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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Oprl1 opioid receptor-like 1 MGI:97440 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs27702499 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181447775 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | G | T | T | G | G | T | G | T | T | T | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||
| rs27702498 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181447805 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||
| rs8242557 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181447943 | r | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27702497 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448015 | f | Oprl1 : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | C | C | T | T | T | C | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||
| rs8242558 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448058 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8242559 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448061 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8242560 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448083 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||
| rs8242561 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448108 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||
| rs8242562 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448272 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||
| rs8242563 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448316 | f | Oprl1 : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||
| rs8242564 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448498 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8238422 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448724 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | G | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238423 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448835 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27702496 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448845 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs27702495 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181448977 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||
| rs8242565 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181449049 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||
| rs27702494 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181449053 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8242566 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181449056 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||
| rs8242567 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181449219 | f | Oprl1 : Locus-Region | 12 | Mixed | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | -/A/C/G/T | ||||||||||||||||||||||||||
| rs27702493 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181449893 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | A | A | G | G | A | A | G | A | G | G | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8242541 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181450356 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||
| rs8238424 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181450839 | f | Oprl1 : Intron | 7 | Mixed | G | G | G | G | G | G | - | G | G | G | G | -/A/C/G/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8238432 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181450955 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8238433 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181450981 | f | Oprl1 : Intron | 3 | SNP | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||
| rs8238453 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451121 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs8238454 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451268 | f | Oprl1 : Intron | 3 | SNP | C | C | T | T | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||
| rs8238455 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451290 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||
| rs8238438 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451374 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs27702492 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451418 | f | Oprl1 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | G | A | A | G | A | G | A | A | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8238437 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451442 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8238436 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451565 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||
| rs8238435 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451628 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238434 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451634 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238439 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451657 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8238440 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451696 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||
| rs8238441 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451697 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||
| rs27702491 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451796 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||
| rs8238442 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451818 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8238443 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181451914 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||
| rs8238444 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452368 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8238445 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452379 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8238446 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452408 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8238447 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452475 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||
| rs8238448 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452552 | f | Oprl1 : Intron | 2 | SNP | C | C | T | C | C | T | C | C | T | T | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||
| rs8238449 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452559 | f | Oprl1 : Intron | 1 | IN-DEL | A | A | A | A | A | A | A | A | - | A | A | A | A | A | -/A | ||||||||||||||||||||||
| rs8238450 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452560 | f | Oprl1 : Intron | 1 | IN-DEL | T | T | T | T | T | T | T | T | - | T | T | T | T | T | -/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8238452 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452716 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs8238451 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452862 | r | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||
| rs27702490 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452950 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||
| rs27702489 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181452975 | f | Oprl1 : Intron | 2 | SNP | C | C | T | T | C | T | C | T | C | C | C | C | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27702488 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181453058 | f | Oprl1 : Intron | 2 | SNP | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||
| rs8242542 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181453448 | f | Oprl1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||
| rs8237215 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181453634 | r | Oprl1 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||
| rs8237216 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181453706 | r | Oprl1 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8237217 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181453838 | r | Oprl1 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||
| rs8237218 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181453883 | f | Oprl1 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||
| rs27702487 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454075 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||
| rs8238463 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454318 | r | Oprl1 : mRNA-UTR | 3 | SNP | G | G | A | A | G | ? | G | A | G | A | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||
| rs8238462 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454336 | r | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs3022944 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454366 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 5 | SNP | G | G | A | A | G | ? | G | A | G | A | G | A | G | G | G | A | A | A | A | G | G | G | G | A | G | A | G | G | G | G | A | A | A/G | ||||
| rs3022945 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454407 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 5 | SNP | T | T | C | T | ? | T | C | C | T | C | T | C | C | T | T | C | C | C | C | T | T | T | C | T | C | T | T | T | C | C | C/T | ||||||
| rs8238464 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454645 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 3 | SNP | G | G | A | A | G | G | ? | G | G | A | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||
| rs8238465 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454734 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 3 | SNP | C | C | T | T | C | ? | C | T | T | C | T | C | T | C | C | T | C | C | T | C | C | T | T | C/T | |||||||||||||
| rs27702486 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454829 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 2 | SNP | T | T | C | C | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||
| rs8238468 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454892 | r | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | IN-DEL | C | C | C | C | C | C | C | - | C | C | C | C | -/C | ||||||||||||||||||||||||
| rs3022946 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181454978 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 4 | SNP | T | T | C | C | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | C | C | T | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | T | C | C/T | |||||||
| rs8238467 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455082 | r | Oprl1 : mRNA-UTR | 3 | SNP | G | G | A | A | G | G | A | G | A | A | G | A | G | A | G | A | G | G | A | G | G | G | A | A | A/G | ||||||||||||
| rs8238466 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455100 | r | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||
| rs8238469 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455253 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||
| rs8238470 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455440 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | IN-DEL | C | C | C | C | C | C | - | C | C | -/C | |||||||||||||||||||||||||||
| rs8238471 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455474 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||
| rs8238472 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455618 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238473 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455649 | f | Oprl1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238474 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455766 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238475 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455822 | f | Oprl1 : Locus-Region | 2 | SNP | C | T | T | C | C | C | T | C | T | C | C | C | T | C | C | C | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs8238476 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455870 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs8238477 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181455883 | f | Oprl1 : Locus-Region | 2 | SNP | C | T | T | C | C | C | T | C | T | C | T | C | T | C | C | C | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||
| rs27702485 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:181456141 | f | Oprl1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | G | T | G | T | G | T | T | T | G | G | G/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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