About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Iqsec2
IQ motif and Sec7 domain 2
MGI:3528396

178 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29295559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152142448fIqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC   C C/T
rs29295558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152143275fIqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPT TT   C TTTT      T C/T
rs29295557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152143419fIqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTG GG   T G/T
rs29295556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152143504fIqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT   C C/T
rs29295555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152143529fIqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA T AATA AA   TAA/T
rs29295554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152143858fIqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G  A A AA   A A/G
rs218354350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152148490fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs29295123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152155207fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29295122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152155348fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCGC CC  CGCC/G
rs29295121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152155936fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs29295120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152155958fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AAAA/G
rs29295119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152156344fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs29295118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152157539fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29295117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152157808fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT  TTT   T  T T   TAAA/T
rs29295116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152158253fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs29295115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152158429fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA   GGA/G
rs29295114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152158513fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29294683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152158810fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29294682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152159862fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGGG GG  GGGC/G
rs29294681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152159921fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT G TT T TT    TG/T
rs29294680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152160353fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29294679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152160354fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GG G GG  GGAA/G
rs29294678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152161038fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs29294677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152161636fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs29294676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152162225fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29294675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152162612fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29294674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152162685fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTTT TT  TTTA/T
rs29294243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152162766fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs29294242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152162804fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29294241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152163343fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs29294240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152163531fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29294239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152164759fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs29294238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165123fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs29294237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165194fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCCC CC  CCCA/C
rs29294236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165333fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29294235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165360fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA T AAAA AA  AAAA/T
rs29294234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165402fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  AAAA/C
rs29293853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165415fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs29293852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152165649fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GG G GG  GTGG/T
rs29293851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166095fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGGG GG  GGGC/G
rs29293850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166131fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CCTC/T
rs29293849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166303fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CCTC/T
rs29293848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166333fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGG GG  GGAA/G
rs29293847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166346fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA C AAAA AA  AAAA/C
rs29293846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166704fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTAT TT  TAAA/T
rs29293845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152166917fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CTCC/T
rs29293844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152167125fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAAA/G
rs29293513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152167584fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29293512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152168048fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT T T  T  TCT TT   CTC/T
rs29293511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152168518fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29293510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152168654fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29293509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152168771fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGGG GG  GGGC/G
rs29293508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152168893fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT   CTC/T
rs29293507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152169235fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCCC CC  CCCC/G
rs29293506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152169278fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29293505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152170485fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACA AA  ACAA/C
rs29293504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152170791fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs29297502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152170901fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs29297501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152171115fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs29297500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152171847fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29297499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152171883fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CTCC/T
rs29297498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152173111fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAA  A AATA AA  ATAA/T
rs29297497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152173143fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs29297496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152173269fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCCC CC  CCCC/G
rs29297495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152173296fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs29297494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152173395fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29296933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152173489fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TGTT   TTGT TT  TGGG/T
rs29296932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152174197fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTTT TT  TTTA/T
rs29296931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152174229fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGGG GG  GGGG/T
rs29296930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152174694fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs29296929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152174766fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AA A AA   GAA/G
rs6284382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152175309fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP      G A            A/G
rs6284870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152175395fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
2SNPT TTTTTGGTTGT TT  TGTG/T
rs29296928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152176468fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTT  G TTTT TT  TTTG/T
rs29296927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152176867fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29296926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152176914fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCAC CC  CACA/C
rs29296925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152177180fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs29296924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152177652fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29296553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152177696fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29296552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152178192fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs29296551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152178307fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29296550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152178333fIqsec2 : Locus-Region
Iqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29296549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152178561fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29296548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152178904fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA C AAAA AA  AAAA/C
rs29296547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152179280fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TCTT C TTCT TT  TCCC/T
rs29296546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152179700fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29296545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152179767fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs29296544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152179838fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29296203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152180096fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29296202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152180312fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCGC CC  CGCC/G
rs29296201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152180404fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29296200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152181746fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29296199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152182062fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs29296198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152182314fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GG G GG   AGA/G
rs29296197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152182873fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GG G GG  GAGA/G
rs29296196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152182877fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAA    AATA A   A AA/T
rs29296195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152185112fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TCTT C TTCT TT  TCCC/T
rs6369077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152185984fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP      A T            A/T
rs6369109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152185999fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP      G A            A/G
rs6369128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152186009fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP      T G            G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29296194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152186267fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29295733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152186335fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTG GG  GTGG/T
rs29295732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152186457fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29295731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187202fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CC C CC   TCC/T
rs29295730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187268fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29295729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187545fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AGAA G AA A AA  AGGA/G
rs29295728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187722fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GAGG G GGGG GG  GGGA/G
rs29295727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187878fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29295726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187887fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs29295725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187942fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGCG GG  GCGC/G
rs29295724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152187998fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29295473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152188058fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29295472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152188234fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AGAA A AAAA AA  AAGA/G
rs29295471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152188294fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs29295470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152188656fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29295469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152189165fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29295468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152189530fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs29295467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190077fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT T TT C TT T TT  TCTC/T
rs29295466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190265fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29295465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190377fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29295464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190476fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCAC CC  CACA/C
rs29294983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190556fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCAC CC  CACA/C
rs29294982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190609fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs29294981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152190674fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTAT TT  TATA/T
rs29294980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152191842fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29294979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152192238fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTAT TT  TATA/T
rs29294978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152192276fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs29294977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152192406fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29294976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152192666fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CTCC/T
rs29294975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152193354fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs29294974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152195041fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGCG GG  GCGC/G
rs29294483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152195079fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT   TTC/T
rs29294482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152195205fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs29294481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152195244fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC G  CGC CC  CGCC/G
rs29294480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152195833fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29294479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152195850fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AAAA/G
rs29294478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196124fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CC C CC  CTCC/T
rs29294477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196145fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA A AA G AAGA AA  AGAA/G
rs29294476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196248fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTGT TT  TGTG/T
rs29294475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196587fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs29294474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196618fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29293983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196674fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs29293982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196824fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs29293981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152196910fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs29293980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152197006fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACA AA  ACAA/C
rs29293979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152197077fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs29293978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152197089fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCCC CC  CCCA/C
rs29293977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152197452fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs29293976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152197961fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CACC C CCCC CC  CCAA/C
rs29293975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152198036fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
2SNPTTTCTT C TT T T  CTCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46333765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152198333fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP  C      C       T   C/T
rs48190116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152198334fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNP  C      C       G   C/G
rs29293974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152200600fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29293593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152200643fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs29293592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152200759fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT G TT T TT   GTG/T
rs29293591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152201098fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG   GGTG GG  G GG/T
rs29293590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152201519fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT T TT   TTCT TT  TCTC/T
rs29293589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152201621fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA A AA   AA A AA  AGAA/G
rs29293588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152201795fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT T TT   TTAT TT    TA/T
rs29293587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152202734fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC   CCTC CC  CTCC/T
rs29293586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152203070fIqsec2 : Coding-Synonymous
Stpy : within coordinates of
1SNPA A AA   AAGA AA  AGAA/G
rs29293585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152203864fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA A AA A AAGA AA  AGAA/G
rs29293584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152204382fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT   TTTT TT  TATA/T
rs33850228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152206917fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPC C CC   CCTC  C   TCC/T
rs33850227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152207875fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPG G GG   GGAG GG  GAGA/G
rs33850226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152208898fIqsec2 : Coding-Synonymous
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC C CC C CC  CTCC/T
rs33850225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152211640fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs33850224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152211939fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT T TT T TT  TGTG/T
rs33850013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152211954fIqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPA A AA   AA A AA  AGAA/G
rs33850012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152224151fIqsec2 : mRNA-UTR
Stpy : within coordinates of
1SNPT TCTT C  T T TT   CTC/T
rs33850011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152224371fIqsec2 : mRNA-UTR
Stpy : within coordinates of
1SNPG GG G G  GAG  G   AGA/G
rs33850010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152225491fIqsec2 : Intron
Iqsec2 : Locus-Region
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs33850009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152225563fIqsec2 : Locus-Region
Iqsec2 : Intron
Stpy : within coordinates of
1SNPT TTTT G TTGT TT  TGTG/T
rs33850008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152225746fIqsec2 : 510 bp downstream of
Stpy : within coordinates of
1SNPT TGTT T TTTT TT  TTTG/T
rs33850007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152226064fIqsec2 : 828 bp downstream of
Stpy : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33850006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152226214fIqsec2 : 978 bp downstream of
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTG GG  GTGG/T
rs33850005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152226954fIqsec2 : 1718 bp downstream of
Stpy : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCCC CC  CCCA/C
rs33850004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:152226956fIqsec2 : 1720 bp downstream of
Stpy : within coordinates of
1SNPG GGGG   GGTG GG  GTGG/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory