About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Trpc2
transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2
MGI:109527

128 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31461527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109223629fTrpc2 : Locus-Region1SNP  C   C  T        C/T
rs31502738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109223645fTrpc2 : Locus-Region1SNP      T  C        C/T
rs31839391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109224413fTrpc2 : Coding-NonSynonymous1SNPT GGGT G TGTGGGGTGG/T
rs31840564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109224492fTrpc2 : Intron1SNP  AAAG A GAGAAAAGAA/G
rs31840567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109224567fTrpc2 : Intron1SNP  GGGA G AGAGGGGAGA/G
rs31840569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109224673fTrpc2 : Intron1SNP  GGGC G CGCGGGGCGC/G
rs31840572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109224802fTrpc2 : Intron1SNP  TTTC T CTCTT TCTC/T
rs31841565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109225618fTrpc2 : Intron1SNP  GGGA G AGAGGGGAGA/G
rs31841568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109225707fTrpc2 : Intron1SNP  CCCT C TCTCCCCTCC/T
rs31841571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109226524fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG G GGGGGAGGGA/G
rs31841573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109226559fTrpc2 : Intron1SNP  TTTG G GTGGGGGGGG/T
rs31842486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109226867fTrpc2 : Intron1SNPA GGGA A AGAAAAAAAA/G
rs31842489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227153fTrpc2 : Intron1SNP  GGGA A AGAGGGGAGA/G
rs31842492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227254fTrpc2 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs31843425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227279fTrpc2 : Coding-NonSynonymous1SNPC GGGC   CGCGGGGCGC/G
rs31843428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227362fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs31843431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227676fTrpc2 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC A CCCCCCCCCA/C
rs31844274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227761fTrpc2 : Intron1SNP  AAAG   GAGAAGAGAA/G
rs31844277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109227831fTrpc2 : Intron1SNPA AAAA A AAAAAGAAAA/G
rs31844280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228152fTrpc2 : Intron1SNP  AAAG G GAGGGGGGGA/G
rs31844283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228165fTrpc2 : Intron1SNPA GGGA G AGAGGGGAGA/G
rs31845045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228509fTrpc2 : Intron1SNPA TTTA T ATATTTTATA/T
rs31845048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228599fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs31845051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228651fTrpc2 : Intron1SNPC CCCC C CCCCCCCCTC/T
rs31845984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228677fTrpc2 : Intron1SNP  GGGG G  G GGAG GA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31845987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228678fTrpc2 : Intron1SNP  CCC  T  CTCCCCTCC/T
rs31845990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228681fTrpc2 : Intron1SNP  GGGG G AG GGGGAGA/G
rs31837926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228689fTrpc2 : Intron1SNPC CCCC T  C CCCC CC/T
rs31837929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228716fTrpc2 : Intron1SNP  TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs31837932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228780fTrpc2 : Intron1SNP  CCCC C CCCCCGCCCC/G
rs31838805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228900fTrpc2 : Intron1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs31838808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228938fTrpc2 : Intron1SNPC AAAC C CACAAAACAA/C
rs31838811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109228997fTrpc2 : Intron1SNPC TTTC C CTCTTTTCTC/T
rs31839764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109229082fTrpc2 : Coding-NonSynonymous1SNP  GGGT G TGTGGGGGGG/T
rs31839766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109229424fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs31839769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109229930fTrpc2 : Intron1SNPG AAAG G GAGAAAAGAA/G
rs31839772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109230012fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNP  GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs31840785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109230039fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPG AAAG A GAGAAAAGAA/G
rs31840788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109230100fTrpc2 : Coding-NonSynonymous1SNP  GGGA G AGAGGGGAGA/G
rs31840790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109230957fTrpc2 : Intron1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs31840793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231073fTrpc2 : Intron1SNP  AAA  A GAGAA AGAA/G
rs31841696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231109fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG G GGCGGGG GC/G
rs31841699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231167fTrpc2 : Intron1SNPG AAAG G GAGAAGAGAA/G
rs31841702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231357fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG G GGGGGCGGGC/G
rs31842435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231455fTrpc2 : Intron1SNP  AA G   GAGA GAGAA/G
rs31842437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231468fTrpc2 : Intron1SNP  CCCA C  C CCCC CA/C
rs31842440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231859fTrpc2 : Intron1SNP  AAAA G AAAAAGAAAA/G
rs31842443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231867fTrpc2 : Intron1SNP  GGGA G AGAGGGGAGA/G
rs31843366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231884fTrpc2 : Intron1SNPT TTTT G TTTTTGTTTG/T
rs31843369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231920fTrpc2 : Intron1SNP  CCCC T CCCCC CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31843372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231941fTrpc2 : Intron1SNPT TTTT A TTTTTTTTTA/T
rs31844205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109231998fTrpc2 : Intron1SNPA AAAA C AAAAACAAAA/C
rs31844208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232075fTrpc2 : Intron1SNP  TTTC   CTCT CTCTC/T
rs31844210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232078fTrpc2 : Intron1SNP  TTTT   TTTTA A AA/T
rs31844212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232115fTrpc2 : Intron1SNPG AAAG G GAGA GAGAA/G
rs31845075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232150fTrpc2 : Intron1SNP  TTTG T GTGTTTTGTG/T
rs31845078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232180fTrpc2 : Intron1SNPT CCCT C TCTCC CTCC/T
rs31845081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232319fTrpc2 : Intron1SNP  AAAC A CACAAAA AA/C
rs31845514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232500fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNP  GGGA G AGAGGGGAGA/G
rs31845516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232695fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG T GGGG TGGGG/T
rs31837895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232732fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNP  CCCC C CCCCCCCACA/C
rs31837898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109232935fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC T CCCCCTCCCC/T
rs31837901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233010fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPC GGGC G CGCGGGGCGC/G
rs31838744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233040fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPC TTTC C CTCTTCTCTC/T
rs31838747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233076fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA G AAAAAGAAAA/G
rs31838749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233154fTrpc2 : Intron1SNPT TTTT C TTTTTCTTTC/T
rs31838752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233224fTrpc2 : Intron1SNP  GGGA   AGAGG GAGA/G
rs31839844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233443fTrpc2 : Intron1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs31839846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233495fTrpc2 : Intron1SNPC CCCT   TC CCCC  C/T
rs31839849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233561fTrpc2 : Intron1SNPC CCCA   AC CCCC  A/C
rs31839851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233602fTrpc2 : Intron1SNPC CCCC   CC CCTC  C/T
rs31840924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233647fTrpc2 : Intron1SNPA AAAG   GA AAAA  A/G
rs31840927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109233680fTrpc2 : Intron1SNPG GGGA   AG GGAG  A/G
rs31840930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234077fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG   GG GAAA  A/G
rs31840932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234145fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG   GG GTGT  G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31841745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234189fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG   GG TGTG  G/T
rs31841748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234231fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG   GG AGGG  A/G
rs31841751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234290fTrpc2 : Intron1SNPC CCCC   CC CCTC  C/T
rs31727979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234570fTrpc2 : Intron1SNP CC   T  C        C/T
rs31422861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234901fTrpc2 : Intron2SNPCCCCCCT  CC TCTC  C/T
rs31050109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109234977fTrpc2 : Coding-Synonymous2SNPGGGGGGA  GG AGAG  A/G
rs31842656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109235204fTrpc2 : Intron2SNPGGGGGGA  GG AGAG  A/G
rs31842658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109236650fTrpc2 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   CC TCTC  C/T
rs31791231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109236909fTrpc2 : Intron1SNP  A   C           A/C
rs31898753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109236924fTrpc2 : Intron1SNP  A   T           A/T
rs31622574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109236932fTrpc2 : Intron1SNP  A   G           A/G
rs6359416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109236934fTrpc2 : Intron1SNP      G T         G/T
rs6359414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109236941fTrpc2 : Intron1SNP      A T         A/T
rs6359947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237025fTrpc2 : Intron1SNP      T C         C/T
rs32085111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237096fTrpc2 : Intron1SNP  G   T           G/T
rs6360441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237103fTrpc2 : Intron1SNP      C T         C/T
rs6360459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237117fTrpc2 : Intron1SNP      T C         C/T
rs6360530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237151fTrpc2 : Intron1SNP      A G         A/G
rs6360532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237152fTrpc2 : Intron1SNP      T G         G/T
rs6361065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237245fTrpc2 : Intron1SNP      T C         C/T
rs6361490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237260fTrpc2 : Intron1SNP      T C         C/T
rs6361618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237348fTrpc2 : Intron1SNP      G A         A/G
rs6362124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237418fTrpc2 : Intron2SNP AA   G AA        A/G
rs6362162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237418fTrpc2 : Intron1SNP      C T         C/T
rs31747579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109237569fTrpc2 : Intron1SNP TT   C  T        C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31842661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109238744fTrpc2 : Intron1SNPG GGGG   GG CGCG  C/G
rs32052810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109239996fTrpc2 : Intron1SNP TT   C  T        C/T
rs31705657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109239997fTrpc2 : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs32128356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109240000fTrpc2 : Intron1SNP TT   C  T        C/T
rs31570973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109240200fTrpc2 : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs32441016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109241368fTrpc2 : Intron1SNP TT   C  T        C/T
rs31195340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109242279fTrpc2 : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs31842663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109243851fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPC CCCC C CCTCCCCTTC/T
rs31843866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109243915fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPT TTTT T TTTTTTTTCC/T
rs31843869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109243946fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPA AAAA   AAGAAAA AA/G
rs31843872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109243954fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPT TTTT   TTCTTTT CC/T
rs31548118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109243981fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNP  T   C           C/T
rs31844684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109243991fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
2SNP  TTTTCC TTCTTT CCC/T
rs32118947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244113fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNP  T   C  T        C/T
rs31844687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244216fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPA AAAA C AACAAAACCA/C
rs31844690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244340fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPC CCCC A CCACCCCACA/C
rs31844693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244364fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Intron
1SNPC CCCC C CCCCCCCCAA/C
rs31845296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244608fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG A GGAGGGGAAA/G
rs31845299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244678fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC C CCCTCTCCCC/T
rs32438775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244728fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Coding-NonSynonymous
1SNP  C   T  C        C/T
rs31837874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244802fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT   TTCTTTT TC/T
rs31837877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244805fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT C TT TTTT CC/T
rs31837880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109244992fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Locus-Region
1SNP  CCCC   CCTCCCC CC/T
rs31551931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109245000fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Locus-Region
1SNP AA   G           A/G
rs31837882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109245012fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Locus-Region
1SNP  GGGG   GGGGGGGGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31838845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109245079fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Locus-Region
1SNPA AAAA T AATAAAATTA/T
rs31838848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109245219fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Locus-Region
1SNPA AAAA   AA AAAAGGA/G
rs31838850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:109245300fArt5 : Locus-Region
Trpc2 : Locus-Region
2SNPTTTTTTC  TT CTCT  C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory