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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Gstt2 glutathione S-transferase, theta 2 MGI:106188 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs8257884 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75294815 | r | Gstt2 : Coding-NonSynonymous | 1 | Mixed | T | G | T | - | T | - | T | T | T | T | T | -/G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257883 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75294864 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257878 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75294897 | r | Gstt2 : Intron | 5 | Mixed | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | - | - | -/A/C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257887 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295231 | r | Gstt2 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257886 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295240 | r | Gstt2 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257885 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295264 | r | Gstt2 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3163946 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295330 | f | Gstt2 : Intron | 4 | SNP | C | C | A | A | A | A | A | A | C | C | A | A | A | C | C | A | A | C | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8257922 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295511 | r | Gstt2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8256568 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295527 | r | Gstt2 : Coding-NonSynonymous | 1 | IN-DEL | A | A | A | A | A | A | - | A | A | A | -/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257921 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295568 | r | Gstt2 : Intron | 1 | IN-DEL | - | - | - | - | - | C | C | - | - | -/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257920 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295569 | r | Gstt2 : Intron | 1 | IN-DEL | C | C | C | C | C | - | C | C | C | C | -/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257919 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295578 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257906 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295607 | r | Gstt2 : Intron | 13 | Mixed | T | T | T | T | T | T | T | - | T | T | T | T | -/A/C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257905 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295639 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257891 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295811 | r | Gstt2 : Intron | 2 | IN-DEL | C | C | C | - | C | C | C | C | C | C | C | C | -/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257890 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295812 | r | Gstt2 : Intron | 1 | IN-DEL | C | C | C | - | C | C | C | C | C | C | C | -/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257889 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295814 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257888 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295832 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33857086 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295850 | f | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs16799358 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295851 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs16799355 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75295856 | r | Gstt2 : Intron | 3 | Mixed | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | -/A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs16794271 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296049 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257892 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296096 | r | Gstt2 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs16794270 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296172 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8256566 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296307 | r | Gstt2 : Intron | 1 | IN-DEL | T | T | T | T | T | T | T | T | - | T | T | -/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs8256567 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296307 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3163947 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296325 | f | Gstt2 : Intron | 3 | SNP | G | G | T | T | T | T | T | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | T | G | T | T | T | G | G | T | T | T | T | T | G | T | G | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | G | G/T | |||
| rs8237502 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296331 | r | Gstt2 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8256565 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296351 | r | Gstt2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8256564 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296402 | r | Gstt2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8237503 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296429 | r | Gstt2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257897 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296888 | r | Gstt2 : Intron | 2 | IN-DEL | C | C | C | C | C | C | C | C | C | - | C | C | C | C | -/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257896 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296889 | r | Gstt2 : Intron | 1 | Mixed | T | T | T | T | T | T | C | T | - | T | T | T | T | -/C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257895 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296890 | r | Gstt2 : Intron | 1 | IN-DEL | G | G | G | G | G | G | G | G | - | G | G | G | G | -/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257894 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296891 | r | Gstt2 : Intron | 1 | IN-DEL | A | A | A | A | A | A | A | A | - | A | A | A | A | -/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257893 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75296929 | r | Gstt2 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257899 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75297132 | r | Gstt2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257898 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75297219 | r | Gstt2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257904 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75297429 | r | Gstt2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257903 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75297437 | r | Gstt2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8257902 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr10:75297488 | r | Gstt2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | G | C | C | C | C/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/22/2013 MGI 5.13 |
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