About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Plp1
proteolipid protein (myelin) 1
MGI:97623

129 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29263797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355378fPlp1 : Locus-Region1SNPAAAA A GAA A    AA   AGAA/G
rs29263796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355562fPlp1 : Locus-Region1SNPTTTT T TTTAT    TT   TATA/T
rs29263795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355604fPlp1 : Locus-Region1SNPGGGG G GGGGG    GG   GGCC/G
rs29263794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355620fPlp1 : Locus-Region1SNPCCCC C CCCTC    CC   CTCC/T
rs29263693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355677fPlp1 : Locus-Region1SNPTTTT T TTTGT    TT   TGTG/T
rs29263692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355728fPlp1 : Locus-Region1SNPTTTT T CTTCT    TT   TCTC/T
rs29263691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133355982fPlp1 : Locus-Region1SNPGGGG G AGGAG    GG   GAGA/G
rs29263690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133356221fPlp1 : Locus-Region1SNPGGGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs29263689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133356481fPlp1 : Locus-Region1SNPTTTT T CTTTT    TT   TTTC/T
rs29263688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133356930fPlp1 : Locus-Region1SNPTTTT T CTT T    TT   TCTC/T
rs29263687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357377fPlp1 : mRNA-UTR1SNPAA A A AAA      A     G A/G
rs29263686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357391fPlp1 : mRNA-UTR1SNPGG G G AGG      GG   GGGA/G
rs29263685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357405fPlp1 : mRNA-UTR1SNPAA A A GAAAA    AA   A AA/G
rs29263684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357408fPlp1 : mRNA-UTR1SNPAA A A AAAAA    AA   AGAA/G
rs29263613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357436fPlp1 : mRNA-UTR1SNPGGGG G GGGGG    GG   GCGC/G
rs29263612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357520fPlp1 : Intron1SNPTTTT T TTTTT    TT   TCTC/T
rs29263611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357632fPlp1 : Intron1SNPAAAA A AAA A    AA   ATAA/T
rs29263610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133357875fPlp1 : Intron1SNPCC C C TCC C    C    CCCC/T
rs29263609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358028fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTTT    TT   TTTC/T
rs29263608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358109fPlp1 : Intron1SNPGG G G AGGGG    GG   GG A/G
rs29263607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358194fPlp1 : Intron1SNPCC C C GCC      C     G C/G
rs29263606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358207fPlp1 : Intron1SNPCC C C TCC C    CC    TCC/T
rs29263605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358261fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGG G    GG   GAGA/G
rs29263604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358293fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGGAG    GG   GAGA/G
rs29263513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358520fPlp1 : Intron1SNPGG G G GGGCC    G     C C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29263512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358761fPlp1 : Intron1SNPAA A A AAATA    AA   ATAA/T
rs29263511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133358820fPlp1 : Intron1SNPTT T T ATT      T       A/T
rs29263510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359107fPlp1 : Intron1SNPTTTT T GTT T    T    TTTG/T
rs29263509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359170fPlp1 : Intron1SNPGG G G CGGGG    GG   GGGC/G
rs29263508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359268fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGGAG    GG   GAGA/G
rs29263507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359515fPlp1 : Intron1SNPAAAA A GAAAA    AA   AAAA/G
rs29263506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359618fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGGGG    GG   GGGA/G
rs29263505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359813fPlp1 : Intron1SNPAAAA A AAA A    AA   AGAA/G
rs29263504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359880fPlp1 : Intron1SNPTTTT T TTTCT    T    TCTC/T
rs29263443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133359939fPlp1 : Intron1SNPCC C C ACCCC    CC   CCCA/C
rs29263442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360052fPlp1 : Intron1SNPCC C C TCC C    CC    C C/T
rs29263441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360146fPlp1 : Intron1SNPAA A A GAAGA    AA   AGAA/G
rs29263440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360206fPlp1 : Intron1SNPTTTT T TTTTT    TT    GTG/T
rs29263439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360689fPlp1 : Intron1SNPTT T T TTTGT    TT   TGTG/T
rs29263438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360788fPlp1 : Intron1SNPGGGG G GGG G    G    GAGA/G
rs29263437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360825fPlp1 : Intron1SNPGG G G AGG G    GG   GGGA/G
rs29263436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360835fPlp1 : Intron1SNPAA A A AAA      AA   AG A/G
rs29263435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133360933fPlp1 : Intron1SNPCCCC C CCCGC    CC   CGCC/G
rs29263434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133361050fPlp1 : Intron1SNPAAAA A AAAGA    AA   AGAA/G
rs29263413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133361203fPlp1 : Intron1SNPGG   G TGGGG    G     G G/T
rs29263412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133361360fPlp1 : Intron1SNPCCCC C TCCCC    CC   CCCC/T
rs29263411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133361416fPlp1 : Intron1SNPGGGG G GGG G    GG   GAGA/G
rs29263410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133361598fPlp1 : Intron1SNPCCCC C CCC C    CC   CGCC/G
rs29263409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133361916fPlp1 : Intron1SNPTT T T ATTAT    TT   TA A/T
rs29263408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133362203fPlp1 : Intron1SNPCCCC C ACCCC    CC   CCCA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29263407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133362505fPlp1 : Intron1SNPAA A A TAA A    AA   AT A/T
rs29263406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133362525fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGG G    GG   GAGA/G
rs29263405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133362543fPlp1 : Intron1SNPAAAA A GAA A    AA   AGAA/G
rs29263404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133362755fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGGAG    GG   GAGA/G
rs29263383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133363195fPlp1 : Intron1SNPAA A A GAAGA    AA   AGAA/G
rs29263382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133363689fPlp1 : Intron1SNPAA     GAA      A     G A/G
rs29263381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133364081fPlp1 : Intron1SNPCC   C TCC C    CC    T C/T
rs29263380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133364131fPlp1 : Intron1SNPTT T T CTT      T    TC C/T
rs29263379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133364330fPlp1 : Intron1SNPCC C C  CC C    CC   CTCC/T
rs29263378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133364486fPlp1 : Intron1SNPGG G G AGG G    G    GA A/G
rs29263377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133364817fPlp1 : Intron1SNPAAAA A GAAGA    AA   AGAA/G
rs29263376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133365095fPlp1 : Intron1SNPTTTT T GTTTT    TT   TTTG/T
rs29263375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133365245fPlp1 : Intron1SNPGGGG G GGG G    G    GAGA/G
rs29263374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133365446fPlp1 : Intron1SNPAA A A GAAGA    AA   AGAA/G
rs29263353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133365623fPlp1 : Coding-Synonymous1SNPTTTT T TTT T    TT   TCTC/T
rs29263352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133366088fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTTT    TT   TTTC/T
rs29263351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133366188fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGG G    GG   GAGA/G
rs29263350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133366427fPlp1 : Intron1SNPCCCC C CCCTC    CC   CTCC/T
rs29263349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133366813fPlp1 : Intron1SNPCC C C CCC C    CC    TCC/T
rs29263348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367049fPlp1 : Intron1SNPGG   G GGG G    GG   GTGG/T
rs29263347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367096fPlp1 : Intron1SNPTTT  T ATT T    TT   T  A/T
rs29263346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367224fPlp1 : Intron1SNPCC C C TCC C    CC   CCCC/T
rs29263345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367341fPlp1 : Intron1SNPAAAA A AAAT     A     T A/T
rs29263344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367635fPlp1 : Intron1SNP G   G AG             A A/G
rs29263323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367672fPlp1 : Intron1SNPGG G G GGG G    GG   GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29263322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367707fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTCT    TT   TCTC/T
rs29263321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133367869fPlp1 : Coding-Synonymous1SNPAA A A GAAG     A     G A/G
rs29263320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133368141fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTT T    T    TCTC/T
rs29263319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133368850fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTCT    T    TCTC/T
rs29263318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133368864fPlp1 : Intron1SNPTTTT T GTT T    T     TTG/T
rs29263317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369209fPlp1 : Intron1SNPAAAA A GAAGA    A     GAA/G
rs29263315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369215fPlp1 : Intron1SNPAAAA A TAATA    A    ATAA/T
rs29263316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369215fPlp1 : Intron1SNPGAAG A  GA A     A    AAA/G
rs29263314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369299fPlp1 : Intron1SNPAAAA A GAAGA    AA   AGAA/G
rs29263293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369345fPlp1 : Intron1SNPGGGG G AGGAG    G    GAGA/G
rs29263292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369523fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTCT    T    TCTC/T
rs29263291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369670fPlp1 : Coding-Synonymous1SNPGGGG G GGGAG    GG   GAGA/G
rs29263290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369770fPlp1 : Intron1SNPCCCC C ACCAC    CC   CACA/C
rs29263289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133369837fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTCT    TT   TCTC/T
rs29263288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133370109fPlp1 : Intron1SNPGG G   GGGAG          AGA/G
rs29263287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133370257fPlp1 : Intron1SNPTTTT T CTTTT    T    TTTC/T
rs29263286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133370406fPlp1 : Intron1SNPCCCC C ACCAC    C    CACA/C
rs8238551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133370664fPlp1 : mRNA-UTR1SNP CCCC CCC   CTCC   CC   C/T
rs8238552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133370711fPlp1 : mRNA-UTR6Mixed ---- ---   -A--   --   -/A/C/T
rs8238558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133370873fPlp1 : mRNA-UTR1SNP GGGG GGG   GAGG   GG   A/G
rs8238559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371011fPlp1 : mRNA-UTR2SNPGGGGGGGAGGGGGAGGGG GGGGGA/G
rs8238560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371157fPlp1 : mRNA-UTR1SNP A AA AAA   AGAA   AA   A/G
rs8238561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371164fPlp1 : mRNA-UTR1IN-DEL T TT TTT   T-TT   TT   -/T
rs8238562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371165fPlp1 : mRNA-UTR1IN-DEL A AA AAA   A-AA   AA   -/A
rs8238584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371296fPlp1 : mRNA-UTR2SNPCCCCCCCTCCCCCC CCC CCCCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371486fPlp1 : mRNA-UTR1SNP   TT TTT   TATT   TT   A/T
rs29263285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371592fPlp1 : mRNA-UTR1SNPGGGG G CGGGG    GG   GGGC/G
rs8238586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371614fPlp1 : mRNA-UTR1SNP CCCC CTC   CTCC   C    C/T
rs8238587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371674fPlp1 : mRNA-UTR2SNPTTTTTTTATTTTTTTTT  T TTTA/T
rs8238588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371690fPlp1 : mRNA-UTR1SNP AAAA AAA   ACAA   A    A/C
rs29263284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371701fPlp1 : mRNA-UTR1SNPTTTT T TTTCT    TT   TCTC/T
rs8238602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371723fPlp1 : mRNA-UTR7Mixed ---- ---   -T--   -    -/A/C/G/T
rs29262846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371908fPlp1 : mRNA-UTR1SNPAAAA A AAAGA    AA   AGAA/G
rs8238563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371945fPlp1 : mRNA-UTR2SNPTTTT T CTTCTTCTTT  TTTCTC/T
rs8238564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371960fPlp1 : mRNA-UTR1SNP   C   CC   CACC   CC   A/C
rs8238565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371987fPlp1 : mRNA-UTR2SNPAAAA A GAAAAAGAAAA AAAAAA/G
rs8238566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133371994fPlp1 : mRNA-UTR1SNP   A   AA   AGAA   AA   A/G
rs8238567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372004fPlp1 : mRNA-UTR1SNP       CC   CTCC   CC   C/T
rs8238568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372024fPlp1 : mRNA-UTR1SNP   C   CC   CTCC   CC   C/T
rs8238569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372035fPlp1 : mRNA-UTR2SNPAAAA A GAAGAAGAAA  AAAGAA/G
rs8238570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372075fPlp1 : mRNA-UTR2SNPCCCC C ACCCCCACCCC CCCCCA/C
rs8238571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372104fPlp1 : mRNA-UTR1SNP   G   GG   GAGG   GG   A/G
rs8238572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372106fPlp1 : mRNA-UTR2SNPTTTT T CTTCTTTTTTT TTTCTC/T
rs8238573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372164fPlp1 : mRNA-UTR1SNP   C   CC   CTCC   CC   C/T
rs16783987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372176fPlp1 : mRNA-UTR2SNPCCCC C GCCCCCCCCCCCCCCCCC/G
rs8238574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372310fPlp1 : Locus-Region1SNP G AG GAG   A GG   GG   A/G
rs8238575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372404fPlp1 : Locus-Region2SNPAAAAAAAGAA AAGAAAA AAAGAA/G
rs8238576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372444fPlp1 : Locus-Region1IN-DEL    G  GG   G-GG   GG   -/G
rs8238577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372447fPlp1 : Locus-Region1SNP T TT TTT   TCTT   TT   C/T
rs8238578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372448fPlp1 : Locus-Region1IN-DEL T TT  TT   T-TT   TT   -/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372460fPlp1 : Locus-Region1SNP C CC CCC   CTCC   CC   C/T
rs8238580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372504fPlp1 : Locus-Region2SNP C CC  CC   CTCC  CCC   C/T
rs8238581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372657fPlp1 : Locus-Region2Mixed -- - ---   -?--   -    -/C/T
rs8238583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:133372671fPlp1 : Locus-Region1SNP CC C CCC   CACC   C    A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory