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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Cish cytokine inducible SH2-containing protein MGI:103159 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs33264976 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107197059 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | G | G | T | G | T | G | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33264978 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107197082 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | C | G | C | C | G | C | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33706611 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107197751 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30123857 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107197885 | f | Cish : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | T | T | T | C | C | C | T | C | C | T | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29750155 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107198158 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29841622 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107198240 | f | Cish : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | A | G | A | A | A | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29642704 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107198263 | f | Cish : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29600524 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107198544 | f | Cish : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | G | A | G | G | A | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29840901 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107198588 | f | Cish : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | A | A | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30329094 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107198737 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29749795 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107199192 | f | Cish : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13480402 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107199354 | f | Cish : Coding-Synonymous | 3 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | T | T | C | T | T | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||
| rs29687922 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107199524 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | G | G | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29595055 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107199582 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | C | C | C | A | C | C | A | C | A | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33257579 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107199672 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33257580 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200026 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33257581 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200133 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | T | T | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29792871 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200167 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | A | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30385748 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200260 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | T | T | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33259585 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200262 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30187630 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200335 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29686233 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200422 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | A | C | A | C | A | A | C | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30428790 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200475 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30177506 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200704 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | T | T | T | C | T | C | C | C | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs30375914 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200748 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | A | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs30036094 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200750 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33259590 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107200838 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | C | T | C | T | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33259591 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107201340 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | T | T | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33259593 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107201653 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | G | G | A | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33260595 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107201740 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | T | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33260597 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107201786 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | C | C | G | C | C | G | C | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33260598 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107201830 | f | Cish : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29591127 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107202652 | f | Cish : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | C | C | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33260601 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107202715 | f | Cish : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4227914 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107203069 | r | Cish : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4227913 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107203111 | r | Cish : Coding-Synonymous | 3 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | G | G | A | G | G | G | A | A | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4227912 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107203175 | r | Cish : Coding-Synonymous | 3 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | G | G | G | G | G | A | G | A | A | G | A | A | A | G | A | A | A | A | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | A | A | A | G | G | A | A | G | A | G | G | A | A | G | A/G | |
| rs4227911 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107203235 | r | Cish : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33260603 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107204703 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | C | T | C | T | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33261755 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr9:107204784 | f | Cish : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | T | C | T | C | C | T | C | T | C | C/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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