About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Pip5k1a
phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type 1 alpha
MGI:107929

146 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31686408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95056782fPip5k1a : 1748 bp downstream of2SNPGGT   T  T           G/T
rs30555886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95057673fPip5k1a : 857 bp downstream of2SNP GA   A  A           A/G
rs49965619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95057690fPip5k1a : 840 bp downstream of1SNP TC      C           C/T
rs31641726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95057699fPip5k1a : 831 bp downstream of2SNP TC   C  C           C/T
rs30258119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95057708fPip5k1a : 822 bp downstream of2SNP AC   C  C           A/C
rs108018165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95058036fPip5k1a : 494 bp downstream of1SNP  G      G           G
rs33099383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95058345fPip5k1a : 185 bp downstream of1SNPG      A   G  GG  GGGA/G
rs33100226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95058444fPip5k1a : 86 bp downstream of1SNPA      A   C  AA  ACAA/C
rs33100229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95059978fPip5k1a : mRNA-UTR1SNPC      T      CC  C CC/T
rs33100231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95060447fPip5k1a : Intron1SNPG      C   G  GG  G  C/G
rs33101134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95060464fPip5k1a : Intron1SNPC      C   T  CC  C CC/T
rs30547687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95060896fPip5k1a : Intron2SNPCCA      A           A/C
rs51048068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95061237fPip5k1a : Intron1SNP         A           A
rs30019755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95061808fPip5k1a : Intron3SNPGGA   AA A A  GA  G AA/G
rs30359866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95061856fPip5k1a : Intron2SNP CT   T  T           C/T
rs31341813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95062417fPip5k1a : Intron2SNPTT    A  A           A/T
rs30759278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95062432fPip5k1a : Intron2SNPAAC   C  C           A/C
rs30659068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95063787fPip5k1a : Intron2SNP GA   A  A           A/G
rs33094236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95064572fPip5k1a : Intron1SNPT      T T C  TT  T TC/T
rs33094238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95064683fPip5k1a : Intron1SNPT      C   C  TC    CC/T
rs33094240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95064830fPip5k1a : Intron1SNPT      T   C  TT  TCTC/T
rs33094242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95064864fPip5k1a : Intron1SNPG      G   A  GG  GAGA/G
rs31286689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95065011fPip5k1a : Intron3SNPTTG   GG   G  TG  TGGG/T
rs30559316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95065295fPip5k1a : Intron3SNPTTC   CC C C  TC    CC/T
rs30054576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95066177fPip5k1a : Intron2SNPAAC   CC C C  AC    CA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30308568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95066282fPip5k1a : Intron3SNPAA    GG G G  AG   GGA/G
rs31337212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95066305fPip5k1a : Intron3SNPTTC   CC C C  TC  T CC/T
rs33095293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95066544fPip5k1a : Intron2SNPAA     G G G  AG    GA/G
rs52581447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067202fPip5k1a : Intron1SNP T                   T
rs52140457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067228fPip5k1a : Intron1SNP CT                  C/T
rs33096636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067474fPip5k1a : Intron1SNPG      A   A  GG  G  A/G
rs33096639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067533fPip5k1a : Intron1SNPG G    G   A  GG  GAGA/G
rs33096642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067536fPip5k1a : Intron1SNPT T    C   T  TT    TC/T
rs33097415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067863fPip5k1a : Intron1SNPC      C   T  CC  C CC/T
rs33097418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067897fPip5k1a : Intron1SNPC      T   C  CC  C  C/T
rs31234705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95067980fPip5k1a : Intron3SNPCCT   T  T C  CT    TC/T
rs31053758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95068023fPip5k1a : Intron3SNPTTC   CC C C  TC    CC/T
rs33098444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95068045fPip5k1a : Intron1SNPT      G   T  T      G/T
rs33098447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95068321fPip5k1a : Intron1SNPT T    A   T  TT  TT A/T
rs30213636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95068391fPip5k1a : Intron3SNPTTC    C       C    CC/T
rs33098451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95068526fPip5k1a : Intron1SNPT      T   C  TT  TCTC/T
rs31579178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95069454fPip5k1a : Intron3SNP TC   CC C G   C   GCC/G/T
rs33099465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95069799fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs33099467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95069885fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT T T C  TT  TCTC/T
rs33099470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95069913fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG G GGGG G   GCGC/G
rs33099472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95070123fPip5k1a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CT C/T
rs33100474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95070151fPip5k1a : Intron1SNPC CCCC G CCCC CC  CC C/G
rs30550252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95070344fPip5k1a : Intron2SNP AG   G  G           A/G
rs33100476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95070473fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT T TTCT TT  TTTC/T
rs31243022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95071130fPip5k1a : Intron3SNPAAGGGGGG GGGG AG  GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108303596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95071302fPip5k1a : Intron1SNP AT      T           A/T
rs51566256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95071482fPip5k1a : Intron1SNP TT      T       C   C/T
rs51921558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95071496fPip5k1a : Intron1SNP GG      G       A   A/G
rs46006802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95071604fPip5k1a : Intron1SNP GG      G       C   C/G
rs33100479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95072064fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA C AA A AA  A AA/C
rs33100482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95072485fPip5k1a : Coding-NonSynonymous1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs33101554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95072499fPip5k1a : Coding-Synonymous1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs31546276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95072603fPip5k1a : Intron3SNPCCGCCGCC CCCC CC  CCCC/G
rs33094225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95073765fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TC C/T
rs31738205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95073984fPip5k1a : Intron3SNPCCTTTTTC TTCC C    CCC/T
rs33094230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95074451fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AA A/G
rs33094232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95074487fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG T GGTT GG  GTTG/T
rs33095215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95074574fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs33095217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95074656fPip5k1a : Intron2SNPA A AA A ACAACAAC CAAA/C
rs30902173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95074746fPip5k1a : Intron2SNPAAG   G  G           A/G
rs30105801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95074757fPip5k1a : Intron2SNPGGA   A  A           A/G
rs30115745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95075283fPip5k1a : Intron2SNPGGA   A  A           A/G
rs52364234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95076020fPip5k1a : Intron1SNP         A           A
rs30606061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95076421fPip5k1a : Intron2SNP G    A  A           A/G
rs33862087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95076735fPip5k1a : Intron2SNP CT   T              C/T
rs33095220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95077243fPip5k1a : Intron1SNPA AAA  A AAGA AA  AAAA/G
rs30603422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95077591fPip5k1a : Intron2SNP TC   C  C           C/T
rs33095223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95078089fPip5k1a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CTCC/T
rs33096126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95079972fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG G GGCG GG  GGGC/G
rs30760659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95080655fPip5k1a : Intron3SNPTTCCCCC  CC C TC  CC C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30749996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95081596fPip5k1a : Intron3SNP GCCCCC  CC   GC  C  C/G
rs33096131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95081620fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT T TT G TT  T TG/T
rs33096133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95081634fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG G GG G GG  GTGG/T
rs33097365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95082960fPip5k1a : Intron1SNPC CCCC A CC C CC  CCAA/C
rs6226045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95083255fPip5k1a : Intron1SNP      T C            C/T
rs30401244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95083283fPip5k1a : Intron2SNPGGA   A  A           A/G
rs30660442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95083475fPip5k1a : Intron2SNPGGA   A  A           A/G
rs48676505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95083620fPip5k1a : Intron1SNP  A      A           A
rs46314602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95084825fPip5k1a : Intron1SNP GG      G           G
rs33097367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085044fPip5k1a : Intron2SNPCCCCCC G CC G CC  C GC/G
rs33097370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085193fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA G AA A AA  A GA/G
rs6262194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085286fPip5k1a : Intron2SNPT TTTTTCCTT T TT  T  C/T
rs6262312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085364fPip5k1a : Intron1SNP      T G            G/T
rs52342960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085404fPip5k1a : Intron1SNP TT      T           T
rs6263370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085516fPip5k1a : Intron1SNP      T C            C/T
rs47818731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085612fPip5k1a : Intron1SNP AA      A           A
rs31597293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95085875fPip5k1a : Intron2SNPCC    T  T           C/T
rs52223045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95086164fPip5k1a : Intron1SNP GG                  G
rs31726409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95086367fPip5k1a : Intron2SNPAAG   G              A/G
rs30808056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95086369fPip5k1a : Intron2SNPAAG   G              A/G
rs31665321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95086594fPip5k1a : Intron2SNPGGA   A              A/G
rs30706858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95086698fPip5k1a : Intron2SNPAAG   G              A/G
rs33098434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95088132fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA G AA A AA  A  A/G
rs33098436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95089060fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT C TT C  T  T CC/T
rs33098439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95089103fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT C TT T TT  T  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33098441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95089292fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA G AA A AA  A  A/G
rs31041408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95089439fPip5k1a : Intron2SNP CG   G  G           C/G
rs52196703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95090251fPip5k1a : Intron1SNP  A                  A
rs46555711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95091281fPip5k1a : Intron1SNP GA      A           A/G
rs31290051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95091565fPip5k1a : Intron2SNPC TTTTTT TT T CT  T TC/T
rs33099445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95091820fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG G GGCG GG  GGGC/G
rs33099448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95091896fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT G TTGT TT  T TG/T
rs33099450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95092172fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA A AAGA AA  AAAA/G
rs52497214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95092313fPip5k1a : Intron1SNP  C                  C
rs33099452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95093491fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG T GG G GG  GGGG/T
rs107982264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95093648fPip5k1a : Intron2SNP  A          A  A    A
rs33100325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95095391fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT T TTTC TT  TTCC/T
rs33100327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95095596fPip5k1a : Intron1SNPC CCC  C CCCC CC  CGCC/G
rs33100330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95095823fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs30151263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95096528fPip5k1a : Intron2SNPTT    T  A           A/T
rs31422393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95096564fPip5k1a : Intron3SNPCCA      A   A  C    A/C
rs30397838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95096565fPip5k1a : Intron3SNPCCA      A   A  C    A/C
rs33100333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95096721fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs33101265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95097306fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs33101267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95097603fPip5k1a : Intron1SNPG GGGG C GGGG GG  GC C/G
rs30254325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95098120fPip5k1a : Intron3SNPGGT   G  T   T  T    G/T
rs49556978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95098404fPip5k1a : Intron1SNP CC      C           C
rs33101269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95098552fPip5k1a : Intron1SNPC CCCC A CCCC CC  CCCA/C
rs31197581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95099739fPip5k1a : Intron3SNP TC      C   C  C    C/T
rs33097345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95101552fPip5k1a : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT   CCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31318484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95101594fPip5k1a : Intron3SNP  C   T  C   C  C    C/T
rs33097348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95101768fPip5k1a : Intron1SNPA GGGG G GGGG AG  GGGA/G
rs33097351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95102285fPip5k1a : Intron1SNPC  CCC C CCTC CC  C CC/T
rs33097353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95102479fPip5k1a : Intron1SNPT  TTT C TTCT TT  TCTC/T
rs265463576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95102881fPip5k1a : Intron1SNP             G  A    A/G
rs30406152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95102972fPip5k1a : Intron3SNP CT   C  T   T  T    C/T
rs247965241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95103104fPip5k1a : Intron1SNP             G  G    G
rs33098116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95103224fPip5k1a : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AA A/G
rs33098119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95104811fPip5k1a : Intron1SNPC  CCC C  CT  C   C CC/T
rs30405133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95104864fPip5k1a : Intron2SNPG GGGG G AGGG GG  GGGA/G
rs52415512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95105144fPip5k1a : Intron2SNP  C      C   C  C    C
rs33098944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95105359fPip5k1a : Intron1SNPG  GGG T GGGG G   GGGG/T
rs33098946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95105497fPip5k1a : Intron1SNPC  CCC T CCTC C   C CC/T
rs33098948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95105586fPip5k1a : Intron1SNPC  CCC T CCCC CC  C CC/T
rs33098950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95106498fPip5k1a : mRNA-UTR1SNPG  GGG G GGAG GG  G GA/G
rs33098953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95107978fPip5k1a : Locus-Region1SNPG  GGG T GGGG GG  GGGG/T
rs33099865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95108028fPip5k1a : Locus-Region1SNPT  TTT C TTCT TT  T CC/T
rs30943480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95108203fPip5k1a : Locus-Region4SNPGGAAAA G AAG AGGA AGGA/G
rs33099868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95108552fPip5k1a : Locus-Region1SNPG  GGG G GGCG G   G GC/G
rs33099870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95108619fPip5k1a : Locus-Region1SNPC  CCC T CC C C   CCCC/T
rs33099872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:95108724fPip5k1a : Locus-Region3SNPGGT T  T TTT TGGT T TG/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/19/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory