About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Otc
ornithine transcarbamylase
MGI:97448

224 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33493039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9827846fOtc : Locus-Region1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33493041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9827964fOtc : Locus-Region1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33493043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9828159fOtc : Locus-Region1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs33494465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9828415fOtc : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33494467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9828777fOtc : Locus-Region1SNPC CCCC C CCACCCCCCA/C
rs33494470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9828818fOtc : Locus-Region1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
rs33494473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9828951fOtc : Locus-Region1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33495336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9828976fOtc : Locus-Region1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs33495339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829622fOtc : Coding-Synonymous1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33495342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829654fOtc : Intron1SNPC CCCC G CCGCCCCGCC/G
rs33496105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829685fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33496108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829738fOtc : Intron1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
rs33496111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829756fOtc : Intron1SNPG GGGG C GGCGGGGGGC/G
rs33496974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829847fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33496977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9829885fOtc : Intron1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs33496980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9830131fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33496983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9830256fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTTTTTTATA/T
rs33497826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9831257fOtc : Intron1SNPT TTT  C TTCTTTTCTC/T
rs33497829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9831400fOtc : Intron1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs33497832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9831468fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGGGGGGAGA/G
rs33498814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9831599fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs33498817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9832007fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTGTTTTGTG/T
rs33498820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9832057fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33498823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9832119fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs33499486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9832462fOtc : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33499489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9832866fOtc : Intron1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
rs33499492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9833201fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTTTTTTATA/T
rs33500325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9833243fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33500328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9833453fOtc : Intron1SNPA AAAA A AATAAAATAA/T
rs33500331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9833765fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33501124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9833893fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTTTTTTGTG/T
rs33493394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9834435fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33493397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9834910fOtc : Intron1SNPT TTTT A TTTTTTTTTA/T
rs33493400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9834951fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs33493402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9835261fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs33494524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9835338fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33494527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9835544fOtc : Intron1SNPG GGGG A GG GGGG GA/G
rs31351762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9836491fOtc : Intron2SNPG AGAGAG GGGAGGGGGA/G
rs33494532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9836914fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs33495325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9836931fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33495328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9836942fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTTTTTTTTG/T
rs33495330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9837145fOtc : Intron1SNPC CCCC A CCACCCCACA/C
rs33495333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9837228fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGTGGGGTGG/T
rs33496205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9837414fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33496208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9837470fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGTGGGGGGG/T
rs33496210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9838294fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCC CC/T
rs33496212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9847494fOtc : Intron1SNP   CC         CCGCC/G
rs6254234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9848019fOtc : Intron1SNP      C T         C/T
rs6255290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9848180fOtc : Intron1SNP      G A         A/G
rs6255839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9848268fOtc : Intron1SNP      G A         A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6256978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9848472fOtc : Intron1SNP      G A         A/G
rs33497135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9852888fOtc : Intron1SNP  GG          GGAGA/G
rs33497138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9853167fOtc : Intron1SNPT TTT  C TT TTTTTTC/T
rs33497141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9853470fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33497954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9853702fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTTTTTTGTG/T
rs33497957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9853864fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTATTTTATA/T
rs33497960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9854779fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33497963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9854989fOtc : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAGAA/G
rs33498805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9855051fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33868438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9856879fOtc : Intron1SNPCC    T           C/T
rs33498808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9856971fOtc : Intron1SNPT TTTT C TT TTTTCTC/T
rs33498811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9857061fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs33499354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9857611fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs33499357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9858221fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGGGGGGAGA/G
rs33499359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9858289fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs31115925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9858958fOtc : Intron1SNP TA               A/T
rs33499361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9859914fOtc : Intron1SNPA AAAA T AA AAAAAAA/T
rs33499363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9860610fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33500266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9860959fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33500268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861238fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTTTTTTTTG/T
rs33500271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861401fOtc : Intron1SNPG GGGG   GGAGGGGAGA/G
rs33489886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861454fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33489889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861513fOtc : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAGAA/G
rs33489891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861555fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs33490684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861588fOtc : Intron1SNPA AAAA A A AAAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33490686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861666fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTTTTTTTTG/T
rs33490689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861975fOtc : Intron1SNPA AAAA A AAAAAAACAA/C
rs33490692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9861988fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs33491654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9862031fOtc : Intron1SNPG GGGG C GGGGGGGGGC/G
rs33491656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9862055fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33491658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9862906fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAA A/G
rs33491661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9863148fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs33491663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864157fOtc : Intron1SNPA AAAA G AA AAAAGAA/G
rs33492726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864183fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33492729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864245fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33492731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864357fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33493524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864519fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33493526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864563fOtc : Intron1SNPG GGGG A G  GGGGAGA/G
rs33493529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864651fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33493532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9864759fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33494514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9865413fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGGGGGGGGG/T
rs33494517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9865476fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33494519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9865507fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33494522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9865972fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs33495295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9866289fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGTGG GTGG/T
rs33495297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867028fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs33495300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867115fOtc : Intron1SNPA AAAA A AACAAAACAA/C
rs33495303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867247fOtc : Intron1SNPA AAAA A AAGAA AGAA/G
rs33496095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867315fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCC CTCC/T
rs33496097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867588fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33496100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867635fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33496103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867651fOtc : Intron1SNPC CCCC G CC CCCCGCC/G
rs33497055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867698fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGGGG GGGA/G
rs33497057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867842fOtc : Intron1SNPA AAAA A AACAAAACAA/C
rs33492155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867851fOtc : Intron1SNPA AAAA T AAAAAAAAAA/T
rs33492158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9867888fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCACCCCACA/C
rs33492160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868053fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33492162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868069fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs33493155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868102fOtc : Intron1SNPC CCCC   CCTCC CCCC/T
rs33493157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868293fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33493159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868336fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTT TCTC/T
rs33493162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868498fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCC CTCC/T
rs33493163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868530fOtc : Intron1SNPT TTTT C TT TT T TC/T
rs33494236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868543fOtc : Intron1SNPT TTTT C TT TTTT TC/T
rs33494239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868698fOtc : Intron1SNPA AAAA A AATAA ATAA/T
rs33494242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9868710fOtc : Intron1SNPC CCCC T CC CC CCCC/T
rs33495055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869039fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGAGG GAGA/G
rs33495058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869325fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTTTTTTCTC/T
rs33495059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869425fOtc : Intron1SNPA AAAA A AAGAA AGAA/G
rs33495062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869641fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTGTT TGTG/T
rs33495905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869686fOtc : Intron1SNPC CCCC T CC CC C CC/T
rs33495907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869771fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33495909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869806fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs33495912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9869968fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs33495913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870240fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCACC C CA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33496946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870265fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCGCCCCGCC/G
rs33496948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870321fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33496951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870446fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTATT TATA/T
rs33497784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870554fOtc : Intron1SNPG GGGG G G A G GAGA/G
rs33497787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870601fOtc : Intron1SNPA AAAA A AACAAAACAA/C
rs33497790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870755fOtc : Intron1SNPT GGGT T TGTGTTGTTG/T
rs33497793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870816fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCC C CCCC/T
rs33498605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9870937fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs33498606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9871241fOtc : Intron1SNPT TTTT T TTATTTTATA/T
rs33498609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9871459fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTGTT TGTG/T
rs33498612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9873245fOtc : Intron1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
rs33499644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9873264fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGGGG GGGA/G
rs33496194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9873845fOtc : Intron1SNPC CCCC C C T C CTCC/T
rs33496196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9873994fOtc : Intron1SNPA AAAA A AATAA ATAA/T
rs33496197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9874337fOtc : Intron1SNPA AAAA G AA AAAAGAA/G
rs33496199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9874929fOtc : Intron1SNPA AAAA T A TAA ATAA/T
rs31114220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9875232fOtc : Intron1SNPC     A  C        A/C
rs33496202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9875297fOtc : Intron1SNP       G   A    G A/G
rs33497514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9876461fOtc : Intron1SNP       A   G    G A/G
rs33497516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9876515fOtc : Intron1SNP       C   A    A A/C
rs33497518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9876563fOtc : Intron1SNP       G   A    A A/G
rs33497521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9876953fOtc : Intron1SNP       A   G    G A/G
rs33497523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9877003fOtc : Intron1SNP       G   A    A A/G
rs33498556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9877140fOtc : Intron1SNP       T   C    C C/T
rs33498558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9877318fOtc : Intron1SNP       T   C    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33871778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9878043fOtc : Intron1SNP AG   G           A/G
rs33498561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9878498fOtc : Intron1SNP       C   T    T C/T
rs33498563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9880214fOtc : Intron1SNP       A   G    G A/G
rs33499496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9880729fOtc : Intron1SNP       A   C    C A/C
rs33499499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9880887fOtc : Intron1SNP       C   C    T C/T
rs33499501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9881558fOtc : Intron1SNP       G   C    C C/G
rs33499503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9881728fOtc : Intron1SNP       T   C    C C/T
rs33500406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9881803fOtc : Intron1SNP       G   A    A A/G
rs33500409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9882450fOtc : Intron1SNP       G   T    T G/T
rs33500412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883092fOtc : Intron1SNP       C   T    T C/T
rs33501255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883112fOtc : Intron1SNP       C   G    G C/G
rs33501258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883137fOtc : Intron1SNP       A   C    C A/C
rs33501259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883138fOtc : Intron1SNP       G   G    A A/G
rs33501261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883406fOtc : Intron1SNP       C   G    G C/G
rs33501263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883468fOtc : Intron1SNP       A   C    C A/C
rs33502565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883529fOtc : Intron1SNP       G   A    A A/G
rs33502568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9883569fOtc : Intron1SNP       C   T    T C/T
rs33502571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9884064fOtc : Intron1SNP       A   G    G A/G
rs33502573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9884224fOtc : Intron1SNP       T   A    A A/T
rs33503525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9884331fOtc : Intron1SNP       G   A    A A/G
rs33503528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9885189fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33503531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9885329fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33504154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9885865fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33496686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9885980fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33496687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886224fOtc : Intron1SNPA AAAA T AATAAAATAA/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33496689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886240fOtc : Intron1SNPA AAAA T AATAAAATAA/T
rs33496691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886331fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33496693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886413fOtc : Intron1SNPC CCCC G CCCCCCCCCC/G
rs33497915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886433fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs33497918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886477fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33497920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886560fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs33497922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9886815fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33498904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9887209fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33498906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9887294fOtc : Intron1SNPA AAAA T AATAAAATAA/T
rs33498908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9887696fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33498910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9887718fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33498912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9887761fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33499965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9888379fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs33499966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9888497fOtc : Intron1SNPA AAAA C AACAAAACAA/C
rs33499967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9888517fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGTGGGGTGG/T
rs33499970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9888551fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs33499973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9888738fOtc : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs33501056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9889340fOtc : Intron1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs33501058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9889361fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGCGGGGCGC/G
rs33501061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9890885fOtc : Intron1SNPG GGGG T GGTGGGGTGG/T
rs33501874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9891108fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33501877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9891246fOtc : Intron1SNPA  AA  G  AG  AAGAA/G
rs33501880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9891737fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33501882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892043fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33502625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892317fOtc : Intron1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33502628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892398fOtc : Intron1SNPC CCCC G CCCCCCCCCC/G
rs33502631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892433fOtc : Intron1SNPC CCCC C C T CCCTCC/T
rs33503464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892628fOtc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33503466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892743fOtc : Intron1SNPC CCCC T  CTCCCCTCC/T
rs33503469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9892760fOtc : Intron1SNPA AAAA G AA AAAAGAA/G
rs33503471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9893173fOtc : Intron1SNPG GGGG    GAGGGGAGA/G
rs33499284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9893181fOtc : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33499287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9893212fOtc : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33499289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9893841fOtc : Intron1SNPA AAAA C  ACAAAACAA/C
rs33499292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9894202fOtc : Intron1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
rs33500334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9894510fOtc : Intron1SNPA AAAA C AAAAAAAAAA/C
rs33500337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9894565fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGCGGGGGGC/G
rs33500340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9894679fOtc : Intron1SNPT TTTT C  TCTTTTCTC/T
rs33500343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9895686fOtc : Intron1SNPC CC   T     C CCCC/T
rs33501205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9896370fOtc : Intron1SNPA AAAA G  AGAAAAGAA/G
rs33501207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9896559fOtc : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs33501210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9896601fOtc : Intron1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs33501212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9896759fOtc : Intron1SNPT  TTT T     T TC C/T
rs33501213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9897176fOtc : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs33502245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9897291fOtc : mRNA-UTR1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs33502248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9897597fOtc : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs33502249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9897845fOtc : mRNA-UTR1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33502251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9897910fOtc : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs33503494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:9897940fOtc : mRNA-UTR1SNPA AAA  G AAG AAAGAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory