About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Tfap2a
transcription factor AP-2, alpha
MGI:104671

43 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47141179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40713764frul : within coordinates of
Tfap2a : 1911 bp downstream of
1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
rs48488041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40713802frul : within coordinates of
Tfap2a : 1873 bp downstream of
1SNPT TTTT ATTAT TT  TATA/T
rs48756840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40713886frul : within coordinates of
Tfap2a : 1789 bp downstream of
1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs49837286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40713910frul : within coordinates of
Tfap2a : 1765 bp downstream of
1SNPC CCCC CCCCC CC  CACA/C
rs252350874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40715801frul : within coordinates of
Tfap2a : mRNA-UTR
1SNP            C  A    A/C
rs107902225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40715802frul : within coordinates of
Tfap2a : mRNA-UTR
2SNP  A     G   A  G    A/G
rs29806420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40716015frul : within coordinates of
Tfap2a : mRNA-UTR
3SNPT C   T T   C  T    C/T
rs52634687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40718681frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  C     G           C/G
rs29551762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40719715frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
2SNP  G   A     G  A    A/G
rs29237355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40720242frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
3SNPTTC   T T   C  T    C/T
rs236288700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40720270frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP            C  G    C/G
rs29777720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40720361frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
3SNPC T   C C   T  C    C/T
rs29241396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40721291frul : within coordinates of
Tfap2a : Coding-Synonymous
3SNPGGA     G   A  G    A/G
rs49539889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40723240frul : within coordinates of
Tfap2a : Coding-Synonymous
1SNP  TTTT T TCT TT  TCTC/T
rs48695602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40723694frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  CCCC C C C CC  CACA/C
rs50839287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40723842frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  CCCC   C C CC   TCC/T
rs47353452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40724414frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  TTTT   T T TT  TGTG/T
rs47926650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40724998frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  GGGG   GCG GG  GCGC/G
rs47779049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40725183frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  GGGG G G G GG  GAGA/G
rs49055452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40725545frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  CCCC   C C CC   GCC/G
rs50955976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40726130frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  AAAA   A A AA   TAA/T
rs29241938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40726679frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
3SNP CT   C C   T  C    C/T
rs47487080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727052frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  CCCC   C C CC   TCC/T
rs49441874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727156frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  AAAA   A A AA   CAA/C
rs52587373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727447frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
2SNP  C     T   C  T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29960002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727453frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
2SNP TC   T T           C/T
rs29714248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727457frul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP TC   T T           C/T
rs51641045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727894fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP   TTT   T T TT   C C/T
rs29710917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40727904fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
4SNP CTTTTC CT TTTTC  CTC/T
rs49025496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40728393fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Coding-Synonymous
1SNP  CCCC   C C CC   TCC/T
rs29587448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40729342fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
2SNP TG   T T           G/T
rs29914277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40729893fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
3SNP  A   T T   A  TA   A/T
rs52630198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40730424fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : mRNA-UTR
Tfap2a : Intron
1SNP C                  C
rs52646002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40730447fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
Tfap2a : Locus-Region
1SNP AA     A           A
rs52624896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40730448fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
Tfap2a : Intron
1SNP AA     A           A
rs52622354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40730461fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
Tfap2a : Intron
1SNP A      A           A
rs52655944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40730487fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
Tfap2a : Intron
1SNP A                  A
rs107835449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40730710fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
Tfap2a : Intron
1SNP GG     G           G
rs29226856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40731440fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
Tfap2a : Intron
2SNP      C T   C  T    C/T
rs52628075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40732558fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  C                 C
rs108068058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40732590fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Intron
1SNP  C     C           C
rs29495805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40734430fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
3SNPTT    C T   C  T    C/T
rs241835660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:40734677fGm26688 : within coordinates of
rul : within coordinates of
Tfap2a : Locus-Region
1SNP            C  G    C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/23/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory