About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Tpm2
tropomyosin 2, beta
MGI:98810

42 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32471696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43512800fCar9 : Intron
Tpm2 : 1911 bp downstream of
vsd : within coordinates of
2SNP  T  C C      C   C/T
rs32234291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43514026fCar9 : Locus-Region
Tpm2 : 685 bp downstream of
vsd : within coordinates of
3SNPCTC  T C  C  C    C/T
rs32603457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43514035fCar9 : Locus-Region
Tpm2 : 676 bp downstream of
vsd : within coordinates of
2SNPTCC  C C          C/T
rs32052972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43514928fTpm2 : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
3SNP GA  G    A  A    A/G
rs13467192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43515042rTpm2 : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
3SNP CT  C    T  T    C/T
rs13467194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43515526rTpm2 : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
3SNPTGT  G    T  T    G/T
rs31786356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43515609fTpm2 : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
3SNPAGA  G    A  A    A/G
rs32239103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43516251fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
3SNPAGA  G    A  A    A/G
rs45808329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43516448fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP  A       A  A    A
rs237461821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43518845fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP          G  G    G
rs27831217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43519979fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA  A    T   A  AT A/T
rs32961453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43520054fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP GT    G          G/T
rs32052966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43521365fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
3SNP CT    T  T  T    C/T
rs48923588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43521458fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP CG    G  G  G    C/G
rs50303411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43521470fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP AG    G  G  G    A/G
rs27831216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43521575fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
3SNPG GGG  GC GCCG GCCC/G
rs31835247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43521816fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
3SNP TC    C  C  C    C/T
rs27831215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522006fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
4SNPACA     A AC A  A A/C
rs45986608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522115fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP CT       T  T    C/T
rs31829965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522212fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
3SNPGAG  A    G  G    A/G
rs50035559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522320fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP C        G  G    C/G
rs32817264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522600fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNPT T  A T  T  T    A/T
rs13467191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522732rTpm2 : Coding-Synonymous
vsd : within coordinates of
1SNP   CC   TC CC  CT C/T
rs32057689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43522908fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP     C T          C/T
rs27831214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43523000fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP        C  T    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs224060662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43523039fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP          C  T    C/T
rs239398231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43523136fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP          G  G    G
rs33017466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43523219fTpm2 : Intron
vsd : within coordinates of
2SNP A   A G  G  G    A/G
rs32049488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43523929fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
2SNPAGG               A/G
rs27831213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43523971fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
4SNPGGC C   C GG C CC C/G
rs31981100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524039fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
2SNPGGA       A  A    A/G
rs27831212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524186fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNP   AA   T  T    TAA/T
rs32187160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524470fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
3SNPAAC  A C  C  C    A/C
rs32438767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524667fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
2SNPGGA  G A  A  A    A/G
rs32237603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524684fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
2SNPGGA  G A  A  A    A/G
rs32810338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524685fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
2SNPGGT  G T  T  T    G/T
rs27831211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524754fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
4SNPGGA AG AG AG A AG A/G
rs6278071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43524873fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNP     CA           A/C
rs31991617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43525169fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNP GC               C/G
rs32506571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43525187fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
2SNP CG               C/G
rs52398120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43525189fTpm2 : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNP C                C
rs27831210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:43525446fTpm2 : 1681 bp upstream of
vsd : within coordinates of
1SNP   GG   A  GG  GA A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/09/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory