About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Pax6
paired box 6
MGI:97490

66 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27444178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105667179fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Locus-Region
Pax6os1 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGT T GGTG GG  GTGG/T
rs29954828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105667893fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Locus-Region
Pax6os1 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC T   C              C/T
rs27444177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105668332fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Locus-Region
Pax6os1 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNPG CCCCGC CGCG GG  GCGC/G
rs33315772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105669122fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6os1 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNPTTC   T              C/T
rs29820630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105669948fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6os1 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNPTTC   T  C       C   C/T
rs51062910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105669978fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6os1 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP AG      G           A/G
rs33424439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105670472fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6os1 : Locus-Region
Vss : within coordinates of
2SNP      T  C           C/T
rs29968629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105670895fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6os1 : Locus-Region
Vss : within coordinates of
1SNPAAG   A  G           A/G
rs33170336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105673655fGm20279 : Noncoding-Transcript-Variant
Nmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6 : Locus-Region
Vss : within coordinates of
1SNP  G   C  G           C/G
rs33198906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105674465fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6 : Locus-Region
Vss : within coordinates of
2SNPTTC   T              C/T
rs29623599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105675060fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Pax6 : Locus-Region
Vss : within coordinates of
2SNPTTA      A           A/T
rs51517927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105679357fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP GT                  G/T
rs33711680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105681756fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNP AG   A  G   G  AG   A/G
rs46892673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105682805fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNP GA      A   A  G    A/G
rs33369601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105683421fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNP TA      A   A  T    A/T
rs50196184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105684033fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP  A              G   A/G
rs47206501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105684281fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP CC              T   C/T
rs50963481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105684374fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP TT              C   C/T
rs29778303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105684604fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNP TA   T              A/T
rs29818548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105687192fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNP  A   G  A   A  G    A/G
rs33045977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105687734fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNPG T   G              G/T
rs48926304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105687815fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNP  T      T   T  C    C/T
rs33676769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105687912fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNPGGC   G  C   C  G    C/G
rs241091062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105689482fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs252230814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105689619fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27444176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105691766fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGT G GGTG G   GTGG/T
rs27444175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105692356fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA A   AAAA/G
rs27444174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105692673fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAG A AAGA A   AGAA/G
rs27444173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105692959fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
4SNPAAGGGGAG GAGAGA A AGAA/G
rs239025535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693129fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs27444172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693190fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCG G CCGC C   CGCC/G
rs32868365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693274fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNPGG    G  A   A  G    A/G
rs27444171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693433fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCT    CTC C   CTCC/T
rs27444170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693442fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNPTTCCCTTT CTTT T   TTTC/T
rs27444169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693494fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCCC C   CCCC/G
rs27444168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693509fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGA G GGAG G   GGGA/G
rs27429167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693665fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCT C CCTC C   CCCC/T
rs27429166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693704fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGGG G   GGGC/G
rs27429165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105693852fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGA A GGAG G   GAGA/G
rs27429164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105694088fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCT C CCTC C   CCCC/T
rs33138304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105694208fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP AC   A  C           A/C
rs229466023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105694209fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs27429163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105694846fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPT TTTC C TTCT T    CTC/T
rs33410494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105694861fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
3SNP  A   G  A   A  G    A/G
rs27429162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105694959fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCT T CCTC C   CTCC/T
rs27429161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695027fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA A   AAAA/G
rs27429160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695114fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAG G AAGA A   AGAA/G
rs27429159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695332fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Coding-Synonymous
Vss : within coordinates of
3SNPA GGGG G GAGAGA A AGAA/G
rs27429158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695535fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPT TTTA A  TAT T   TATA/T
rs27429157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695631fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPT TTTC C TTCT T   TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27429156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695656fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGGG G   GGGC/G
rs27429155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695679fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAG G AAGA A   AGAA/G
rs27429154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695705fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGA G GGAG G   GAGA/G
rs6231820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695929fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
2SNPA AAAGAGGAAGA A   AGAA/G
rs27429153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105695975fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPT TTTC C TTCT T   TCTC/T
rs27429152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105696181fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAC C AACA A   ACAA/C
rs27429151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105696373fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : mRNA-UTR
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAG G AAGA A   AGAA/G
rs27429150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105697761fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : Intron
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCCC C   CCCA/C
rs27429149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105698025fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 661 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT T   TTTC/T
rs29768457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105698556fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1192 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNP TC   T  C           C/T
rs27429148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105698620fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1256 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs27429147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105698986fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1622 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGT G GGTG G   GGGG/T
rs27429146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105699025fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1661 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNPC CCCT C CCTC C   CTCC/T
rs27429145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105699131fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1767 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNPG GGGC G GGCG G   GCGC/G
rs27429144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105699197fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1833 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNP   A G G           GAA/G
rs27429143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:105699230fNmf220 : within coordinates of
Pax6 : 1866 bp downstream of
Vss : within coordinates of
1SNPA AAAT A AATA A   ATAA/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/09/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory