About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Lmo4
LIM domain only 4
MGI:109360

72 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36896899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144186734fLmo4 : 1796 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
2SNPAAGGGG G GG GAG GAGA/G
rs37067111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187151fLmo4 : 1379 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA G A GGAA AGAA/G
rs36633904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187194fLmo4 : 1336 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAGAA AAAA/G
rs36623550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187654fLmo4 : 876 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CC CCC C  C/T
rs36363149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187674fLmo4 : 856 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCTCC CCCC/T
rs37280172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187684fLmo4 : 846 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCCCC CTCC/T
rs36325685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187780fLmo4 : 750 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA T AA AAA A AA/T
rs37267626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144187972fLmo4 : 558 bp downstream of
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTTGG GTGG/T
rs37137183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144188051fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AA AAA A AA/G
rs37441408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144188076fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAAGG GAGA/G
rs38700537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144188260fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC G C  GCC C CC/G
rs36375284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144188362fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTTGG GTGG/T
rs37028153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144188424fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TT TTT T  A/T
rs37780398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144189355fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPAAAAAA G AA AAA A AA/G
rs51940872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144189360fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP AA      A         A
rs30797363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144189400fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
3SNPAAAAAAAA GGAAAA AAAA/G
rs50134519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144189798fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP CC      C         C
rs36389141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144189886fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPC CCCC C CC  CC CTCC/T
rs38336770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144189918fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GG  GG GTGG/T
rs37104002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190005fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPG GGGG G GGAAGG GAGA/G
rs37300609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190086fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPC CCCC C CCACCCACACA/C
rs47328256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190173fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP  T      T     C   C/T
rs48397014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190180fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP  G      G     A   A/G
rs46167149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190187fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP  G      G     T   G/T
rs36896276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190289fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPT TTTT C TTCCTTCTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49760975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190304fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP AA      A     G   A/G
rs39551126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190529fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG C GG CGG G GC/G
rs38801685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190634fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AA  AA AGAA/G
rs38712025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190669fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AA AAA ACAA/C
rs36262819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190683fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTTCTT TTTC/T
rs38414267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190713fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAAAA AGAA/G
rs36952197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190788fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGG GAGA/G
rs36946322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190856fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGCCGG GCGC/G
rs37760680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144190881fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs37084243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144191231fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCCCC CGCC/G
rs31274958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144191692fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
3SNPCCCCCCCC TTCCCC CCCC/T
rs36329768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144192174fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT A T AATT TA A/T
rs37217109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144192200fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGAGG GGGA/G
rs37320794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193222fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACCAA ACAA/C
rs36396555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193273fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAAGG GAGA/G
rs39869667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193434fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs49984758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193508fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP TT      T     C   C/T
rs47393219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193524fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP GG      G     A   A/G
rs30502428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193529fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPTTC   C  C     C   C/T
rs46550196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193714fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP GG            A   A/G
rs36426058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193728fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPCCCCCC T CC TCCTC CC/T
rs51267714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144193750fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP CC            T   C/T
rs107810472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194374fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP TT      T     A   A/T
rs107655503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194376fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP CC      C     G   C/G
rs107880611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194396fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP GG      G     A   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36752967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194515fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNPAAAAAA G AA GAAGAGAA/G
rs108208962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194531fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP  G      G     C   C/G
rs108800895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194548fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP  A      A     G   A/G
rs38127320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144194645fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT G TTTTTT TTTG/T
rs37600959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144195039fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCCCCC CCCA/C
rs37307997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144195759fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGG GGGA/G
rs38764532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144197036fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TT TTT TCTC/T
rs36508945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144197052fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs30801966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144200543fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP AT   T  T         A/T
rs52479004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144200689fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP GG                G
rs31159998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144200699fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
2SNP TC   C  C         C/T
rs108712918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144200726fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP GG      G         G
rs30758135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144200765fLmo4 : Intron
Sum2 : within coordinates of
1SNP GT   T  T         G/T
rs13474998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144201869rLmo4 : Coding-NonSynonymous
Lmo4 : Coding-Synonymous
Sum2 : within coordinates of
2SNP CT   T  T         C/T
rs30701473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144203474fLmo4 : Intron
Lmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNP CT   T  T         C/T
rs31390119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144203778fLmo4 : Intron
Lmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNP AA   A  C         A/C
rs6153686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144203847fLmo4 : Intron
Lmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNP      A G          A/G
rs46233074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144206473fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNP AG      G         A/G
rs38676191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144206642fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs36273318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144206902fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGG GGGA/G
rs37354436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144206956fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
2SNPTTAAAA T AAT T   TTA/T
rs39186866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:144207238fLmo4 : Locus-Region
Sum2 : within coordinates of
2SNPTTCCCC C CCCCTC CCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/25/2015
MGI 6.0
The Jackson Laboratory