About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Rpia
ribose 5-phosphate isomerase A
MGI:103254

125 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36732209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70713715fRpia : Locus-Region1SNPT  CTT   T TCCCTTTC/T
rs36434139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70713734fRpia : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs39228543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70713753fRpia : Locus-Region1SNPA AAAA   AACAAAAAAA/C
rs37893757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70713833fRpia : Locus-Region1SNPG GGGG   GGAGGGGGGA/G
rs38371571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70713852fRpia : Locus-Region1SNPA AAAA   AAGAAAAAAA/G
rs38054439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70713962fRpia : Locus-Region1SNPC CCCC   CCCCCCCACA/C
rs36242940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70714636fRpia : Locus-Region1SNPC CCCC C CCACCCCCCA/C
rs38196638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70714877fRpia : Locus-Region1SNPC CTCC C CCCTCTCCCC/T
rs37014661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70714890fRpia : Locus-Region1SNPA AAAA A AACAAAAAAA/C
rs38077576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70714933fRpia : Locus-Region1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs6227761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70714950fRpia : Locus-Region1SNP      C T         C/T
rs39696968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715283fRpia : Locus-Region1SNPC CCCC C CCACCCCCCA/C
rs37300907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715335fRpia : Locus-Region1SNPA AAAA G AAGAAAAAAA/G
rs38112265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715391fRpia : Locus-Region1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs38674418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715418fRpia : Locus-Region1SNPG GGGG A GGAGGGG AA/G
rs38234220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715600fRpia : Locus-Region1SNPC C CC C CCTCCCCTCC/T
rs36871946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715655fRpia : Locus-Region1SNPA A AA G AAGGAGAGAA/G
rs36900134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715684fRpia : Locus-Region1SNPG G G  C GGCCGCGCGC/G
rs37715918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715703fRpia : Locus-Region1SNPA AGA  A AA GAGAAAA/G
rs36516307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715718fRpia : mRNA-UTR1SNPA AAAA A AAAAAAAGAA/G
rs38472685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715747fRpia : mRNA-UTR1SNPC CCC  T CCCCCCCCCC/T
rs37598343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715787fRpia : mRNA-UTR1SNPA AGAA A AAGGAGAAAA/G
rs38253320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70715975fRpia : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGGGGGGTGG/T
rs38451893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716050fRpia : mRNA-UTR1SNPA AGA  G AAGGAGAGAA/G
rs37933796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716385fRpia : mRNA-UTR1SNPA AAAA A AAAAAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37717183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716448fRpia : mRNA-UTR1SNPG GGG  A GGGGGGGGGA/G
rs37533131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716501fRpia : mRNA-UTR1SNPT TCT    TTCCTCTCTC/T
rs37391097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716526fRpia : mRNA-UTR1SNPG GGG  G GGGGGGGGAA/G
rs36475826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716707fRpia : Intron1SNPC CCC  C CCCCCCCCGC/G
rs37022075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70716900fRpia : Intron1SNPA A A  A AAGGAGAAAA/G
rs36306652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70717525fRpia : Intron1SNPC CTC  C CCTTCTCCCC/T
rs37013878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70717615fRpia : Intron1SNPT TATT A  TAATATATA/T
rs37892210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718098fRpia : Intron1SNPT TCT  C TTCCTCTCTC/T
rs37560384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718412fRpia : Intron1SNPA ACA  C AACCA AAAA/C
rs36583639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718432fRpia : Intron1SNPA AAA  A AACAAAAAAA/C
rs36417474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718484fRpia : Intron1SNPC CTC  C CCCTCTCCCC/T
rs38103568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718643fRpia : Intron1SNPG GGG  A GGGGGGGA A/G
rs36485927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718706fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGGGGGGCGC/G
rs37470999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718719fRpia : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs37200163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718765fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGGGGGGAGA/G
rs38645262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718766fRpia : Intron1SNPG GTG  T GGTTGTGGGG/T
rs38169047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70718927fRpia : Intron1SNPG GAG  G GGAAGAGGGA/G
rs36540326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70719008fRpia : Intron1SNPC CCC  C  CTCCCCCCC/T
rs37466123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70719031fRpia : Intron1SNPC CGC  G CCGGCGCGCC/G
rs37639134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70719161fRpia : Intron1SNPG GGG  A GGGGGGGGGA/G
rs37132828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70719201fRpia : Intron1SNPA AGAA G AAGGAGAAAA/G
rs36312349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70719915fRpia : Intron1SNPA A A  G AAGGAGAAAA/G
rs37218619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70719931fRpia : Intron1SNPC CCC  C CCCCCCCTCC/T
rs37405208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720031fRpia : Intron1SNPT TCT  C  T CTCT TC/T
rs37874193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720033fRpia : Intron1SNPT T T     TCTT TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37352637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720411fRpia : Intron1SNPT TTT  C TTTTTTTTTC/T
rs36919786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720499fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGAGGGGAGA/G
rs37757308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720517fRpia : Intron1SNPC CCC  T  CCCCCCCCC/T
rs36795130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720623fRpia : Intron1SNPT TTT  G TTTTTTTTTG/T
rs37715123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720635fRpia : Intron1SNPC CCC  C CCCCCCCTCC/T
rs38255422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720774fRpia : Intron1SNPA AGAA G AAGGAGAGAA/G
rs37007098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70720873fRpia : Intron1SNPT TTT  C TTTTTTTTTC/T
rs38184670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721103fRpia : Intron1SNPT TCT  C  TCCTCTCTC/T
rs37338141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721215fRpia : Intron1SNPC CCC  C  CGCCCCCCC/G
rs38478743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721244fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGGGGGGAGA/G
rs37893139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721247fRpia : Intron1SNPC CCC  C CCGCCCC CC/G
rs36862412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721355fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGGGG GGAA/G
rs37506690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721363fRpia : Intron1SNPC CGC    CCGGC CC C/G
rs36493979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721369fRpia : Intron1SNPC C C  A  C CC CC A/C
rs36813360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721444fRpia : Intron1SNPT TCT  C TTCCTCTTTC/T
rs36977991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721493fRpia : Intron1SNPT TCT  C TTCCTCTTTC/T
rs36930594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721591fRpia : Intron1SNPT TCT  T TTTCTCTTTC/T
rs37424266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721660fRpia : Intron1SNP  A A    AAG A AAAA/G
rs37680670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721813fRpia : Intron1SNPC CCC  G CCGCCCCCCC/G
rs36629234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721890fRpia : Intron1SNPC CCC     CTC  CCCC/T
rs37828615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70721932fRpia : Intron1SNPC CCC  G CCGCCCCCCC/G
rs36603165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70722574fRpia : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTTTC/T
rs37005015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70723870fRpia : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGGGA/G
rs38499689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724097fRpia : Intron1SNPA AAA  G AAAAAAAAAA/G
rs36482236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724196fRpia : Intron1SNPG GGG  A GGGGGGGGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37045056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724268fRpia : Coding-Synonymous1SNPA AAA  G AAGAAAAAAA/G
rs36720189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724373fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGAGGGGGGA/G
rs37489261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724384fRpia : Intron1SNPA AAA  G AAGAAAAAAA/G
rs36952219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724580fRpia : Intron1SNPG GAGG G GGGAGAGGGA/G
rs38176060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724658fRpia : Intron1SNPA AAA  G AAAAAAAAAA/G
rs36495692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724863fRpia : Intron1SNPT T T  C  TCTTT T C/T
rs36787030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70724952fRpia : Intron1SNPG GGG  G GGAGGGGGGA/G
rs38056249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70726455fRpia : Intron1SNPC CCC  C CCCCCCCCTC/T
rs37702944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70726801fRpia : Intron1SNPT TTT  C TTCTTTTTTC/T
rs36532796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70727094fRpia : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCCCC/T
rs37363215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70727888fRpia : Intron1SNPT TCTT T TTTCTCTTTC/T
rs37877658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70727896fRpia : Intron1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs36801579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70727906fRpia : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs38165176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70728003fRpia : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAGAA/G
rs30264908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70730027fRpia : Intron1SNP CT   C  C        C/T
rs36785132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70732936fRpia : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs38551753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70733021fRpia : Intron1SNPT TTTT G TT TT T GG/T
rs37195793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70733522fRpia : Intron1SNPC C CC T CT TC    C/T
rs36277357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70734778fRpia : Intron1SNPG G GG G G  AG G GA/G
rs36887173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70734853fRpia : Intron1SNPG G GG T G  TG G  G/T
rs37219576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70735241fRpia : Intron1SNP  T TT C T  C  T  C/T
rs37732147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70735336fRpia : Intron1SNPA AAAA G AG GA A  A/G
rs36316796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70735736fRpia : Intron1SNPA G GG G GA AG G  A/G
rs36605732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70736379fRpia : Intron1SNPC CCCC T CC CC C  C/T
rs37105592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70736677fRpia : Intron1SNP  G GG A G  GG G  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36381416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70737957fRpia : Intron1SNPA A AA A A  GA A AA/G
rs39451902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70738071fRpia : Intron1SNPT TTTT T T  C  T TC/T
rs37471363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70738155fRpia : Intron1SNPT T TT C TT TT T CC/T
rs36453579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70738471fRpia : Intron1SNPG GGGG A GG GG G  A/G
rs36540598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70738479fRpia : Intron1SNP  C CC C CA AC C  A/C
rs36301543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70738546fRpia : Intron1SNP  G GG   G  TG G  G/T
rs37885994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739315fRpia : Intron1SNPG GGGG C GC CG G  C/G
rs36708518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739420fRpia : Intron1SNP  G GG A GG GG G  A/G
rs38744835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739433fRpia : Intron1SNPA AAAA G A  GAAA  A/G
rs38783253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739456fRpia : Intron1SNPT TTTT C TC CT T  C/T
rs38408395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739493fRpia : Intron1SNP  C CC T CC CC C  C/T
rs36416999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739566fRpia : Intron1SNPG GGGG G GA AG G GA/G
rs36805331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739625fRpia : Intron1SNPC CCCC T CC CC C  C/T
rs36359625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70739871fRpia : Intron1SNP  G GG G GA AG G  A/G
rs37988356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70740089fRpia : Intron1SNP  A AA A A  CA A  A/C
rs36757623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70740330fRpia : Intron1SNP  C CC T C  CC C TC/T
rs39015963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70740550fRpia : Intron1SNPT T TT C T  CT T  C/T
rs36595083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70740832fRpia : Intron1SNP  T TT A T  T  T  A/T
rs38326802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70741084fRpia : Intron1SNP  C CC A C  C  C  A/C
rs36273580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70741255fRpia : Intron1SNP  T TT C T  TT T  C/T
rs36240312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70741282fRpia : Intron1SNP  A AA G A  AA A  A/G
rs37201371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70741405fRpia : Intron1SNPA A AA G AA AA A  A/G
rs36503509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70741493fRpia : Intron1SNP    T  C    T     C/T
rs37684263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70741874fRpia : Intron1SNP  G GG A G  GG G  A/G
rs37285013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:70742451fRpia : Locus-Region1SNPA A AA G AA AA A  A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory