About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Kdm3a
lysine (K)-specific demethylase 3A
MGI:98847

155 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30668490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71587130f 1SNPTA TTTTTATTTTTTT    A/T
rs30668492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71587212f 1SNPCT CTCCCTTCTCTCC    C/T
rs30669364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71587396f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30669366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71587471f 1SNPCT C CCCTTC C CC    C/T
rs30669368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71587536f 1SNPAG AGAAAGGAGAGAA    A/G
rs30669370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71587670f 1SNPCA CCCCCACCCCCCC    A/C
rs30669372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71588167f 1SNPGA GAGGGAAGAGAGG    A/G
rs30670184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71588365f 1SNPTT TTTTTTTTTTTTA    A/T
rs30670186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71588515f 1SNPTT TTTTTTTTTTTTC    C/T
rs30670188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71589618f 1SNPCA CACCCAACACACC    A/C
rs30670190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590009f 1SNPTC TTTTTCTTTTTTT    C/T
rs30670192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590072f 1SNPTC TTTTTCTTTTTTT    C/T
rs30670994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590127f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30670996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590401f 1SNPAA ACAAAACACACAA    A/C
rs30670998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590593f 1SNPTC TTTTTCTTTTTTT    C/T
rs30671000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590730f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30671002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71590784f 1SNPGG GAGGGGGGAGAGG    A/G
rs30671874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71591312f 1SNPCC CTCCCCTCTCTCC    C/T
rs30671876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71591381f 1SNPTG TTTTTGTTTTTTT    G/T
rs30671878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71591761f 1SNPGT GGGGGTGGGGGGG    G/T
rs30671880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71592185f 2SNPAG GGAGGGGGGGGGA AA A/G
rs30671882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71592896f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30852507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71593605f 1SNPC A   A         A   A/C
rs30672794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71593696f 2SNPAG GGAGGGGGGGGGG AA A/G
rs30672796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71593809f 1SNPGG GGGGGGGGGGGGA    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30057140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71594290f 3SNPAGGGGAGGGGGGGGGGGAA A/G
rs30672799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71594357f 1SNPAT AAAAATAAAAAAA    A/T
rs30672801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71594506f 1SNPTC TCTTTCCTCTCTT    C/T
rs29913799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71594672f 4SNPTGGGGTGGGGGGGGGGGTT G/T
rs30673874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71594923f 1SNPTT TTTTTTGTTTTTT    G/T
rs30673876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71595027f 4SNPCAAAACAAAAAAAAAAACC A/C
rs30673878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71595576f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30673880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71595694f 1SNPCC CCCCCCTCCCCCC    C/T
rs30673882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71595766f 1SNPCC CTCCCCTCTCTCC    C/T
rs30674884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596018f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30674886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596019f 1SNPCC CTCCC TCTCTCC    C/T
rs30674888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596059f 1SNPG  GCGGG CGCGCGG    C/G
rs30662782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596062f 4SNPGTTTTGTTTTTTTTTGTGG G/T
rs30674891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596308f 1SNPGA GAGGGAAGAGAGG    A/G
rs30674893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596338f 1SNPGA GAGGGAAGAGAGG    A/G
rs30901615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71596431f 3SNPA C   C         CAA A/C
rs30675775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597018f 1SNPCT CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30675777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597095f 1SNPAG AGAAAGGAGAGAA    A/G
rs30675779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597558f 3SNPAA G AGGAAGAGAGAGAA A/G
rs46647688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597567f 1SNPG     G         G   G
rs30673814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597607f 3SNPAA GAAGGAAGAGAGAGAA A/G
rs30673816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597629f 3SNPCC ACCAACCACACACACC A/C
rs51585735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597692f 2SNPA     G         GAA A/G
rs46688826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71597697f 2SNPT     C         CTT C/T
rs238069739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71598387f 1SNP                 AA A
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30673818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71598411f 2SNPGC CCGCCCCCCCCCG GG C/G
rs30673820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71598445f 2SNPAA GAAGGAAGAGAGA AA A/G
rs30673822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71598621f 2SNPTC CCTCCCCCCCCCT TT C/T
rs30674654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71598694f 1SNPCC CCCCCCGCCCCCC    C/G
rs30674656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71599109f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30950358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71599307f 3SNPA G       G     GAAAA/G
rs30674658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71599477f 1SNPGG  GGGGGG GGG A    A/G
rs30674660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71599585f 1SNPTG TTTTTGTTTTTTT    G/T
rs30674662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71599889f 2SNPGG CGGCCGGCGCGCG GG C/G
rs30675334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71600265f 1SNPCT CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30675336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71600333f 2SNPGG CGGCCGGCGCGCG GG C/G
rs30675338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71600362f 3SNPAG GGAGGGGGGGGGG AA A/G
rs30675340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71600591f 1SNPTA TATTTAATATATA    A/T
rs30109634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71600674f 4SNPGGAAGGAAGGAGAGAGAGG A/G
rs30675343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71600727f 1SNPTC TTTTTCTTTTTTT    C/T
rs30676285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71601128f 1SNPCC CTCCCCTCTCTCC    C/T
rs30676287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71601177f 1SNPCA CCCCCACCCCCCC    A/C
rs30676289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71601307f 1SNPGG GAGGGGA AGAGG    A/G
rs30676291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71601376f 1SNPTT TATTTTATATATT    A/T
rs30021718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71601398f 4SNPTCCCCTCCCCCCCCCTCTT C/T
rs30677314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71601591f 2SNPAT TAA TTATATATA AA A/T
rs30677316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71602146f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30677318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71602364f 1SNPCA CCCCCACCCCCCC    A/C
rs30613548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71602470f 3SNPA G   G         GAA A/G
rs30677320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71602656f 1SNPCC CACCCCACACACC    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30677322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71602790f 1SNPGG GGGGGGAGGGGGG    A/G
rs108825374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603067f 1SNPA     A         C   A/C
rs30678154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603157f 1SNPCT CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30678156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603309f 4SNPGGAAGGAAGGAGAGAGAGG A/G
rs30678158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603348f 1SNPGG GAGGGGAGAGAGG    A/G
rs30678160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603790f 1SNPGA GAGGGAAGAGAGA    A/G
rs30678162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603825f 1SNPCT CTCCCTTCTCTC     C/T
rs30678994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71603826f 1SNPGG GGGGGGGGGGGGC    C/G
rs30678996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71604222f 1SNPCT CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30678997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71604280f 1SNPTT TTTTTTTTTTTTG    G/T
rs30678999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71604482f 2SNPCC ACCAACCACACAA CC A/C
rs243384000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71604585f 1SNP                 CC C
rs30219605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71604758f 4SNPAAGG AGGA GGG GGGAA A/G
rs30679002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71606600f 1SNPCT C CCCT C C CC    C/T
rs30679884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71606653f 1SNPAG A AAAG A A AG    A/G
rs30679886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71606739f 1SNPCC C CCCC CCCCCT    C/T
rs30679888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71607623f 1SNPGA G GGGA G G GA    A/G
rs30679890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71607664f 1SNPTA T TTTA TTTTTT    A/T
rs30679892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71608115f 1SNPCC C CCCC CCCCCA    A/C
rs30680614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71608396f 1SNPGA GGGGGA GGGGGG    A/G
rs30680616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71608461f 1SNPTC T TTTC T T TT    C/T
rs30680618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71609083f 1SNPCC C CCCC CTCCCC    C/T
rs30680620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71609137f 1SNPA  A AAAG A A AG    A/G
rs30680622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71609322f 1SNPCC C CCCA C C CC    A/C
rs30681394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71609691f 1SNPAC AAAAAC A AAAC    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48107637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71609717f 1SNPG               T   G/T
rs30681396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71610034f 1SNPGC G GGGC G G GG    C/G
rs30681398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71610848f 1SNPAG A AAAG A A AG    A/G
rs30674214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71610934f 1SNPCT C CCCT C CCCT    C/T
rs30674216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71611047f 1SNPCC CCCCCC C CCCG    C/G
rs30674218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71611134f 1SNPCC C CCCC C C CG    C/G
rs30674220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71611204f 1SNPCC CCCCCC CCCCCT    C/T
rs30674222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71611975f 1SNPAA A AAAA A A AG    A/G
rs30675074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71612687f 2SNPGA G GGGA GAG GAG   A/G
rs30675076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71613116f 1SNPCA C CCCA C C CC    A/C
rs30675078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71614185f 1SNPGG G GGGG G G GA    A/G
rs30675080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71614951f 1SNPTC T TTTC T T TC    C/T
rs30675082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71615570f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30676024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71615629f 1SNPCC CTCCCCTCTCTCC    C/T
rs30676026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71616298f 1SNP T CTCCCTTCTCTCC    C/T
rs30676028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71616393f 1SNPGA GAGGGAAGAGAGA    A/G
rs30676030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71616606f 1SNP C GGGGGCGGGGGGG    C/G
rs30676032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71616648f 1SNPCA CACCCAACACACC    A/C
rs30676974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71616705f 1SNPAA ATAAAATATATAA    A/T
rs30676976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617069f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30676978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617109f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30676980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617122f 1SNPTC TTTTTCTTTTTTT    C/T
rs30676982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617186f 1SNPTG TTTTTGTTTTTTT    G/T
rs30677884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617347f 1SNPAG AGAAAGGAGAGAA    A/G
rs30677886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617409f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30677888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71617915f 1SNPCT CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30677890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71618616f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA    A/G
rs30677892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71619080f 2SNPAG AGAAAGGAGAGAGA   A/G
rs30678894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71619354f 1SNPCT CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30678896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71619911f 1SNP T TCTTTTCTCTCTT    C/T
rs30678898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71620224f 1SNP A GAGGGAAGAGA G    A/G
rs30678900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71620617f 1SNP   GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30678902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71621116f 1SNPGA GAGGG AGAG GG    A/G
rs30679714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71621119f 1SNP T TTTTTA TTTATT    A/T
rs30679716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71621302f 1SNPAA AGAAAAGAGAGAA    A/G
rs30679718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71621645f 1SNPAG AGAAAGGAGA AA    A/G
rs30679720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71622045f 1SNP A AGAAAAGAGAGAA    A/G
rs30679722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71622489f 1SNPTG T TTTGGTGT TG    G/T
rs30680364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71622663f 1SNP   TGTTT  T T T     G/T
rs30680366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71622693f 1SNPGG GAGGGGAGAGAGG    A/G
rs30680368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71623139f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30680370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71623160f 1SNP C TCTTTCCTCTCTT    C/T
rs30680372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71623469f 1SNPCC CTCCCCTCTCTCC    C/T
rs30681104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71623606f 1SNPCC CCCCCCCCCCCCG    C/G
rs30681106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71624689f 1SNPAG AGAAAGGAGAGAA    A/G
rs30681108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71625173f 1SNP G GAGGGGAGAGAGG    A/G
rs30681110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71625223f 1SNPGA GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30681112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71625328f 1SNP A AAAAAAAAAAAAG    A/G
rs30682044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71626050f 1SNPGG GGGGGGAGGGGGG    A/G
rs30682046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71626263f 1SNPAA AGAAAAGAGAGAA    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30899745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71626454f 2SNPA     G         G   A/G
rs30279957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71626457f 2SNPG     A         A   A/G
rs30682048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71626518f 1SNP G AGAAAGGAGA AG    A/G
rs30682050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71626721f 1SNPCT CTCCCTTCTCTCT    C/T
rs30519922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:71627143f 2SNPA T             TAA A/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/15/2016
MGI 6.04
The Jackson Laboratory