About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Mecp2
methyl CpG binding protein 2
MGI:99918

96 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31668504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74024630fIrak1 : Locus-Region
Mecp2 : 1962 bp downstream of
Mir718 : Locus-Region
Mir5132 : Locus-Region
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs29038791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74027221fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGAG GG GGGA/G
rs29038790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74027553fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs29038789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74028894fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74029323fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNP  AAAA  AAGA  A A AA/G
rs29038787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74030514fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CCCC/T
rs29038786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74030780fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TTTC/T
rs31667753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74032335fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs29038785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74032365fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA CAACA AA AAAA/C
rs29038784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74033827fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC C CC/T
rs29038403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74034122fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs29038402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74035234fMecp2 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAGA AA AGAA/G
rs29038401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74035554fMecp2 : Coding-NonSynonymous
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs29038400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74036211fMecp2 : Coding-NonSynonymous
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CGCC/G
rs29038398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74036628fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74036651fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037248fMecp2 : Coding-Synonymous
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037278fMecp2 : Coding-NonSynonymous
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs31667752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037736fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG  GG G  G GTGG/T
rs29038394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037879fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TTTC/T
rs29038143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037923fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGAG GG GAGA/G
rs29038142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037952fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74037978fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038002fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs29038139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038241fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29038138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038394fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGAG GG GGGA/G
rs29038137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038499fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGTG GG GGGG/T
rs29038136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038523fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG CGGCG GG GGGC/G
rs31667751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038561fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs29038135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038564fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC ACCAC CC CCCA/C
rs29038134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038664fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TTTC/T
rs29037933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74038919fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGTG GG GTGG/T
rs29037932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74039090fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CCCC/T
rs29037931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74039184fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TTTC/T
rs31667750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74039269fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA AAAAA AA AGAA/G
rs29037930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74039568fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT GTTGT TT TGTG/T
rs29037929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74039594fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs31667749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74039872fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA AAAAA AA AGAA/G
rs31667748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74040365fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGTG GG GTGG/T
rs29037928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74040628fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT ATTAT TT TATA/T
rs29037927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74040773fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT ATTAT TT TATA/T
rs29037926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74040816fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs29037925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74042625fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG CGGCG GG GCGC/G
rs29037924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74042674fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGTG GG GTGG/T
rs29037763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74043108fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC GCCGC CC CCCC/G
rs29037762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74043109fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT  TTGT TT TGTG/T
rs29037761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74043140fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA      G  G  A   A A/G
rs31667747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74043733fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA  AA A AA AGAA/G
rs31667746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74043931fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG  GG G GG GAGA/G
rs29037760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74044205fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT GTTGT TT TGTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29037759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74045130fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA TAATA AA ATAA/T
rs29037758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74045246fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAGA AA AGAA/G
rs31667745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74045704fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs29037757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74045881fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGAG GG GAGA/G
rs29037756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74045900fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CCCC/T
rs29037755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74046144fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG A GAG GG G GA/G
rs29037754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74046839fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC T CTC CC CCCC/T
rs29037603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74047200fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG A GAG    GAGA/G
rs29037602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74047748fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT C TCT TT T TC/T
rs31667744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74049174fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG AGAG A AGG GG GAGA/G
rs31667013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74049459fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG C G G GG GCGC/G
rs29037601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74049461fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA   ATA AA A AA/T
rs29037600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74049804fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT A TAT TT T TA/T
rs31667012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74050060fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT T TT G TTT TT TGTG/T
rs29037598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74050205fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT C TCT TT T TC/T
rs29037597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74051438fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC G CGC CC CGCC/G
rs29037596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74051565fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG A GAG GG GGGA/G
rs31667011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74051928fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTT TT TGTG/T
rs29037594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74052332fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTTT C TC  TT TCTC/T
rs29038067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74053737fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC T CTC CC CCCC/T
rs29038066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74054268fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs31667010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74055281fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAAA TAA A AA A AA/T
rs31667009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74058013fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs47940472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74062640fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP CC     T          C/T
rs47678060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74062652fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP        A          A
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29038065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74064263fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCTC CC CTCC/T
rs29038064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74064297fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC  CCTC CC CCCC/T
rs31667008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74067191fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          GG    GAGA/G
rs29037783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74067213fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          TG     T G/T
rs29037782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74067607fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          GA     G A/G
rs29037781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74071268fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          TC     C C/T
rs29037779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74072205fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          GA     G A/G
rs29037778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74072407fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          AC    CA A/C
rs29037777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74072553fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          CA    AC A/C
rs29037776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74072901fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          TC     T C/T
rs29037775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74073036fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          CT     C C/T
rs29037774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74073143fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP          AG     A A/G
rs31667007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74074166fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  G       AG    GA A/G
rs29037563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74074236fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  C       TC    CC C/T
rs29037562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74074251fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  C       TC    CT C/T
rs29037561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74074341fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  G    A  GG     A A/G
rs29037560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74074373fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  A A  A  AC     A A/C
rs29037559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74074641fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  G    CG CG    GC C/G
rs48668762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74081024fMecp2 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  T                T
rs3141646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74086701fMecp2 : Locus-Region
Stol : within coordinates of
4SNPA AAAAGAAAAAGGAAAAAA/G
rs31667006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:74087690fMecp2 : 2000 bp upstream of
Stol : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CACA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/16/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory