About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Ppox
protoporphyrinogen oxidase
MGI:104968

71 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31452404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171274669fB4galt3 : Intron
Lootl : within coordinates of
Ppox : 1321 bp downstream of
6SNPTTGGTTG  G TGG     G   G          TT       G    G G/T
rs31543124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171275370fB4galt3 : Intron
Lootl : within coordinates of
Ppox : 620 bp downstream of
1SNPG GGGG   G GGGC        G          G      G G    G C/G
rs31542263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276015fB4galt3 : Intron
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGA        G          G      G G    G A/G
rs31542262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276043fB4galt3 : Intron
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
2SNPA  CA C  C AAC         C                        C A/C
rs31542261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276121fB4galt3 : Coding-Synonymous
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCT        C          C      C C    C C/T
rs31542260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276214fB4galt3 : Coding-Synonymous
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
5SNPTTTCTTC  C TTCT    T   C          TT     T C    T C/T
rs4222835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276274rB4galt3 : Coding-Synonymous
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
6SNPTTTATTAAAAATTATTTTTT?TTATAAATTTTAATTTAAATTT TTTTTTA/T
rs4222834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276307rB4galt3 : Coding-Synonymous
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
1SNP  C CCC  C C        T C                           C/T
rs4222833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276431rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
1SNP  G GGG  G G        A G                           A/G
rs4222832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276432rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
1SNP  T TTT  T T        C T                           C/T
rs4222831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276476rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : within coordinates of
1SNP  G GGG  G G        A G                           A/G
rs4222830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276507rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
1SNP  A AAA  A A        G A                           A/G
rs4222829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276572rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
6SNPTTTATTA  A TTAA    TA TA          TT     T      T A/T
rs4222828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276602rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
1SNP  G GGG  G G        A G                           A/G
rs4222827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276604rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
1SNP  A AAA  A A        G A                           A/G
rs4222826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276656rB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
1SNP  C CCC  C C        A C                           A/C
rs108338266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276849fB4galt3 : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
2SNP      G    T                                      G/T
rs51163368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276946fB4galt3 : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
4SNP TT   C    T       T               T              C/T
rs46083096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171276951fB4galt3 : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
4SNP TT   C    T       T               T              C/T
rs45898760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171277029fB4galt3 : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ppox : mRNA-UTR
4SNP GG   T    G       G               G              G/T
rs13461086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171277486rLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
6SNPAAAGAAG  G AAGA    A   G          AA     A      A A/G
rs31542258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171277609fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G      A A/G
rs47735277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171277659fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
4SNP GG   A    G       G               G              A/G
rs31542257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278528fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
1SNPC CTCC     CC C        T          C      C C    C C/T
rs32510035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278549fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
3SNPTTT   G    T                                      G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32154871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278550fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
3SNPTTT   A    T                                      A/T
rs31542256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278766fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
5SNPGG AGGA  A GGAG    G   A          GG     G G    G A/G
rs31542255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278784fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
5SNPTT CTTC  C TTCT    T   C          TT              C/T
rs31542254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278817fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
5SNPCC ACCA  A CCAC    C   A          CC     C      C A/C
rs31541523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278884fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
2SNPG  GGG   G GAGG    A   G          GG     G G    G A/G
rs31541522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278914fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
2SNPG  GGG   G GAGG    A   G          GG     G      G A/G
rs6360112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278930fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
1SNP      C   T                                       C/T
rs49921132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171278982fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
3SNP T    A    T       T               T              A/T
rs31541521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279384fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
5SNPGGAAGGA  G GAAA    A   A          GG     G      A A/G
rs49436053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279420fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
2SNP TC        T       C               T              C/T
rs31541520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279506fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG   G GGGG        G          A      A G    G A/G
rs31541519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279518fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
5SNPAACCA C  A A C     C   C          AA              A/C
rs31541518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279519fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-NonSynonymous
3SNPCCTCCC   C CTCT    T   C          CC              C/T
rs31541517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279536fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
4SNPCCCTCCT  C C T     C   T          CC     C        C/T
rs51550152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279539fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
3SNP CT   T    C       T               C              C/T
rs31541516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279569fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
5SNPCCCTCCT  C CCTC    C   T          CC     C T    C C/T
rs31541515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279694fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
1SNPT TTTT   C TTTT        T          T      T      T C/T
rs49536069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279707fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
4SNP AG   G    A       G               A              A/G
rs31541514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279767fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
5SNPAAATA T  A AATT    A   T          AA            T A/T
rs31540573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279780fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
5SNPGGGAGGA  A GGAA    G   A          GG            A A/G
rs107874737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279836fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
1SNP      A    G                                      A/G
rs31540572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171279932fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
5SNPT TCTTC  C TTCC    T   C          TT     T      C C/T
rs31540571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280050fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
4SNPC TTCCT  C CTTC    T   T          CC     C T    C C/T
rs107963789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280073fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
2SNP      A    T       A               T              A/T
rs31540570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280157fLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
3SNPG AAGGA  G GAAG        A          G      G      G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31540569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280259fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
4SNPC TTCCT  C CTTC    T   T          CC     C      C C/T
rs13461085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280454rLootl : within coordinates of
Ppox : Coding-Synonymous
4SNPGGAGGGG  G GAGG    A   G          GG     G G    G A/G
rs48160557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280570fLootl : within coordinates of
Ppox : Intron
1SNP GG                                               G
rs31540568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171280897fLootl : within coordinates of
Ppox : mRNA-UTR
2SNPGGGGGG   A GGGA        G          G      G G    A A/G
rs31540567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281010fLootl : within coordinates of
Ppox : mRNA-UTR
6SNPAAATAAT  A AATA    A   T          AA     A A    A A/T
rs31549467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281061fLootl : within coordinates of
Ppox : mRNA-UTR
5SNP TT   A    T       T               T              A/T
rs32793002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281113fLootl : within coordinates of
Ppox : mRNA-UTR
1SNP TT   G    T                                      G/T
rs31540566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281154fLootl : within coordinates of
Ppox : mRNA-UTR
1SNPT TTTT   C TTTT        T          T      T      T C/T
rs30597151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281211fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
6SNPGGGAGGA  A GGAA    G   A          GG   A G      A A/G
rs31540565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281362fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
1SNPC CCCC   T CCCT        C          C      C C    T C/T
rs31540564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281617fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
6SNPAAAGAAG  G AAGG    A   G          AA     A A    G A/G
rs31539653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281654fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
6SNP GGAG A    GGAG    G   A           G              A/G
rs32805378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281743fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
5SNP TC   C    T       C               T              C/T
rs31539652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281752fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
6SNPAAAGAAG  A AAGA    A   G          AA     A      A A/G
rs31539651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281765fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
1SNPT TTTT   G TTTG        T          T      T T    G G/T
rs31539650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171281899fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
1SNPA AAAA   G AAA         A          A      A A      A/G
rs31539649
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171282209fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : mRNA-UTR
3SNPC GGCCG  G CGGG        G          C      C G    G C/G
rs31539648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171282335fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
1SNPG GGGG   C GGGG        G          G      G G    G C/G
rs31539647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171282389fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
1SNPG GGGG   A GGGG        G          G      G G    G A/G
rs30565330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171282895fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Intron
6SNPA CCAAC  C ACCC    C   C          AA     A      C A/C
rs31539646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:171283067fLootl : within coordinates of
Ppox : Locus-Region
Usp21 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG   A GGGA        G          G      G G    A A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory