About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Oprl1
opioid receptor-like 1
MGI:97440

95 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27702499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713070fOprl1 : Locus-Region2SNPTTGGT T GGTGT             T   T    TGGG/T
rs27702498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713100fOprl1 : Locus-Region1SNPT TTT T TTTCT             T   C    TTTC/T
rs8242557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713238rOprl1 : Locus-Region1SNP               T       G              G/T
rs27702497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713310fOprl1 : Locus-Region3SNPTTCCT TTCCTCT             T   T    TCCC/T
rs8242558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713353fOprl1 : Locus-Region1SNP  CCCC  C    C T    C  C         CC   C/T
rs8242559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713356fOprl1 : Locus-Region1SNP  TTTT  T    T C    T  T         TT   C/T
rs8242560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713378fOprl1 : Locus-Region1SNP  CCCCC C    C TC   C  C         CC   C/T
rs8242561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713403fOprl1 : Locus-Region1SNP  GGGGGGG    G AG   G  G         GG   A/G
rs8242562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713567fOprl1 : Locus-Region1SNP  C CC CC    C TC   C  C         CC   C/T
rs8242563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713611fOprl1 : Locus-Region2SNPT TTTTT TTTTTT C    T  T  T   T  TTTCTC/T
rs8242564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181713793fOprl1 : Locus-Region1SNP  A AAAAAA   A TA   A  A         AA   A/T
rs8238422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714019fOprl1 : Locus-Region1SNP  C C    C     G       C         CC   C/G
rs8238423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714130fOprl1 : Locus-Region1SNP  G G    G     A       G         GG   A/G
rs27702496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714140fOprl1 : Locus-Region1SNPG GGG G GGGGG             G   G    GAGA/G
rs27702495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714272fOprl1 : Locus-Region1SNPT TTT T GTTGT                      T TG/T
rs8242565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714344fOprl1 : Locus-Region1SNP  G GGG  G     AG   G  G          G   A/G
rs27702494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714348fOprl1 : Locus-Region1SNPT TTT T TTTCT             T        TTTC/T
rs8242566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714351fOprl1 : Locus-Region1SNP  G GGG GG     AG   G  G         GG   A/G
rs8242567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181714513fOprl1 : Locus-Region12Mixed  - ---  -     G-   -  -          -   -/A/C/G/T
rs27702493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181715188fOprl1 : Locus-Region
Oprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
2SNPG AAG G AAGAG             G   A    GGAA/G
rs8242541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181715651rOprl1 : Intron1SNP  A A   AA   A G    A  A          A   A/G
rs220389678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181715810fOprl1 : Coding-NonSynonymous
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP              C                T      C/T
rs8238424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716134fOprl1 : Intron7Mixed    GGGGG    G -G      G         GG   -/A/C/G/T
rs8238432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716250fOprl1 : Intron1SNP  C C CCC    C TC      C         CC   C/T
rs8238433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716276fOprl1 : Intron5SNPCCCCC CACCACCCCCC      A  C   CA ACCCCA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716416fOprl1 : Intron1SNP  G G   GG     A    G  G         GG   A/G
rs8238454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716563fOprl1 : Intron4SNPCCTTC CCCTCCC  C    T  C  C   C   CCCTC/T
rs8238455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716585fOprl1 : Intron1SNP  G G   AG     G    G  G         GG   A/G
rs8238438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716669rOprl1 : Intron1SNP  C C   T      CC   C  C          C   C/T
rs27702492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716713fOprl1 : Intron3SNPAAGGA  A GAGA             A   G    AGGA/G
rs8238437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716737rOprl1 : Intron1SNP  TTT  TT      AT   T  T          T   A/T
rs8238436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716874rOprl1 : Intron1SNP  GGG  GG      TG   G  G          G   G/T
rs8238435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716923rOprl1 : Intron1SNP    A  AA      GA   A             A   A/G
rs8238434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716929rOprl1 : Intron1SNP    C  CC      TC   C  C          C   C/T
rs8238439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716952fOprl1 : Intron1SNP  T T T TT   T C    T  T         TT   C/T
rs8238440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716991fOprl1 : Intron1SNP  G GGGGGG   G AG   G  G         GG   A/G
rs8238441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181716992fOprl1 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C AC   C  C         CC   A/C
rs27702491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717091fOprl1 : Intron1SNPA AAA A  AAGA             A   G    AAAA/G
rs8238442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717113fOprl1 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A GA   A  A         AA   A/G
rs8238443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717209fOprl1 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A GA   A  A         AA   A/G
rs8238444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717663fOprl1 : Intron1SNP  A AAAAAA   A TA   A  A         AA   A/T
rs8238445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717674fOprl1 : Intron1SNP  T TTTTTT   T CT   T  T         TT   C/T
rs8238446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717703fOprl1 : Intron1SNP  C CCCCCC   C TC   C  C         CC   C/T
rs8238447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717770fOprl1 : Intron1SNP  G GGGGGG   G CG   G  G         GG   C/G
rs8238448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717847fOprl1 : Intron3SNPCCT CCTCCT   T CC   T  C         CC   C/T
rs8238449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717854fOprl1 : Intron1IN-DEL  A AAAAAA   A -A   A  A         AA   -/A
rs8238450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181717855fOprl1 : Intron1IN-DEL  T TTTTTT   T -T   T  T         TT   -/T
rs8238452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718011rOprl1 : Intron
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP  GGG  G G     TG   G  G         GG   G/T
rs8238451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718157rOprl1 : Intron1SNP  TTT  T T     GT   T  T         TT   G/T
rs27702490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718245fOprl1 : Intron1SNPG GGG G  GGTG             G   G    GGGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27702489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718270fOprl1 : Intron3SNPCCTTC TC TCCC             C   C    CTTC/T
rs27702488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718353fOprl1 : Intron3SNPG A G GG AGGG             G   G    GGGA/G
rs8242542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718743fOprl1 : Intron1SNP  A AAAAAA     GA   A  A         AA   A/G
rs8237215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181718929rOprl1 : Coding-Synonymous
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP  G GGGGAG   G GG   G  G         GG   A/G
rs8237216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719001rOprl1 : Coding-Synonymous
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP  TTTTTTCT     CT   T  T         TT   C/T
rs8237217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719133rOprl1 : Coding-Synonymous
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP  G GGGGGG   G AG   G  G          G   A/G
rs8237218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719178fOprl1 : Coding-Synonymous
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP  CCCCCCTC   C CC   C  C         CC   C/T
rs27702487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719370fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNPT TTT T  TTCT                 C    TCTC/T
rs8238463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719613rOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
4SNPGGAAG ?G AGAGA GG   A     G   G   GGAAA/G
rs8238462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719631rOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP  G G G      G AG   G             G   A/G
rs3022944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719661fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
6SNPGGAAG ?G AGAGA GGGAAAAG GGGAGAG G GGAAA/G
rs3022945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719702fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
6SNPTTC T ?TCCTCTC CTTCCCC  TTTCTC  T TTCCC/T
rs8238464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181719940fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
4SNPGGAAGG?GGAGGGA GG   A  G  G   G   GGGGA/G
rs8238465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720029fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
4SNPCCTTC ?CTTCTCT CC   T  C  C   T   CCTTC/T
rs27702486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720124fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
3SNPTTCCT TT CTCT             T   T    TCCC/T
rs8238468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720187rOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1IN-DEL  C CCC CC     C-   C  C         CC   -/C
rs3022946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720273fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
5SNPTTCCT TTTCTTT    TCC CT TTTCTCT T TTTCC/T
rs8238467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720377rOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
4SNPGGAAGGAGAAGAG  AG   A  G  G   A  GGGAAA/G
rs8238466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720395rOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP  C CCCCCC   C AC   C  C         CC   A/C
rs8238469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720548fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP  CCCCCCC    C TC   C  C         CC   C/T
rs8238470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720735fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1IN-DEL  C C    C   C CC   -  C          C   -/C
rs8238471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720769fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP    C T  C   C CC   C  C          C   C/T
rs8238472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720913fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP  G G    G   G A    G  G          G   A/G
rs8238473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181720944fOprl1 : mRNA-UTR
Oprl1 : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP  G G    G   G A    G             G   A/G
rs8238474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721061fOprl1 : Locus-Region1SNP    CC         TC   C  C          C   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721117fOprl1 : Locus-Region3SNPC TTCCC  TCTC  CC   T  C  C   C   CCTTC/T
rs8238476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721165fOprl1 : Locus-Region1SNP    GG         AG   G  G          G   A/G
rs8238477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721178fOprl1 : Locus-Region3SNPCCTTCCC  TCTC  TC   T  C  C   C   CCTTC/T
rs27702485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721436fOprl1 : Locus-Region2SNPTTGGT    GTGT             T        TGGG/T
rs27702484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721499fOprl1 : 514 bp downstream of2SNPAACCA A  CACA             A        A  A/C
rs27702483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721507fOprl1 : 522 bp downstream of2SNPTTCCT T  CTTT             T   T    TCCC/T
rs27702482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721701fOprl1 : 716 bp downstream of2SNPAAG A A   A A             A        AG A/G
rs27702481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721821fOprl1 : 836 bp downstream of3SNPGGCCG C GCGGG             G   G    GGCC/G
rs49856516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181721891fOprl1 : 906 bp downstream of1SNP GA                                   A/G
rs27702480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722150fOprl1 : 1165 bp downstream of2SNPAAGGA    GAGA             A   G    AGGA/G
rs49358466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722278fOprl1 : 1293 bp downstream of1SNP CT                                   C/T
rs27702479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722420fOprl1 : 1435 bp downstream of2SNPC T C T  TC C                 T    C  C/T
rs48182470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722434fOprl1 : 1449 bp downstream of1SNP  T                                   T
rs47119993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722435fOprl1 : 1450 bp downstream of1SNP  A                                   A
rs27702478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722460fOprl1 : 1475 bp downstream of2SNPT A T A  ATAT             T   A    TA A/T
rs27702477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722473fOprl1 : 1488 bp downstream of2SNPT AAT T  ATAT             T   T    TAAA/T
rs52003691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722515fOprl1 : 1530 bp downstream of1SNP  G      G                            G
rs27702476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722547fOprl1 : 1562 bp downstream of2SNPT CCT T  CTCT             T   T    TCCC/T
rs27702475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722677fOprl1 : 1692 bp downstream of2SNPT   T T  CTCT             T   T    TCCC/T
rs27702474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:181722739fOprl1 : 1754 bp downstream of1SNPG GGG G  GGAG             G   G    GGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/26/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory