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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Ppox protoporphyrinogen oxidase MGI:104968 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs31543124 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173205501 | f | B4galt3 : Intron Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542263 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206146 | f | B4galt3 : Intron Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542262 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206174 | f | B4galt3 : Intron Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | A | C | A | C | A | A | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542261 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206252 | f | B4galt3 : Coding-Synonymous Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542260 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206345 | f | B4galt3 : Coding-Synonymous Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | C | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222835 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206405 | r | B4galt3 : Coding-Synonymous Ppox : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | T | A | T | T | A | A | A | A | A | T | T | A | T | T | T | T | T | T | ? | T | T | A | T | A | A | A | T | T | T | T | A | A | T | T | T | A | A | A | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A/T | |
| rs4222834 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206438 | r | B4galt3 : Coding-Synonymous Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222833 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206562 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222832 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206563 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222831 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206607 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222830 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206638 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222829 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206703 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | A | T | T | A | A | T | T | A | A | A | T | A | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222828 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206733 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222827 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206735 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4222826 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173206787 | r | B4galt3 : mRNA-UTR Ppox : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13461086 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173207617 | r | Ppox : Coding-Synonymous | 2 | SNP | A | A | A | G | A | A | G | G | A | A | G | A | G | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542258 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173207740 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542257 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173208659 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32510035 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173208680 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | T | T | T | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32154871 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173208681 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542256 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173208897 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | A | G | G | A | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542255 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173208915 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | T | C | T | T | C | T | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31542254 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173208948 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | C | A | C | C | A | C | C | A | C | A | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541523 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209015 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541522 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209045 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs6360112 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209061 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541521 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209515 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | G | A | A | G | G | G | G | A | A | A | A | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541520 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209637 | f | Ppox : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541519 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209649 | f | Ppox : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | C | A | A | A | C | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541518 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209650 | f | Ppox : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | C | T | C | C | C | C | C | T | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541517 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209667 | f | Ppox : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541516 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209700 | f | Ppox : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | C | T | C | T | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541515 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209825 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31541514 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209898 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | A | T | A | A | A | A | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540573 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173209911 | f | Ppox : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | G | A | G | G | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540572 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173210063 | f | Ppox : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | C | T | T | C | T | T | C | C | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540571 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173210181 | f | Ppox : Intron Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | C | C | C | C | T | T | C | T | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540570 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173210288 | f | Ppox : Coding-Synonymous Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | A | G | G | G | G | A | A | G | A | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540569 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173210390 | f | Ppox : Intron Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | C | C | C | C | T | T | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13461085 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173210585 | r | Ppox : Coding-Synonymous Usp21 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540568 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211028 | f | Ppox : mRNA-UTR Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540567 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211141 | f | Ppox : mRNA-UTR Usp21 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A | T | A | T | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31549467 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211192 | f | Ppox : mRNA-UTR Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32793002 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211244 | f | Ppox : mRNA-UTR Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540566 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211285 | f | Ppox : mRNA-UTR Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30597151 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211342 | f | Ppox : Locus-Region Usp21 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | A | G | G | A | A | G | G | A | A | A | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540565 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211493 | f | Ppox : Locus-Region Usp21 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31540564 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211748 | f | Ppox : Locus-Region Usp21 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | A | G | A | A | G | G | A | A | G | G | G | A | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31539653 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:173211785 | f | Ppox : Locus-Region Usp21 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | A | G | A | G | G | A | G | A | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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