About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Cdc25a
cell division cycle 25A
MGI:103198

59 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30377513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109776479fCdc25a : Locus-Region1SNPA G   G                                          A/G
rs30220220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109778180fCdc25a : mRNA-UTR1SNPT     T    C                                     C/T
rs30427001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109778319fCdc25a : mRNA-UTR1SNPG C   G    C                                     C/G
rs6192052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109779002fCdc25a : Intron1SNP      A   G                                      A/G
rs6192640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109779124fCdc25a : Intron1SNP      T   A                                      A/T
rs6193209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109779244fCdc25a : Intron1SNP      A   T                                      A/T
rs6193706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109779345fCdc25a : Intron1SNP      C   T                                      C/T
rs13480413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109779489fCdc25a : Intron2SNPCCGGGGCCCCCGCCGCCGCGCCCGCCCCCGCGCCGCGCCGCC GGCGCCC/G
rs29993806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109779516fCdc25a : Intron1SNPAAA   G    A                                     A/G
rs29927425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109780530fCdc25a : Intron2SNPGGGGGGC  G GGGG       G          C      G      C C/G
rs51037258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109780670fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs49739207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109780780fCdc25a : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   T CCTC       C          C      C T    C C/T
rs48384893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109781174fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   C GGCG       G          G      G C    G C/G
rs47959883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109781393fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs51214378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109781409fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       C          G      G G    G C/G
rs50466659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109781595fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs48268454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109781858fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   C AACA       A          A      A C    A A/C
rs46520311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109782033fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs33897340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109782397fCdc25a : Coding-NonSynonymous2SNPCCAAAA   C ACCA       C          C      C C    C A/C
rs45768481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109782490fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   G TTGT       T          T      T G    T G/T
rs52029703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109782517fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs51067277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109782638fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs47800101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109782926fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs50995420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109783740fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs51088980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109783964fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C      C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46220089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784025fCdc25a : Coding-NonSynonymous1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs48439994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784088fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs50928572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784457fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs45914621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784502fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs47242213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784534fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   C AACA       A                 A C    A A/C
rs51867233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784601fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs49412672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784821fCdc25a : Intron1SNPC CCCC   G CCGC       C          C      C G    C C/G
rs50500294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784842fCdc25a : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C          C      C A    C A/C
rs48828767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109784960fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs51829552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109785746fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs47057121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109785865fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs49378559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786182fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   C AACA       A          A      A C    A A/C
rs46143048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786341fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       G          T      T T    T G/T
rs47204582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786403fCdc25a : Intron1SNPA AAA    T AATA       A          A      A T    A A/T
rs45943528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786417fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G      G A/G
rs51659671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786459fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   A AAAA       G          A      A A    A A/G
rs51976460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786527fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs45656209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109786848fCdc25a : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC   G CCCC       C          C      C C    C C/G
rs49864278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109787020fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   C TT T       T          T      T C    T C/T
rs51727725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109787071fCdc25a : Intron1SNPC CCCC   G CCGC       C          C      C G    C C/G
rs33732870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109787615fCdc25a : Intron2SNPTTTTTTG  T TT         T          G      T      G G/T
rs49567386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109787640fCdc25a : Intron1SNPC CCCC   G CCGC       C          C      C G    C C/G
rs49714461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109787666fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   G TTTT       T          T      T T    T G/T
rs50223195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109789151fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A          A      A G    A A/G
rs48814606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109789481fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48465008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109789571fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs49261470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109789695fCdc25a : Intron1SNPA AAAA   A AGAA       G          A      G A    A A/G
rs47351938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109790381fCdc25a : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs47779991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109790483fCdc25a : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs51387980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109790609fCdc25a : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs29886542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109791566fCdc25a : Coding-NonSynonymous1SNP  A   G    A                                     A/G
rs6241527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109794436fCdc25a : Intron1SNP      T   C                                      C/T
rs6243719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109794871fCdc25a : mRNA-UTR1SNP      G   A                                      A/G
rs6256574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109794883fCdc25a : mRNA-UTR1SNP      C   T                                      C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory