About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Lep
leptin
MGI:104663

116 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29598988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29008466fLep : Locus-Region1SNPG GGGG  A GGGG    G            A G A/G
rs29598990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29008814fLep : Locus-Region1SNPA AAAA  C AAAA    A        C   CAA A/C
rs29598992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009013fLep : Locus-Region1SNPG GGGG  T GGGG    G        T   TGG G/T
rs29599924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009042fLep : Locus-Region1SNPC CCCC    CCCC    C        A   ACC A/C
rs29599926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009396fLep : Locus-Region1SNPT TTTT  T TTTT    T        C   CTT C/T
rs29599928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009712fLep : Locus-Region1SNPC CCCC  C CCTC    C        C   CTC C/T
rs29599930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009758fLep : Locus-Region1SNPG GGGG  G GGAG    G        G   G G A/G
rs29599932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009760fLep : Locus-Region1SNPT TTTT  T TT T    T        C   C T C/T
rs29600834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009809fLep : Locus-Region1SNPC CCCC  T CCCC    C        C   CCC C/T
rs29600836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29009991fLep : Locus-Region1SNPG GGGG  G GGGG    G        A   AGG A/G
rs29600838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29010057fLep : Locus-Region1SNPT TTTT  C TTCT    T        C   C T C/T
rs29600840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29010349fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTTT    T        C   CTT C/T
rs29600842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29010536fLep : Intron1SNPA AAAA  T AAAA    A        A   AAA A/T
rs29601664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29010625fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        A    GA A/G
rs29601666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29010646fLep : Intron1SNPT TTTT  T TTCT    T        T   TCT C/T
rs29601668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011086fLep : Intron1SNPC CCCC  C CCCC    C        C   CTC C/T
rs29601670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011093fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   A A A/G
rs29601672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011178fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   TCT C/T
rs29602644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011213fLep : Intron1SNPA AAAA     A               G   GG  A/G
rs29602646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011219fLep : Intron1SNPC CCCC  G CCGC    C        C   C C C/G
rs29602648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011257fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   AGA A/G
rs29602650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011266fLep : Intron1SNPG GGGG  G GGGG    G        A   AGG A/G
rs29602652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011325fLep : Intron1SNPG GGGG  C GGCG    G        G   GCG C/G
rs29603524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011389fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT             C   CCT C/T
rs29603526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011421fLep : Intron1SNPA AAAA  A AACA    A        A   AAA A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29603528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011488fLep : Intron1SNPC CCCC  C CCCC    C        C   CTC C/T
rs29603530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011491fLep : Intron1SNPG GGGG  G GGGG    G        T   TGG G/T
rs29603532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011583fLep : Intron1SNPT TTTT    TTCT    T        T    CT C/T
rs29604424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011649fLep : Intron1SNPC CCCC  C CCTC    C        C   CTC C/T
rs29604426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011720fLep : Intron1SNPG GGGG  A GGGG    G        G   GGG A/G
rs29604428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011843fLep : Intron1SNPG GGGG  A GGAG    G        G   GAG A/G
rs29604430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29011885fLep : Intron1SNPG GGGG  G GGTG    G        G   GTG G/T
rs29604432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29012007fLep : Intron1SNPA AAAA  C AACA    A        A   ACA A/C
rs29605334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29012039fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        G   GGA A/G
rs29605336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29012133fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAAA    A        A   AAA A/G
rs29605338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29012187fLep : Intron1SNPG GGGG  G GGAG    G        G   GAG A/G
rs29605340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29012378fLep : Intron1SNPG GGGG  A GGAG    G        G   GAG A/G
rs29605342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29012613fLep : Intron1SNPT TTTT  G TTGT    T        G   GGT G/T
rs29606254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29013464fLep : Intron1SNPG GGGG  T GGGG    G        G   GGG G/T
rs29606256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29013556fLep : Intron1SNPC CCCC    CCTC    C        C   CTC C/T
rs29606258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29014103fLep : Intron1SNPA AAAA  A AAGA    A        A   AGA A/G
rs29606260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29014638fLep : Intron1SNPG GGGG  G GGGG    G        G   GAG A/G
rs29606262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29014757fLep : Intron1SNPG GGGG  G GGGG    G        A    GG A/G
rs29598434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29014914fLep : Intron1SNPC CCCC  T CCTC    C        T   TTC C/T
rs6178485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29015173fLep : Intron1SNP      G  T                         G/T
rs6179374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29015300fLep : Intron2SNPG GGGGG AAGGAG    G        A   AAG A/G
rs6193072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29015574fLep : Intron2SNPA AAAAA CCAACA    A        C   CCA A/C
rs6193498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29015628fLep : Intron1SNP      G  T                         G/T
rs6193960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29015699fLep : Intron2SNP  CCCCC CTCCTC    C        T   TTC C/T
rs29598439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016044fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   T T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29598441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016059fLep : Intron1SNPT TTTT  T TTGT    T        T   TGT G/T
rs29598443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016291fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        G   G A A/G
rs29599685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016336fLep : Intron1SNPT TTTT  C TT T    T        C   C T C/T
rs29599687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016423fLep : Intron1SNPC CCCC    CCCC    C        A   ACC A/C
rs29599689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016549fLep : Intron1SNPC CCCC  C CCCC    C        T   TCC C/T
rs29599691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29016576fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   TCT C/T
rs29599693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29017178fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAAA    A        A   AAA A/G
rs30127691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29017344fLep : Intron1SNP GG   A   G                        A/G
rs29967393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29017397fLep : Intron1SNP CC   T   C                        C/T
rs30356087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29017504fLep : Intron1SNP AA   G   A                        A/G
rs29600555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29017704fLep : Intron1SNPG GGGG  A GGGG    G        G   GGG A/G
rs29600557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29018309fLep : Intron2SNPGGGGGGT G GGGG             T   TGG G/T
rs29600559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29018684fLep : Intron1SNPG GGGG  C GGCG    G        G   GCG C/G
rs29600561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29018710fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   AGA A/G
rs29600563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29018835fLep : Intron1SNPG GGGG  A GGAG    G        G   GAG A/G
rs29601315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29018891fLep : Intron1SNPC CCCC  C CCTC    C        C   CTC C/T
rs29601317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019152fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   TCT C/T
rs29601319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019223fLep : Intron1SNPC CCCC  T CCTC    C        C   C C C/T
rs29601321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019238fLep : Intron1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   AGA A/G
rs29601323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019261fLep : Intron1SNPT TTTT  A TTAT    T        T   TAT A/T
rs13478682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019300fLep : Intron1SNP   T   A      ATAT AATTATTAATTTA  TA/T
rs29602325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019300fLep : Intron2SNPTTTTTTA   TT T    T        A   A T A/T
rs29602327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019305fLep : Intron1SNPC CCCC  T CCTC    C        C   CTC C/T
rs30804201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019384fLep : Intron1SNP TT   C   T                        C/T
rs29602329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019595fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   TCT C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29602331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019619fLep : Intron1SNPT TTTT    TTCT    T        T   T T C/T
rs29602333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019780fLep : Intron1SNPG GGGG    GGGG    G        G   GGA A/G
rs29603265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019875fLep : Intron2SNPTTT T C T TT      T        C   CT  C/T
rs29603267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019884fLep : Intron2SNPGGGGGGA G G GG    G        A   AGG A/G
rs29603269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29019971fLep : Intron1SNPG GGGG  G GG G    G        T   T G G/T
rs29603271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020006fLep : Intron1SNPC CCCC  T CCTC    C        C   CTC C/T
rs29603273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020170fLep : Intron1SNPG GGGG  A GG G    G        G   GAG A/G
rs29604215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020231fLep : Intron1SNPT TTTT  A TTAT    T        T   TAT A/T
rs29604217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020309fLep : Intron1SNPC CCCC  T CCTC    C        C   CTC C/T
rs29604219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020357fLep : Intron1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   TCT C/T
rs29604221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020492fLep : Intron1SNPG GGGG    GGAG    G        G   GAG A/G
rs29604223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020605fLep : Intron1SNPC CCCC  T CC C    C        C   C C C/T
rs29605215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020651fLep : Intron1SNPC CCCC  T CCTC    C        C   CTC C/T
rs29605217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020698fLep : Intron1SNPG GGGG  A GGAG    G        G   GAG A/G
rs29605219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29020749fLep : Intron1SNPT TTTT  G TTGT    T        G   GGT G/T
rs29605221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021183fLep : mRNA-UTR1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   AGA A/G
rs29605223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021210fLep : mRNA-UTR1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   AGA A/G
rs29606085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021431fLep : mRNA-UTR1SNPG GGGG    GGAG    G        G   GAG A/G
rs29606087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021499fLep : mRNA-UTR1SNPC CCCC  A CCCC    C        C   CCC A/C
rs29606089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021514fLep : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGAG    G        G   GAG A/G
rs30711807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021668fLep : mRNA-UTR1SNP G    C   G                        C/G
rs29606091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021754fLep : mRNA-UTR2SNPGGGGGGA G GGGG             A   A G A/G
rs29606092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021832fLep : mRNA-UTR2SNPAAAAAAC   AACA    A        C   CCC A/C
rs29607064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021904fLep : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGGG    G        G   GAG A/G
rs29607066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29021931fLep : mRNA-UTR1SNPA AAAA  C AACA    A        A   ACA A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29607068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022134fLep : mRNA-UTR1SNPA AAAA  A AAGA    A        A   AGA A/G
rs29598424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022274fLep : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGAG    G        G   GAG A/G
rs29598426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022500fLep : mRNA-UTR1SNPT TTTT  C TTCT    T        T   TCT C/T
rs29598428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022733fLep : mRNA-UTR2SNPGGGGGGA G GGGG    G        A   AGG A/G
rs29598430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022794fLep : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGGG    G        G   GGG A/G
rs29598432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022865fLep : mRNA-UTR1SNPA AAAA  C AACA    A        A   ACA A/C
rs30417967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022945fLep : mRNA-UTR1SNPG     A   G                        A/G
rs29870521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022946fLep : mRNA-UTR1SNPG     A   G                        A/G
rs29876486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022951fLep : mRNA-UTR1SNPG     C   G                        C/G
rs30313609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29022952fLep : mRNA-UTR1SNPG     A   G                        A/G
rs29599394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29023154fLep : mRNA-UTR1SNPC CCCC  T CCTC    C        C   C C C/T
rs29599396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29023173fLep : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGAG    G        G   G G A/G
rs29599398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29023870fLep : mRNA-UTR1SNPC CCCC    CC C    C        T   TCC C/T
rs29599400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29023877fLep : Locus-Region1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   A A A/G
rs29599402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29024058fLep : Locus-Region1SNPA AAAA  C AACA    A        A   ACA A/C
rs29599403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:29024110fLep : Locus-Region1SNPA AAAA  G AAGA    A        A   AGA A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory