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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Hnf1a HNF1 homeobox A MGI:98504 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4225442 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115398890 | f | 2210016L21Rik : Locus-Region Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225443 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115398930 | f | 2210016L21Rik : Locus-Region Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225444 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115398988 | f | 2210016L21Rik : Locus-Region Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | T | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225445 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115398989 | f | 2210016L21Rik : Locus-Region Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225446 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399043 | f | 2210016L21Rik : Locus-Region Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225447 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399110 | f | Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225448 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399178 | f | Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225449 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399199 | f | Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225450 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399211 | f | Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3090568 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399303 | r | Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | C | C | C | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32137729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115399767 | f | Hnf1a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33758643 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115403355 | f | Hnf1a : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33234601 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115403375 | f | Hnf1a : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33562811 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115403569 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | A | T | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33600326 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115403617 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33142674 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115403947 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33239383 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115404206 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29726493 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115404584 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13478474 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115405497 | f | Hnf1a : Coding-Synonymous | 2 | SNP | T | C | T | T | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||
| rs33494420 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115413965 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33041382 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115414087 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33138998 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115414194 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33588757 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115414414 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33523106 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115414539 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33188910 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115415185 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs29680277 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115415230 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | C | A | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33292304 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115416104 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33602662 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115416104 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29569396 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115416327 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33342430 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115416839 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29729491 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115417336 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33548050 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115417389 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29810472 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115417648 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33312283 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:115418090 | f | Hnf1a : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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