About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Ptgs1
prostaglandin-endoperoxide synthase 1
MGI:97797

96 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27159781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36228837fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNP  GGG G C  GGG    GG    GGC/G
rs6269861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36229266fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
2SNP  CCC CCCGCCCC    CC    GCC/G
rs27159780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36229278fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNP  CCC C C CCTC    CC    CCC/T
rs27159779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36229395fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNP  TTT T A  TTT    TT    TTA/T
rs27159778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36230035fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNP  TTT T C  TTT    TT    TTC/T
rs27159777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36230087fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNP  GGG G T  GGG    GG    GGG/T
rs27159776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36230395fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNPT TTT T A  TTT     T   TTTA/T
rs27159775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36231019fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
2SNPCCCCC C C CCCC     C  GCGCC/G
rs27159774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36231936fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C G  CCC     C   CGCC/G
rs27159773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36232176fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C C  CCC     C   CTCC/T
rs27159772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36232370fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T G  TTT     T   TTTG/T
rs27159771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36234728fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C T  CTC     C   C CC/T
rs27159770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36234809fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C G  C C     C   CCCC/G
rs27159769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36234820fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C C  CCC     C   CGCC/G
rs27159768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36235105fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A G  AAA     A   AGAA/G
rs27144167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36235424fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPG GGG G G  GCG     G   GGGC/G
rs33314402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36235936fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
3SNPAAA    G  A   A     A     A/G
rs27144166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36235984fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A A  AAA     A   AGAA/G
rs27144165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36236340fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C T  CCC     C   CCCC/T
rs27144164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36236837fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C C  CCC     C   CGCC/G
rs27144163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237190fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T C  TTT     T   TTTC/T
rs27144162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237265fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C C  CCC     C   CTCC/T
rs8238803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237283fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-Synonymous
2SNPT TTTTTTC TTTT CTT T T TTTC/T
rs8238804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237319fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-Synonymous
1SNP  CC C CC C    TC    C    C/T
rs8238805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237334fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1IN-DEL  -- ---C -    C--   -    -/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237337fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  CC C CT C    CCC   C    C/T
rs8238807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237393fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
3Mixed  -- ---- -    T--   -    -/C/T
rs8238810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237424fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
2SNPG GGGGGGT GGGG GGG G G GGGG/T
rs8238811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237456fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  AA AAAT A    TAA   A    A/T
rs8238812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237541fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  AA AAAA A    TAA   A    A/T
rs8238813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237767fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-NonSynonymous
1SNP  GG G GG      AGG   G    A/G
rs8238814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36237938fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
3Mixed  -- -  - -    ?--   -    -/C/G/T
rs27144161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36238665fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A A  AGA     A   AAAA/G
rs27144160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36238671fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T C  TTT     T   TTTC/T
rs27144159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36238782fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T C  TTT     T   TCTC/T
rs27144158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36238922fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A T  ATA     A   ATAA/T
rs27144157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36239334fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C T  CCC     C   CCCC/T
rs27144156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36240487fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C T  CCC         CCCC/T
rs8238817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36240786fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  G  GGGG G    AGG   G    A/G
rs8238818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36240791fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  A  AAAA A    GAA   A    A/G
rs8238819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36240801fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  A  AAAA A    GAA   A    A/G
rs8238820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36240802fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1IN-DEL  -  ---- -    G--   -    -/G
rs8238821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36240813fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  C  C CC      ACC   C    A/C
rs27144155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36241231fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
4SNPA  AC ACC A CAA    AA  ACCA/C
rs27144154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36241237fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  A     C  ACC          CCA/C
rs27144153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36242213fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     T   TCTC/T
rs27144152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36242257fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPG GGG G G GGGG     G   GAGA/G
rs27144151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36242349fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A A AAAA     A   ATAA/T
rs27144150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36242468fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C T CCCC     C   CTCC/T
rs27144149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36243002fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C T CCCC     C   CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27144148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36243719fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C T CCCC     C   CTCC/T
rs27144147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36243730fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     C   CTCC/T
rs27144146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36244211fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T A TTTT     T   TATA/T
rs27144145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36244337fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A G  AAA     A    GAA/G
rs8238822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36245166fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-NonSynonymous
1SNP     A AA A    TA    A    A/T
rs4223124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36245389fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
2SNPT TTT TTC TTTT  T  T   TCTC/T
rs4223125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36245510fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  C C CCT C     C         C/T
rs4223126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36245558fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  A A AAG A     A         A/G
rs27144144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36245996fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A C  AAA     A   ACAA/C
rs27144143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36246120fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPG GGG G A GGAG     G   GAGA/G
rs27144142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36246770fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG     G   GAGA/G
rs27144141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36246937fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPG GGG G G  GAG     G   G GA/G
rs27144140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36246996fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
3SNPAATAA AAA AAAA     A   AAAA/T
rs27144139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36248897fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A   AAAA     A   ATAA/T
rs27144138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249042fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     C   CTCC/T
rs8238823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249298fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
5Mixed  -- - -G      G--        -/A/G
rs8238828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249312fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
2SNPA AAAAAAG AAAA GAA A   A AA/G
rs8238829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249319fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  TT T TT      GTT   T    G/T
rs8238830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249330fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  GG G GG      AGG        A/G
rs8238831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249437fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  A  A AC      A A        A/C
rs8238832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249439fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNP  AA A AT      TAA        A/T
rs27144137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249519fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A A AAAA     A   AGAA/G
rs8238833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36249528fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1IN-DEL     - --      T          -/T
rs27144136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36250423fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPC CCC C   CCCC     C   CTCC/T
rs27144135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36250456fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPA AAA A   AAAA     A   ACAA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27144134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36250650fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T T  TTT     T   TGTG/T
rs27144133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36250837fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     T   TCTC/T
rs8238834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251207fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-Synonymous
1SNP  CC C CC C    TCC   C    C/T
rs8238835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251238fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Coding-Synonymous
1SNP  CC CCCC C    TCC   C    C/T
rs8238836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251396fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  T  TT T T    GTT        G/T
rs8238837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251459fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  A  AA A A    GAA        A/G
rs8238838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251542fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  A  AA A A    GAA        A/G
rs8238839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251552fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  G  GG G G    AGG        A/G
rs8238840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251884fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  G     G            A    A/G
rs8238841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36251995fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  GA    G                 A/G
rs8238842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36252026fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : mRNA-UTR
1SNP  TG    T                 G/T
rs27144132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36252299fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNPA AAA A C  AAA     A   ACAA/C
rs27144131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36252346fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNPT TTT T T TTTT     T   TCTC/T
rs27144130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36252602fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNPG GGG G A  GGG     G   G GA/G
rs27144129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36252670fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNPC CCC C C CCCC     C   CACA/C
rs27144128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36252677fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : Locus-Region
1SNPC CCC C T CCCC     C   CCCC/T
rs27144127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36253010fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : 738 bp downstream of
1SNPT TTT T C  TTT    TT   TCTC/T
rs27144126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36253108fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : 836 bp downstream of
1SNPC CCC C C CCTC    CC   CCCC/T
rs27144125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36253118fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : 846 bp downstream of
1SNPG GGG G A GGGG    GG   GGGA/G
rs27144124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36253222fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : 950 bp downstream of
1SNPC CCC C T CCCC    CC   CCCC/T
rs27144123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:36253241fDwh : within coordinates of
Ptgs1 : 969 bp downstream of
1SNPG GGG G A GGGG    GG   GGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory