590164fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP GG    A G    G      G      A/G
rs30607537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590205fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP TT    C T    T      T      C/T
rs52141183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590231fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AA      A                  A
rs52346754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590233fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AA      A                  A
rs52334662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590393fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AA      A                  A
rs52183155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590457fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP AA      A    A      A      A
rs52296482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590484fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AA      A                  A
rs259278041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590488fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP              G      A      A/G
rs52582822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590527fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AG      G                  A/G
rs52375772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590531fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AG      G                  A/G
rs52267662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590539fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP AG      G                  A/G
rs50089957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590752fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  G      G    G      T      G/T
rs48523866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590758fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  C      C    C      G      C/G
rs8256180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128590998fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP TT   TCCT      T      T    C/T
rs8256181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591086fCxcr4 : within coordinates of
Tli1 : within coordinates of
1SNP   C A A       A A      A   A/C
rs8256182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591087fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP CC  CCTTC    CCCCT  C CC   C/T
rs8256183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591102fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
2SNP  A   ACCA     CAAC    CC   A/C
rs8256184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591112fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP GG   GA G    GGGGA  G GG   A/G
rs8256185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591121fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP             T C C          C/T
rs8256186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591183fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP GG   GTGG    GGGGT  G GG   G/T
rs8256187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591191fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP  A   ACCA    ACAAC  A AA   A/C
rs8256188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591204fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP   T   G       G GG     G   G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8256189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591229fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  AA   GA    A AAAG    AA   A/G
rs8256177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591448fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  CC CCCCC   C ACCC    CC   A/C
rs8256178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591573fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP  TT TTCCT    TCTTC  T TT   C/T
rs8256179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591587fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  CC CCCCC   C TCCC    CC   C/T
rs8256170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591648fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
3SNP  CCCCCAAC    CAC A  C CC   A/C
rs8256171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591694fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCCC     TC C    CC   C/T
rs8256172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591735fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTTT     CT T    TT   C/T
rs8256173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591801fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
4SNP  AAAAATTA    AAA T  A AA   A/T
rs8256174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591853fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  AA AAAAA     TA A    AA   A/T
rs8256175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591878fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  CC CCCTC      C C    CC   C/T
rs8256176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128591926fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
4SNP  AA AAGGA    G A G  A AG   A/G
rs8256166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592099fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
4SNP CCCCCCTTC   CCCC T  C CC   C/T
rs8256167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592118fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCCC   C TC C    CC   C/T
rs8256168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592164fCxcr4 : Intron
Tli1 : within coordinates of
4SNP CCCCCCTCC   CCCC T  C CC   C/T
rs32259371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592265fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1SNP GG    T G                  G/T
rs8256169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592267fCxcr4 : mRNA-UTR
Tli1 : within coordinates of
1IN-DEL  -- --T--      - T    -    -/T
rs32288292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592347fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
3SNP AA    C A    A      C      A/C
rs31831999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592361fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
3SNP TT    C T    T      T      C/T
rs32405529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592487fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
3SNP AA    G      A      A      A/G
rs240757040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592670fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              G      C      C/G
rs252741801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592691fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      T      A/T
rs222902226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592734fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              C      T      C/T
rs50961641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592858fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP TT      T                  T
rs239280556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592869fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      G      A/G
rs265738385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128592973fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              T      C      C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51810896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593017fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP GG      G                  G
rs230420815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593067fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              C      T      C/T
rs50138915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593208fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
2SNP  G      G    G      G      G
rs261755250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593281fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      G      A/G
rs49680460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593592fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP CC      C                  C
rs225228265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593702fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              A      G      A/G
rs49409846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593720fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
2SNP CC      C    C      C      C
rs217183336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128593985fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              G      T      G/T
rs227145761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128594094fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
1SNP              G      G      G
rs32535399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128594107fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
3SNPT T    C T    T      C      C/T
rs32069654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128594119fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
3SNPG G    A G    G      G      A/G
rs32185289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:128594223fCxcr4 : Locus-Region
Tli1 : within coordinates of
3SNPA      G A    A      A      A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory