About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Cyp4a10
cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 10
MGI:88611

108 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31882657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115188991fCyp4a10 : Locus-Region1SNP AG    A    G                                       A/G
rs27496669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115190257fCyp4a10 : Locus-Region1SNPG AGA A   G AAGA          G         A       G G   A A/G
rs27496668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115190299fCyp4a10 : Locus-Region1SNPG GGG G     G A           G                 G A   G A/G
rs8248765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115190577rCyp4a10 : Locus-Region3SNP  TC  TC  C TTCTC       T           T      C      T C/T
rs8248764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115190699rCyp4a10 : Locus-Region2SNPC CCC CC  ? CCACC       C C         C   C  CC C   C A/C
rs8248763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115190710rCyp4a10 : Locus-Region2SNPT TTT TT  ? TT TT       T T         T   T  TT C   T C/T
rs27480167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115190999fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCC C   A CCCC          C         C       C C   C A/C
rs27480166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191043fCyp4a10 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C   G CC C          C         C         G   C C/G
rs27480165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191068fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1SNPC TCT T   T TTTT          C         T       C T   T C/T
rs27480164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191190fCyp4a10 : Intron1SNP  A A     G  AG           G         A         G     A/G
rs27480163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191236fCyp4a10 : Intron1SNPC CCA A   C CACA          C         C       C C   A A/C
rs8248772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191250fCyp4a10 : Intron1SNP   G  G     G   G    A                     G        A/G
rs8248773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191282fCyp4a10 : Intron1SNP   A                 G                     A        A/G
rs8248774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191304fCyp4a10 : Intron1SNP   A  A   A A   A    T  A                  A        A/T
rs27480162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191363fCyp4a10 : Intron1SNP  CTC C   C CCCC          T         C       T C   C C/T
rs32499413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191612fCyp4a10 : Intron1SNP AG    A    G                                       A/G
rs27480161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191685fCyp4a10 : Intron2SNPCCTCC CC    TCCC          C         T       C C   C C/T
rs8248787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191978fCyp4a10 : Intron1SNP  AA  AA  A A   A    G   A                 A        A/G
rs8248788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115191979fCyp4a10 : Intron2SNPC TCT T   T TTTTC        CC         T      CC T   T C/T
rs8248789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192189fCyp4a10 : Intron1SNP  C   CC  C C        A   C                          A/C
rs8248790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192225fCyp4a10 : Intron1SNP  T   TT  T T        C   T                          C/T
rs8248791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192235fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous3SNPAACA  CAAACCC CCACACCCC   ACAACCCCCCCCCC CC AC CCCCCA/C
rs8248792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192252fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous2SNPA AAC CA  A ACAC     A    A         A       A A   C A/C
rs27480160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192273fCyp4a10 : Coding-Synonymous1SNPG GGG G   A GGGG          G         G       G A   G A/G
rs8248793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192332fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL      -   T T            T                          -/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8248779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192442fCyp4a10 : Intron1IN-DEL  A A AA  - A        A                              -/A
rs8248780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192460fCyp4a10 : Intron1SNP  C C CC  C C   C    A                     C        A/C
rs8248781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192546fCyp4a10 : Intron2SNPA AAA AA  G AAGAA    G    A         A       A G   A A/G
rs8248782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192575fCyp4a10 : Intron1SNP  G   GG    G   G    A                     G        A/G
rs8248783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192656fCyp4a10 : Intron1SNP      GG  G G   G    C                     G        C/G
rs27480159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192735fCyp4a10 : Intron1SNPA T T T     TTAT                    T         T   T A/T
rs8248794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192813fCyp4a10 : Intron1SNP  CC   C  A C   C    C                  C           A/C
rs8248795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192876fCyp4a10 : Coding-Synonymous1SNP  GG   G  A G   G                                   A/G
rs8248796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115192985fCyp4a10 : Intron1SNP  AA   A    A   A    G                              A/G
rs8248784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193065fCyp4a10 : Intron1SNP      T   C     T    T  T               T           C/T
rs8248785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193072fCyp4a10 : Intron2SNPA AAA A   G AAGAA    A  A A         A   A   A A   A A/G
rs8248786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193081fCyp4a10 : Intron1IN-DEL   TT -   T T   T    T  T                           -/T
rs27480158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193123fCyp4a10 : Intron1SNPC CCC C   C CCCC          C         C       C A   C A/C
rs27480157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193146fCyp4a10 : Intron1SNPT TTT T   C TTCT          T         T       T C   T C/T
rs27480156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193620fCyp4a10 : Intron1SNPA AAA A   A AAAA          A         A       A G   A A/G
rs8248797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193912fCyp4a10 : Intron1SNP  C   CC  C C   C    T                     C        C/T
rs8248798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115193912fCyp4a10 : Intron1SNP  C   CC  C C   C    T                     C        C/T
rs8248799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115194079fCyp4a10 : Intron1SNP  T   TT  A T   T    T                     T        A/T
rs8248800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115194176fCyp4a10 : Intron1SNP      A   A A   A    C                     A        A/C
rs27480155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115194211fCyp4a10 : Intron2SNPT GTT TT  G GTGT          T         G       T G   T G/T
rs27480154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115194261fCyp4a10 : Intron1SNPG GGG G   G GGGG          G         G       G A   G A/G
rs32625356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115194432fCyp4a10 : Intron1SNP GA    G                                            A/G
rs32180044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115195263fCyp4a10 : Intron1SNP AC    A    C                                       A/C
rs27480153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115196634fCyp4a10 : Intron1SNPA AAA A   A AAAA          A         A       A G   A A/G
rs27480152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115196801fCyp4a10 : Intron2SNPC GCC CC  C GCCC          C         C       C C   C C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27480151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115196875fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous2SNPA GAA  A  A GA A          A         G         A   A A/G
rs32623235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197002fCyp4a10 : Intron1SNPCC     C    G                                       C/G
rs27480150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197082fCyp4a10 : Intron1SNP    C     C C CC          C                 C T     C/T
rs8248801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197173fCyp4a10 : Intron1SNP  CC  CC  T C   C    C   C              C           C/T
rs8248802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197227fCyp4a10 : Intron1SNP  CC  CC  C C   C    T   C              C           C/T
rs8248803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197400fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL  TT   -  T T   T        T                          -/T
rs8248804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197402fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL  TT  -T  T T   T        T                          -/T
rs8248810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197494fCyp4a10 : Intron1SNP   AA AA  G A   A       A               A  A        A/G
rs8248811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197622fCyp4a10 : Intron1SNP  TTT TT  A T   T       TT              T  T        A/T
rs27480149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197766fCyp4a10 : Intron1SNPG GGG G   G GGGG          G         G       G A   G A/G
rs27480148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197833fCyp4a10 : Intron1SNPA GGG G   G GGGG          G         G       G G   G A/G
rs27480147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115197893fCyp4a10 : Intron1SNPA AAA A   A AAAA          A         A       A G   A A/G
rs8248816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198049fCyp4a10 : Intron1IN-DEL  G   --  G -   G       G               G  -        -/G
rs8248817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198051fCyp4a10 : Intron1IN-DEL  -   GG  G G   -       -               -  G        -/G
rs8248818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198083fCyp4a10 : Intron2SNP  AAA AA  G AAGAA       A A             A  AA A   A A/G
rs8237408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198165fCyp4a10 : Coding-Synonymous2SNP  CC  CC  T C   C       C               C  C        C/T
rs8248821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198495fCyp4a10 : Coding-Synonymous1SNP   CC  C    C   C    T                              C/T
rs27480146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198609fCyp4a10 : Intron1SNPT T       T TTTT                              G   T G/T
rs8248815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198707rCyp4a10 : Intron1SNP  G         G   G       A                           A/G
rs27480145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115198830fCyp4a10 : Intron1SNPA AA  T   A ATAT          A                 A A   T A/T
rs27480144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115200055fCyp4a10 : Intron2SNPCCGCC CC  C GCCC          C                 C C   C C/G
rs32776132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115200153fCyp4a10 : Intron1SNP GC    G    C                                       C/G
rs32261654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115200468fCyp4a10 : Intron1SNP TA    T    A                                       A/T
rs27480143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115200567fCyp4a10 : Intron1SNPC CCC C   C CCGC          C                 C C   C C/G
rs27480142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115200683fCyp4a10 : Intron1SNPG GGT T   G GTGT          G                 G G   T G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27480141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115200966fCyp4a10 : Intron1SNP  A T T   A AT T                              A   T A/T
rs32978653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115201090fCyp4a10 : Intron1SNP AG    A    G                                       A/G
rs32236631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115201482fCyp4a10 : Intron1SNP C     C    T                                       C/T
rs8251147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115201632fCyp4a10 : Intron2SNP CT C CC  T T        C TTT                          C/T
rs8251148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115201641fCyp4a10 : Intron1SNP  AAT TT  A A        T A                A           A/T
rs27480140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115201670fCyp4a10 : Intron1SNPT TTT T   T TTCT          T         T       T T   T C/T
rs27480139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115201982fCyp4a10 : Intron1SNPT AAA     A AAAA          A                 A A   A A/T
rs8251173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202065fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL   -      T T        T                  -           -/T
rs8251174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202067fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL   TT T     -        T  TT              T           -/T
rs8251152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202184fCyp4a10 : Intron1SNP  G   G              T                  G           G/T
rs27480138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202199fCyp4a10 : Intron1SNPA TTT     T TTTT          T         A       T T   T A/T
rs8251153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202215fCyp4a10 : Intron1SNP            G        A                  G           A/G
rs8251154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202220fCyp4a10 : Intron5Mixed  ?? ???    ?        T  ??              ?           -/A/C/G/T
rs8251159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202244fCyp4a10 : Intron1SNP  A   AA    A        G  A               A           A/G
rs27480137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202341fCyp4a10 : Intron1SNPT TTT T   T TTTT          T         T       T C   T C/T
rs27480136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202358fCyp4a10 : Intron1SNPC CCC C   C CCTC          C         C       C C   C C/T
rs27480135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202737fCyp4a10 : Intron1SNPA AAT T   A ATAT          A                 A A   T A/T
rs27480134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202841fCyp4a10 : Intron1SNP  AAA A   A AAAA          A                 A G   A A/G
rs27480133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115202919fCyp4a10 : Intron1SNPA CCC C   C CCCC          C                 C C   C A/C
rs27480132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115203015fCyp4a10 : Intron1SNPC TTT T   T TTTT          T                 T T   T C/T
rs32932989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115204668fCyp4a10 : Intron1SNP  G    A    G                                       A/G
rs8251175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115204774rCyp4a10 : Intron1SNP       A  G                                         A/G
rs27480131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115204800fCyp4a10 : Intron1SNP  AAA A     AAGA          A                 A G   A A/G
rs27480130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115204973fCyp4a10 : Intron1SNPT C C     C  CC           C                   C   C C/T
rs32382808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115204985fCyp4a10 : Intron1SNP GA    G    A                                       A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8251176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115205151fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL  ------  - -          --A              -           -/A
rs27480129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115205251fCyp4a10 : Coding-NonSynonymous1SNP      T   C T CT                            T C   T C/T
rs27480128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115205589fCyp4a10 : Intron1SNP  TTT T   T TTTT          T                 T A   T A/T
rs27480127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115205651fCyp4a10 : Intron1SNP  CCC C   T CCTC          C                 C     C C/T
rs27480126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115206033fCyp4a10 : mRNA-UTR1SNP    C C   T  C C          C                   C   C C/T
rs27480125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115206280fCyp4a10 : Locus-Region1SNPG GGC C   G GCCC          G                 G C   C C/G
rs27480124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115206394fCyp4a10 : Locus-Region1SNPC CCC C   C CCCC          C                 C T   C C/T
rs27480123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:115206513fCyp4a10 : Locus-Region1SNP  GGG G   G  G G          G         G         A   G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory