About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Ttr
transthyretin
MGI:98865

98 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31314854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20822052fTtr : Locus-Region1SNPG GGG G G GGAG      GG    GGGA/G
rs16792913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20822123fTtr : Locus-Region2SNPA AAAAA G GGGG      AA  G AGGA/G
rs16792914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20822566fTtr : Locus-Region2SNP TT  T T  C             C    C/T
rs30263474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20822913fTtr : Locus-Region2SNPA AAA AAG GGGG      AG    AGGA/G
rs31313820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20822943fTtr : Locus-Region1SNPC CCC C C CCGC      CC    CCCC/G
rs31313818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20823173fTtr : Locus-Region1SNPT TTT T C TTCT      TT    TTTC/T
rs31313816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20823617fTtr : Locus-Region1SNPA AAA A A AAGA      AA    AGAA/G
rs8243363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20823679fTtr : Locus-Region2SNPT TTTTTTC TTTT   T TTT  T TTTC/T
rs8237598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20823902fTtr : Locus-Region3SNP GGG GGGG A      GGG    A    A/G
rs31312743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20823934fTtr : mRNA-UTR1SNPG GGG G G GGTG      GG    GGGG/T
rs31312741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20824026fTtr : Intron1SNPC CCC C C CCTC      CC    CCCC/T
rs8265739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20824736fTtr : Intron1SNP  GGGGGGG G   G AGGG    GG   A/G
rs8265740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20824843fTtr : Intron2SNPA AAAAAAA AAGAA GAAA    AAA AA/G
rs8265741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825028fTtr : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCCC C   C TCCC    CC   C/T
rs8265742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825034fTtr : Coding-Synonymous2SNP  TTTTTTT T   TTCTTT  TTTT   C/T
rs8265743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825101fTtr : Intron2IN-DEL  ------- -   --C---  ----   -/C
rs8243364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825136rTtr : Intron1SNP  CC CCCT C      C C    C    C/T
rs8265735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825408fTtr : Intron1SNP  AAAAAAG A   A  AAA    AA   A/G
rs8265736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825421fTtr : Intron1IN-DEL  AAAAAA- A   A AAAA    AA   -/A
rs8265737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825422fTtr : Intron1IN-DEL  AAAAAA- A   A AAAA    AA   -/A
rs8265738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825423fTtr : Intron2IN-DEL  GGGGGG- G   G GGGG  GGGG   -/G
rs6272199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825714fTtr : Intron1SNP       A G                   A/G
rs6273344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20825921fTtr : Intron2SNPA AAA AAGG AGA            AGGA/G
rs6274493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826106fTtr : Intron1SNP       C T                   C/T
rs31312737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826646fTtr : Intron1SNPA AAA A A AA A      AA    AGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31312735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826769fTtr : Intron1SNPC CCC C T CCCC      CC    CCCC/T
rs31320388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826795fTtr : Intron1SNPG GGG G T GGGG      GG    GGGG/T
rs31320386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826906fTtr : Intron1SNPA AAA A G AAGA      AA    AG A/G
rs31320384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826966fTtr : Intron1SNPG GGG G A GG G      GG    G GA/G
rs31319562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20826993fTtr : Intron1SNPG GGG G G GGAG      GG    G GA/G
rs31319560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827153fTtr : Intron1SNPG GGG G G GGCG      GG    GGGC/G
rs31319558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827187fTtr : Intron1SNPG GAG G G GGGG      GG    GGGA/G
rs31319556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827383fTtr : Intron1SNPT TTT   C TTTT            T TC/T
rs31319554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827411fTtr : Intron1SNPA AAA A A AAAA      AA    AAGA/G
rs31318662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827445fTtr : Intron1SNPC CCC C T CCTC      CC    C CC/T
rs31318660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827539fTtr : Intron1SNPT TTT T T TTTT      TT    TATA/T
rs31318658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20827595fTtr : Intron1SNPT TTT T A TTTT      TT    TATA/T
rs8265744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828049fTtr : Intron1SNP  CCC  CT        C C    CC   C/T
rs8265745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828068fTtr : Intron1SNP  CCC CCA C      CCC    CC   A/C
rs8265746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828070fTtr : Intron1SNP  CCC CCT C      CCC    CC   C/T
rs8265747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828275fTtr : Intron2SNPC CCC CCT CCTC   C CCC  CCCTCC/T
rs31318655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828410fTtr : Intron1SNPG GGG G   GG G      GG    GAGA/G
rs8265748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828489fTtr : Coding-Synonymous1SNP  GGG GGT G      G G    GG   G/T
rs8265749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828492fTtr : Coding-Synonymous1SNP  GGG GGA G      G G    GG   A/G
rs8265750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828504fTtr : Coding-Synonymous1SNP  GGG GGA G      G G    GG   A/G
rs8265751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828531fTtr : Coding-Synonymous2SNPT TTT TTC TTCT   T TTT  TTTCTC/T
rs31317562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828608fTtr : Coding-NonSynonymous1SNPT TTT T A TTAT      TT    TATA/T
rs8265752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828680fTtr : Intron2SNPC CCCCCCA CCCCC  CCCCC    CCCA/C
rs8265753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828712fTtr : Intron2SNPC CCCCCCG CCGCC  CCCCC    CGCC/G
rs8265754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828739fTtr : Intron1IN-DEL  AAAAAA- A   A  AAA         -/A
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8265755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828757fTtr : Intron1SNP  TTTTTTC T   T  TTT         C/T
rs8265756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828770fTtr : Intron1SNP  TTTTTTC T   T  TTT         C/T
rs8265757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828787fTtr : Intron1SNP  AAAAAAC A   A  AAA         A/C
rs8265758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828860fTtr : Intron1SNP  TTTTTTC T   T  TTT         C/T
rs8265759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20828953fTtr : Intron1SNP  CCCCCCT C   C  CCC         C/T
rs8265760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829036fTtr : Intron2SNPA AAAAAAG AAAA   AAAAA    AAAA/G
rs31317558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829130fTtr : Intron1SNPA AAA A A AAAA      AA    ATAA/T
rs31317556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829198fTtr : Intron1SNPC CCC   T CCTC      C     CCCC/T
rs31317554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829232fTtr : Intron1SNPC CCC C G CCGC      CC    CCCC/G
rs31316712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829256fTtr : Intron1SNPT TTT T   TT T      TT    TCCC/T
rs31316710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829299fTtr : Intron1SNPG GG    A  GAG            G  A/G
rs31316708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20829988fTtr : Intron1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs31316706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20830060fTtr : Intron1SNPC CCC C C CCCC      CC    CTCC/T
rs31316704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20830065fTtr : Intron1SNPG GGG G G GGAG      GG    G GA/G
rs31315882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20830086fTtr : Intron1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs31315880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20830122fTtr : Intron1SNPT TTT T C TT T      TT    T TC/T
rs31315878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20830871fTtr : Intron1SNPG GGG G T GGTG      GG    GTGG/T
rs31315876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20830956fTtr : Intron1SNPC CCC C T CCCC      CC    CCCC/T
rs31315874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831238fTtr : Intron1SNPG GGG G   GG G      GG    G CC/G
rs31314702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831323fTtr : Intron1SNPC CCC C G CCGC      CC    CGCC/G
rs31314701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831369fTtr : Intron1SNPG GGG G G GGAG      GG    GAGA/G
rs31314700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831455fTtr : Intron1SNPT TTT T C TTTT      TT    TTTC/T
rs31314698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831619fTtr : Intron1SNPA AAA A C AAAA      AA    AAAA/C
rs8265772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831772rTtr : Intron2SNPA AAAAAAG AAGAA  AAAAA  AAAGAA/G
rs8265771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831782rTtr : Intron1SNP  AAAAAAC A   A  AAA    AA   A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8265770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831783rTtr : Intron1SNP  GGGGGGA G   G  GGG    GG   A/G
rs8265769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831827rTtr : Intron2SNPA AAAAAAG AAGAA  AAAAA  AAAGAA/G
rs31314694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831947fTtr : Intron1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs31313542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20831972fTtr : Intron1SNPT TTT T T TTCT      T     TCTC/T
rs8265762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832059rTtr : Intron7Mixed  ------A -   -  ---    --   -/A/C/G/T
rs8265761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832074rTtr : Intron1SNP  AAAAAAG A   A  AAA    AA   A/G
rs16795561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832074fTtr : Intron1SNP  TTTTTTC T   TT TTT  TTTT   C/T
rs16795562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832088fTtr : Intron1SNP  AAAAAAG A   AA AAA  AAAA   A/G
rs16795563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832089fTtr : Intron1IN-DEL  CCCCCC- C   CC CCC  CCCC   -/C
rs16795564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832092fTtr : Intron1SNP  CCCCCCT C   CC CCC  CCCC   C/T
rs16795565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832093fTtr : Intron1SNP  TTTTTTA T   TT TTT  TTTT   A/T
rs16795566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832095fTtr : Intron1SNP  GGGGGGA G   GG GGG  GGGG   A/G
rs16795567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832096fTtr : Intron1SNP  GGGGGGA G   GG GGG  GGGG   A/G
rs16795568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832098fTtr : Intron1IN-DEL  TTTTTT-     TT TTT  TTTT   -/T
rs16795569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832100fTtr : Intron1SNP  TTTTTTA T   TT TTT  TTTT   A/T
rs16795570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832102fTtr : Intron1SNP  TTTTTTC     TT TTT  TTTT   C/T
rs31313541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832109fTtr : Intron1SNPT TTT T   TTCT      TT    TCTC/T
rs31313539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832212fTtr : Coding-Synonymous1SNPG GGG G C GGCG      GG    GCGC/G
rs31313538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832581fTtr : mRNA-UTR1SNPA AAA A G AAAA      AA    A AA/G
rs3023461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832621fTtr : mRNA-UTR1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs3023462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832665fTtr : mRNA-UTR1SNPG GGG G T GGGG      G     GGGG/T
rs31313534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832694fTtr : mRNA-UTR1SNPC CCC C C CCTC      CC    CCCC/T
rs31312822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:20832821fTtr : Locus-Region1SNPA AAA A G AAAA      AA    AAAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory