About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Pitx2
paired-like homeodomain transcription factor 2
MGI:109340

43 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48937366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129198417fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Locus-Region
2SNP      T   T  C    C/T
rs36551210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129200724fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGGGGGG GG  GAGA/G
rs36477677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129201732fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGAGGGG GG  GGGA/G
rs37142490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129202105fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGAGGGG GG  GGGA/G
rs37304890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129202943fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGGGGGG GG  GTGG/T
rs38660932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129203350fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAAGAAAA AA  AAAA/G
rs37129609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129203750fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCGCCCC C   CGCC/G
rs37626992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129203771fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGAGGGG GG  GAGA/G
rs36486498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129203819fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCTCCCC CT  CTCC/T
rs38432017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129204462fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Coding-NonSynonymous
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAAAAAAA AC  AAAA/C
rs39016764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129204853fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTTCTTTT TT  TCTC/T
rs36928185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129204979fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGAGGGG GG  GAGA/G
rs38228906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129205164fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAAAAAAA AG  AAAA/G
rs37111181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129205367fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGCGGGG GG  GCGC/G
rs38621055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129205572fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGGGGGG GG  GAGA/G
rs36606456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129205591fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTTATTTT TA  T TA/T
rs38337519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129205922fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAAAAAAA AA  AGAA/G
rs36546358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129206228fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCTCCCC CC  CC C/T
rs37027127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129206231fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTT TTTT TT  TTCC/T
rs38624362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129206624fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTTATTTT TT  TTTA/T
rs36668337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129206672fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTTGTTTT TT  TGTG/T
rs38627191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129206772fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCTCCCC CC  CCCC/T
rs37495240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129206924fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCACCCC CC  C CA/C
rs36259914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129207080fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCCCC C CC  CTCC/T
rs108821934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129207358fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNP G                G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37633342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129207645fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTTATTTT TT  TATA/T
rs37438895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129207917fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCTCCCC CC  CCCC/T
rs232136790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129209189fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNP          C  A    A/C
rs37413629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129209388fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAATAAAA AA  ATAA/T
rs37259260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129209665fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGAGGGG GA  G GA/G
rs38639497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129209928fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAAGAAAA AG  AGAA/G
rs38140218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129210199fam3 : within coordinates of
Gm27195 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCTCCCC CC  CTCC/T
rs38720505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129210648fam3 : within coordinates of
Gm27195 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGGGGGG GG  GAGA/G
rs36804143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129211056fam3 : within coordinates of
Gm27195 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPCCCCCACCCC CC  CCCA/C
rs36344978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129211093fam3 : within coordinates of
Gm27195 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGGGGGG GA  GGGA/G
rs37751896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129211344fam3 : within coordinates of
Gm27195 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPAAAAAGAAAA AA  AGAA/G
rs36992098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129211501fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPGGGGGTGGGG GG  GGGG/T
rs38406950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129211847fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNPTTTTTTTTTT TC  TCTC/T
rs36791285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129212086fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
Pitx2 : Locus-Region
1SNPTTTTTGTTTT TT  TGTG/T
rs108188744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129213201fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
Pitx2 : Locus-Region
1SNP A    A       T   A/T
rs107908797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129213236fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
Pitx2 : Locus-Region
1SNP A    A       T   A/T
rs256841628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129215388fam3 : within coordinates of
Pitx2 : Intron
1SNP          T  C    C/T
rs218790908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129219285fam3 : within coordinates of
Pitx2 : mRNA-UTR
1SNP          T  G    G/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory