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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Abca1 ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1 MGI:99607 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs27778745 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53041708 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778744 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53041770 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778743 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53041794 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778742 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53041813 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778741 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53041860 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778740 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53041907 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778739 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53042075 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778738 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53042299 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778737 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53042405 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778736 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53042504 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778735 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53042694 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778734 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53042748 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778733 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53043389 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778732 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53043626 | f | Abca1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778731 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53044383 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | T | A | T | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778730 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53044628 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53044651 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778728 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53046023 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778727 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53046247 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778726 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53046768 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778725 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53046806 | f | Abca1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778724 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53046966 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778723 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53047092 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778722 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53047119 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778721 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53047137 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27778720 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53047174 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778719 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048019 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048166 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778717 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048362 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778716 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048565 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048611 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778714 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048688 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778713 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048744 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778712 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53048803 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778711 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53049128 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778710 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53049259 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778709 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53049485 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778708 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53049573 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778707 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53049598 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778706 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53049733 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778705 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53050346 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778704 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53050412 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778703 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53050466 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778702 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53050555 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778701 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53050703 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32780021 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53050734 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778700 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051047 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778699 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051215 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778698 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051256 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778697 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051398 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27778696 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051427 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778695 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051554 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778694 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051578 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778693 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051744 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778692 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051864 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778691 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051917 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778690 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53051992 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778689 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53052028 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778688 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53052084 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778687 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53052232 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778686 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53052455 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778685 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53052573 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778684 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53053383 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778683 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53053483 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778682 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53053707 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778681 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53053849 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31772399 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53053868 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778680 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53054073 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778679 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53054121 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778678 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53054396 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778677 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53054485 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778676 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53054748 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778675 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53057206 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778674 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53057930 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778673 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53058767 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27778672 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53058808 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778671 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53059087 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778670 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53060459 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271713 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53061679 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778669 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53061864 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271724 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53062205 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27778668 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53062254 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27837188 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53062271 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27837187 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53062522 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271714 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53063380 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53063390 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27837186 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53063481 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271716 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53063528 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271717 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53063533 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs8271721 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53063777 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs8271723 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53064009 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27837184 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53064095 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G | G | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27837183 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53064156 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27837182 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53064176 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | A | C | A | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27837180 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53064479 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs8271643 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53073458 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs8271656 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074174 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271657 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074189 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271658 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074269 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271659 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074313 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271660 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074314 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271661 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074327 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271662 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074346 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27809563 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074465 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809562 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074476 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs8271627 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074750 | f | Abca1 : Intron | 3 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809553 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074935 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809552 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53074942 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809551 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53075002 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809550 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53075044 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | C | C | G | C | G | G | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809549 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53075126 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809548 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53075127 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs8271629 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53075406 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809547 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53075461 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
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| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
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| rs8271690 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53080903 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271691 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081055 | f | Abca1 : Intron | 3 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809505 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081076 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809504 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081313 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809503 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081486 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809502 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081495 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809501 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081526 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809500 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081592 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809499 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081646 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809498 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081673 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809497 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081694 | f | Abca1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809496 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081732 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809495 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081762 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809494 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081901 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271633 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53081993 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27809493 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082051 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271634 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082104 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809492 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082115 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271635 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082214 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271636 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082325 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271692 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082479 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271693 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082558 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271694 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082633 | f | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271695 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082694 | f | Abca1 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809491 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53082892 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271641 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53083072 | r | Abca1 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27809490 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53083117 | f | Abca1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271640 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53083144 | r | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271639 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53083146 | r | Abca1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8271638 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:53083147 | r | Abca1 : Intron | 1 | SNP |
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