About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Zic4
zinc finger protein of the cerebellum 4
MGI:107201

74 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37134866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91362178fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Intron
Zic4 : 235 bp upstream of
1SNP                                          A    G A/G
rs38078226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91362823fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Intron
Zic4 : within coordinates of
1SNP                                          A    T A/T
rs265490887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91362863fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Intron
Zic4 : within coordinates of
1SNP                   T              A              A/T
rs29595618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91362908fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Intron
Zic4 : within coordinates of
3SNP A    T    A       A              T              A/T
rs29942544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91362909fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Intron
Zic4 : within coordinates of
2SNP A    T    T                                     A/T
rs37975369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91364541fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Coding-Synonymous
Zic4 : within coordinates of
1SNPA A A        AG                  A      A      A A/G
rs241873987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91366274fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Locus-Region
Zic4 : within coordinates of
1SNP                   T              C              C/T
rs256621858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91366330fLtw3 : within coordinates of
Zic1 : Locus-Region
Zic4 : within coordinates of
1SNP                   T              C              C/T
rs33641560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91369252fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNP  T   A    T       T              A              A/T
rs29685738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91369355fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNP  C   T    C       C              T              C/T
rs33707585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91369468fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNP  A   C    A       A              C              A/C
rs36258559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91370070fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
2SNPG G G        AA    G             GA     G      G A/G
rs30116773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91370398fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
2SNP AG   G    G                                     A/G
rs36772185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91371622fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC CCCC   A CCCC       C          C      C C    C A/C
rs30330039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91371648fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNP  G   A    G       G              A              A/G
rs33625078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91371856fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
4SNPCCT  TC  C T CC    T  C          TC       C    C C/T
rs36657941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91371918fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC C CC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs33764544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91372033fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNP CC   T    C       C              T              C/T
rs30178191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91372539fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
4SNPCCT  TC    T CC    T  C          TC       C    C C/T
rs38293376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91372541fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  A AA      AG                            G    G A/G
rs30290349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91372969fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNPGGT TTT    TTTT       G          T        T    G G/T
rs47896966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91373286fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP GA        A                                     A/G
rs36260672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91373633fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPG GGGG     GGGG       G          G        A    G A/G
rs29791176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91374093fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNP      C    T       T              C              C/T
rs38477893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91374253fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C C    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6371270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91374396fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP      T   A                                      A/T
rs36932902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91374421fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNPGGC CC     CCGG    C  G          CG       G    G C/G
rs6385378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91374701fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
2SNPC C CCC   TCC C       C          C        T    C C/T
rs36512945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91374769fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPA A  A   A A AA       A          A      A A    G A/G
rs38209953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91375704fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC CCCC     CCCC       C          C      C G    C C/G
rs52289248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91375903fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP CT        T                                     C/T
rs30381389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91375941fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
2SNP  G        C                                     C/G
rs52224036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91375943fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  G        C                                     C/G
rs30021156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91375945fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  G        C                                     C/G
rs52230724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91375983fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  A        A                                     A
rs36564263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91377544fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs52179426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91377811fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  G                                              G
rs52228627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91377813fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  A                                              A
rs13480342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91378837fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Coding-Synonymous
4SNPCCGCGGCCCGGGGCCCCGGCGCCCCCCCGGCGGCCCGGGGCG CGGGCCC/G
rs6199907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91379566fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
2SNPT  T CT   CC TT       T          T      T C    T C/T
rs6200012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91379625fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP      T   C                                      C/T
rs47199153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91380562fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  C        C                          T          C/T
rs39242129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382089fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPT   TT     TTTT       T          T      T C    T C/T
rs39013857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382400fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
2SNPG GG G   G GGGG       G          G    C G C    G C/G
rs47325361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382477fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  C        C                          A          A/C
rs49188060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382560fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  C                                   T          C/T
rs49504473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382727fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  C        C                          T          C/T
rs51784266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382761fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNP  T        T                          C          C/T
rs39100270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91382905fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC C CC     CCCC       C          C      C G    C C/G
rs39331202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91384198fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA   G A AA       A          A      A G    A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36463828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91384931fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C A    C A/C
rs38047960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91385171fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
1SNPT TTTT   C  TTT       T          T      T T    T C/T
rs33658198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91386290fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Intron
3SNPAAGAGG   G GAAA       A          A      A G    A A/G
rs29644496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91387776fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
3SNPG AGAAG  G   GG       G          G      G G    G A/G
rs36289644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91388445fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
1SNPT TTT    C   TT       T          T      T C    T C/T
rs37745750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91388636fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT   C  TTT       T          T      T T    T C/T
rs36445248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91388955fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG   G  GGG       G          G      G A    G A/G
rs36624838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389006fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT   T  TTT       T          T      T G    T G/T
rs29794357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389073fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
4SNPT TATTA  T  AAA    T  T          AA     T      T A/T
rs38054493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389082fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : mRNA-UTR
1SNPC CCCC   G  CCC       C          C      C G    C C/G
rs37382981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389609fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Locus-Region
1SNPA  AA    G   AA       A          A      A G    A A/G
rs36921815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389796fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : Locus-Region
1SNPC CCCC   G CCCC       C          C      C C    C C/G
rs36417092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389978fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 630 bp downstream of
1SNPG  G     A   GG       G          G      G      G A/G
rs48405365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389982fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 634 bp downstream of
1SNP  G        G                                     G
rs51043702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91389985fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 637 bp downstream of
1SNP  C        C                                     C
rs36827363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91390212fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 864 bp downstream of
1SNPA AAAA   G AAAA       A          A      A G    A A/G
rs38110585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91390413fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1065 bp downstream of
1SNPA AAAA   T AAAA       A          A      A T    A A/T
rs36806556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91390542fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1194 bp downstream of
1SNPT TTTT   C  TTT       T          T      T C    T C/T
rs37659399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91390721fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1373 bp downstream of
1SNPG GGGG   A  GGG       G          G      G A    G A/G
rs36299326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91390780fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1432 bp downstream of
1SNPT TTTT   G TTTT       T          T      T      T G/T
rs33694683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91391049fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1701 bp downstream of
3SNPGGAGAAG  G A GG       G          G      G G    G A/G
rs37838133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91391172fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1824 bp downstream of
1SNPA AAAA   G A AA       A          A      A G    A A/G
rs29895434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91391212fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1864 bp downstream of
3SNPAAGAG A  A GAAA       A          A      A G    A A/G
rs29695670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:91391300fLtw3 : within coordinates of
Zic4 : 1952 bp downstream of
3SNPGGAGAAG  A AGGG       G          G      G A    G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory