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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Etv4 ets variant gene 4 (E1A enhancer binding protein, E1AF) MGI:99423 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs28234818 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101629267 | f | Etv4 : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | C | T | C | C | T | C | C | T | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234817 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101629308 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234816 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101629490 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234815 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101629547 | f | Etv4 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | G | G | G | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29407467 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101629908 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234814 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101629987 | f | Etv4 : Locus-Region | 2 | SNP | C | T | T | C | T | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234813 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630528 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234812 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630619 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234811 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630720 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234810 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630757 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234809 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630767 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234808 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630794 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234807 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630818 | f | Etv4 : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | C | C | C | T | C | T | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234806 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630825 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | T | C | C | C | T | C | C | C | T | T | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234805 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101630839 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234804 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631044 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234803 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631059 | f | Etv4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234802 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631236 | f | Etv4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234801 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631249 | f | Etv4 : mRNA-UTR | 2 | SNP | G | G | C | C | C | G | C | C | G | C | C | G | G | G | C | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13460902 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631472 | r | Etv4 : mRNA-UTR | 2 | SNP | T | T | C | C | C | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234800 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631492 | f | Etv4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234799 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631706 | f | Etv4 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234798 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631936 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234797 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101631962 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234796 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101632029 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs28234795 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101632367 | f | Etv4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234794 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101632418 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234793 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101632491 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234792 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101632794 | f | Etv4 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234791 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633099 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234790 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633146 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234789 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633166 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234788 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633370 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | C | C | G | G | G | C | G | G | G | G | C | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234787 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633389 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29461584 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633454 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234786 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633532 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234785 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633618 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29428922 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633738 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29395448 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101633862 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234784 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101634152 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234783 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101634158 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234782 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101634558 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234781 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101634692 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | T | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13481195 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101635517 | f | Etv4 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | A | A | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | G | A | A | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A | A | A | A | G | A | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |
| rs28234780 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636383 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234779 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636405 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234778 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636762 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234777 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636835 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234776 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636876 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234775 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636915 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs28234774 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101636962 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28234773 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101637030 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29419573 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101637399 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29462819 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101639604 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29460397 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101639714 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29444327 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101639779 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29476594 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101639847 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29438449 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101640381 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | A | A | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29483153 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101640409 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29407544 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101640473 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29465749 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101640584 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29386673 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101640962 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29434974 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101642816 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29422433 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101644098 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | A | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29487448 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101644896 | f | Etv4 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29434729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:101647025 | f | Etv4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | A | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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