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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Scn1b sodium channel, voltage-gated, type I, beta MGI:98247 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs32291198 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31899546 | f | Hpn : Intron Scn1b : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31707080 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31899915 | f | Hpn : Intron Scn1b : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31861517 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31899950 | f | Hpn : Intron Scn1b : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32245702 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31900008 | f | Hpn : Intron Scn1b : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33894719 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31902380 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33895042 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31902382 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33894279 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31902400 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269129 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31902736 | r | Scn1b : Coding-Synonymous | 3 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | G | G | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||
| rs31776091 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31902897 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269130 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31902952 | f | Scn1b : Intron | 1 | IN-DEL | - | - | - | T | T | - | - | - | - | - | T | - | - | -/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8269131 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903070 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||
| rs8269132 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903071 | f | Scn1b : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||
| rs31405953 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903125 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269133 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903181 | r | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs31015030 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903282 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32253208 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903802 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32134498 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903844 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31964828 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31903864 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31625725 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31904083 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31785967 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31904095 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33895095 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31905130 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33894807 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31905224 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33895583 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31905224 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32156383 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31907673 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269080 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31907830 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | C | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs4226529 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31907854 | r | Scn1b : Intron | 3 | SNP | A | A | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||
| rs8269081 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908085 | f | Scn1b : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8269082 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908517 | f | Scn1b : Intron | 1 | Mixed | C | C | C | C | T | T | C | C | C | - | -/C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8269083 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908526 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||
| rs8269084 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908529 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8269085 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908547 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||
| rs8269086 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908556 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||
| rs8269087 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908557 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||
| rs8269088 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908567 | f | Scn1b : Intron | 3 | SNP | C | ? | C | C | ? | C | C | A | ? | C | ? | C | A/C/T | |||||||||||||||||||||||
| rs16794305 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908654 | f | Scn1b : Intron | 6 | SNP | C | ? | C | C | C | C | C | ? | C | C | ? | C | ? | A/C/G/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8269115 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908788 | r | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8269114 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908850 | r | Scn1b : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | T | T | C | G | C | C | C | C | T | C/G/T | |||||||||||||||||||||
| rs8269113 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908865 | r | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8269112 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908904 | r | Scn1b : Intron | 2 | SNP | A | A | A | G | G | G | G | G | G | A | A | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8269093 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908914 | r | Scn1b : Intron | 19 | Mixed | A | A | A | A | A | - | A | A | A | A | A | C | -/A/C/G/T | |||||||||||||||||||||||
| rs8269092 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908933 | r | Scn1b : Intron | 2 | Mixed | G | G | G | G | G | - | A | G | G | G | G | G | G | A | -/A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8269091 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31908955 | r | Scn1b : Intron | 3 | SNP | C | C | C | C | C | C | A | C | A | A | C | C | C | C | C | C | A | A/C | ||||||||||||||||||
| rs31743574 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31909144 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32309769 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31909460 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269119 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31909738 | r | Scn1b : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||
| rs8269118 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31909781 | r | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8269117 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31909832 | r | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8269116 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910024 | r | Scn1b : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||
| rs31429970 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910063 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269120 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910116 | f | Scn1b : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs8269121 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910256 | f | Scn1b : Intron | 4 | Mixed | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | ? | - | -/A/C/G/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs31541475 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910261 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269125 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910267 | f | Scn1b : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||
| rs16799364 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910268 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269126 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910560 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||
| rs8269127 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910576 | f | Scn1b : Intron | 2 | SNP | A | T | T | T | A | A | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||
| rs8269128 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910634 | f | Scn1b : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||
| rs32111560 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31910960 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs8269075 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31911224 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||
| rs8269076 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31911225 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||
| rs8269077 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31911304 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8269078 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31911323 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | A | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8269079 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31911344 | f | Scn1b : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs31600780 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:31912326 | f | Scn1b : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | G | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 06/05/2013 MGI 5.13 |
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