About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Notch1
notch 1
MGI:97363

233 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29625536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26311667fNotch1 : Locus-Region1SNP AG   A                                         A/G
rs27201843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26312311fNotch1 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C T    C C/T
rs27201842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26312411fNotch1 : Locus-Region1SNPA AAAA   A AATA       A         A      A T    A A/T
rs27201841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26312980fNotch1 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTTT       A         T      T T    T A/T
rs27201840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26313342fNotch1 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGTG       G         G      G T    G G/T
rs27201839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26314451fNotch1 : mRNA-UTR1SNPG GGGG   G GGGG       A         G      G G    G A/G
rs27201838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26314452fNotch1 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   T TTTT       T         T      T C    T C/T
rs27201837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26314556fNotch1 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   G TTTT       T         T      T T    G G/T
rs27201836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26315717fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27201835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26316734fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGCG       G         G      G C    G C/G
rs27201834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26317160fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C T    C C/T
rs27201833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26317162fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   G CCCC       C         C      C C    G C/G
rs27201832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26317179fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27201831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26317626fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27201830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26318056fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT       T         T      T C    T C/T
rs27201829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26318405fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCGC       C         C      C G    C C/G
rs27201828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26318605fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C T    C C/T
rs27201827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26318757fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTAT       T         T      T A    T A/T
rs27201826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26318838fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCGC       C         C      C G    C C/G
rs27201825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26318882fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       A         G      G G    G A/G
rs27201824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26319167fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTGT       T         T      T G    T G/T
rs27201823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26319350fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G A    G A/G
rs27201822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26319546fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       G         A      A G    G A/G
rs27201821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26320067fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT       T         T      T C    T C/T
rs27201820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26321595fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C T    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27201819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26321637fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T         T      T T    A A/T
rs27201818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26321641fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AATA       A         A      A T    A A/T
rs33573603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26321875fNotch1 : Intron1SNP AT   A    T                                    A/T
rs27201817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322147fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       T         C      C C    C C/T
rs27201816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322180fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27201815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322443fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   G TTGT       T         T      T G    T G/T
rs27201814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322498fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C         C      C A    C A/C
rs27201813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322559fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   C GGCG       G         G      G C    G C/G
rs27201812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322610fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27201811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322668fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C T    C C/T
rs27201810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26322861fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGTG       G         G      G T    G G/T
rs27201809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323222fNotch1 : Coding-NonSynonymous2SNPTTCCCCC  C CCCC       C         T      C C    C C/T
rs27201808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323361fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   G AAGA       G         A      A G    G A/G
rs27201807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323616fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A         A      A G    G A/G
rs27201806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323668fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T         T      T C    T C/T
rs27201805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323859fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   G AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27201804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323880fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   A GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27201803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323910fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   G AAGA       G         A      A G    G A/G
rs27201802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26323984fNotch1 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G G    A A/G
rs27201801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324351fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27201800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324367fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       T         C      C C    T C/T
rs27201799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324400fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GG G       A         G      G      A A/G
rs27201798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324464fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   A TTTT                 T      T T    A A/T
rs27201797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324560fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27201796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324641fNotch1 : Intron1SNPC CCCC     CCAC       C         C      C A    C A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27201795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324810fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   A CCCC       C         C      C C    C A/C
rs27201794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26324977fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       A         G      G A    G A/G
rs27201793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325065fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA                 A      A G    G A/G
rs27201792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325093fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC                 C      C C    C C/T
rs27201791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325194fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   C AACA       A         A      A C    A A/C
rs27201790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325690fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C         C      C C    C C/T
rs27201789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325746fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA       A         A      A A    A A/G
rs27201788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325788fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C         C      C T    C C/T
rs27201787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325973fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T         T      T C    T C/T
rs27201786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26325995fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C         C      C T    C C/T
rs27201785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26326127fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       A         G      G G    G A/G
rs27201784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26326414fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   C CCCC       C         C      C C    T C/T
rs27201783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26326417fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   C CCCC       C         C      C T    C C/T
rs29557585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26326566fNotch1 : Intron3SNP ?C   ?    C                                    A/C/G
rs27201782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26326657fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   G CCGC       G         C      C G    G C/G
rs27201781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26326840fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27201780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327167fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   G  AGA       A         A      A G    A A/G
rs27201779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327205fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   C TT T       C         T      T T    C C/T
rs27201778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327210fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27201777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327344fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G         G      G A    A A/G
rs27201776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327466fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA       A         A      A A    T A/T
rs27201775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327577fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT       T         T      T C    T C/T
rs27201774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327708fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   G AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27201773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327815fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27201772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327854fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   A CCCC       C         C      C C    C A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27201771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327912fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   A TTTT       T         T      T T    T A/T
rs27201770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26327972fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27201769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328018fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCAC       C         C      C A    C A/C
rs27201768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328333fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27184067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328572fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCAC       C         C      C C      A/C
rs27184066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328618fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   T  TCT       T         T      T C    T C/T
rs27184065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328648fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27184064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328758fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27184063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328860fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G A    G A/G
rs27184062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26328937fNotch1 : Intron2SNPTTCCTTT  C CTCT       T         T      T C    T C/T
rs27184061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329166fNotch1 : Intron2SNPGGCCGGG  C CGCG       G         G      G C    G C/G
rs29904356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329244fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP AA   G                                         A/G
rs32956078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329431fNotch1 : Intron1SNP TA                                             A/T
rs27184060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329463fNotch1 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA       A         A      A G    A A/G
rs27184059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329599fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C         C      C C    C C/T
rs27184058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329701fNotch1 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC   C CCCC       C         C      C T    C C/T
rs27184057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329705fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27184056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329753fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C C    C C/T
rs27184055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329888fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGTG       G         G      G G    G G/T
rs27184054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26329901fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT       T         T      T T    T C/T
rs33192961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26330088fNotch1 : Intron1SNP CT   C    T                                    C/T
rs27184053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26330568fNotch1 : Intron2SNPAAGGAAA  A GAAA       A         A      A A    A A/G
rs33380377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26330650fNotch1 : Intron1SNP CT   C    T                                    C/T
rs27184052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26330767fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGTG       G         G      G G    G G/T
rs27184051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331021fNotch1 : Intron2SNPTTGGTT   G GTGT       T         T      T G    T G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27184050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331204fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C         C      C T    C C/T
rs27184049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331220fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G G    G A/G
rs27184048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331290fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   T CC C       C         C      C T    C C/T
rs27184047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331313fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27184046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331359fNotch1 : Intron1SNPG GGGG   C GGGG       G         G      G C    G C/G
rs27184045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331366fNotch1 : Intron1SNPG GGGG     GGGG       G         G      G A    G A/G
rs27184044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331446fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C C    C C/T
rs27184043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331561fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C C    C C/T
rs27184042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331573fNotch1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C         C      C A    C A/C
rs27184041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331720fNotch1 : Intron1SNP    TT   T  TCT       T                T C    T C/T
rs27184040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331774fNotch1 : Intron1SNP    TT   C  TCT       T                T C    T C/T
rs27184039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331841fNotch1 : Intron1SNP    TT   C  TCT       T                T C    T C/T
rs27184038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331856fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CCC       C                C T    C C/T
rs33096970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26331899fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP GA   G    A                                    A/G
rs27184037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26332051fNotch1 : Intron1SNP    TT      T T       T                T C    T C/T
rs27184036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26332060fNotch1 : Intron1SNPT TTAA     TA A       A         T      A      A A/T
rs27184035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26332276fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CTC       C                C T    C C/T
rs29579962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26332688fNotch1 : Intron1SNP  G   A    G                                    A/G
rs27184034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26332777fNotch1 : Intron1SNP  A AA   G  AAA       A                A A    A A/G
rs27184033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26332795fNotch1 : Intron2SNP GT GGG  G TGTG       G                G T    G G/T
rs27184032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333070fNotch1 : Intron1SNP    TT   T  TGT       T                T      T G/T
rs27184031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333100fNotch1 : Intron1SNP    GG   A  GGG       G                G G    G A/G
rs27184030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333134fNotch1 : Intron1SNP    AA   G  AGA       A                A G    A A/G
rs27184029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333416fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP    AA   A  AGA       A                A G    A A/G
rs27184028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333479fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP    GG   G  GAG       G                G A    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27184027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333522fNotch1 : Intron1SNP    AA   A  AGA       A                A G    A A/G
rs27184026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333768fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP    GG   A  G G       G                G A    G A/G
rs27184025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333816fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP    TT   T  TCT       T                T C    T C/T
rs27184024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26333909fNotch1 : Intron1SNP    CC   T  CTC       C                C T    C C/T
rs27184023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26334032fNotch1 : Intron1SNP    GG   A  GGG       G                G G    G A/G
rs6153797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26334176fNotch1 : Coding-Synonymous2SNP  A AAA  AG AGA       A                A G    A A/G
rs27184022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26334763fNotch1 : Intron1SNP    TT   C  T T       T                T C    T C/T
rs27184021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26334989fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP  C CC   T  CCC       C                C C    C C/T
rs33718174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26335183fNotch1 : Intron1SNP AG   A    G                                    A/G
rs27184020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26335303fNotch1 : Intron1SNP    AA   G  AAA       A                A A    A A/G
rs29566256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26335702fNotch1 : Intron1SNP TC        C                                    C/T
rs27184019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26335737fNotch1 : Intron2SNP CT TT   C TTCT       C                T C    T C/T
rs33655076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26335775fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP AG        G                                    A/G
rs27184018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26335927fNotch1 : Intron2SNP CT TT   C  TCT       C                T C    T C/T
rs33516848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336516fNotch1 : Coding-Synonymous1SNPG A   G    A                                    A/G
rs27184017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336642fNotch1 : Coding-Synonymous2SNPAAG GGG  G GGGG       A                G G    G A/G
rs32858568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336746fNotch1 : Intron1SNPAAC   C    C                                    A/C
rs32987198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336775fNotch1 : Intron1SNPGGC   C    C                                    C/G
rs27184016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336909fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CTC       C                C C    C C/T
rs29864214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336944fNotch1 : Intron1SNPTTC   C    C                                    C/T
rs29502095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336956fNotch1 : Intron1SNPTTC   C    C                                    C/T
rs33071780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336965fNotch1 : Intron1SNPGGA   A    A                                    A/G
rs27184015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336986fNotch1 : Intron1SNP     A   A  AGA       A                  A    A A/G
rs33403022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26336999fNotch1 : Intron1SNPGGA   A    A                                    A/G
rs29953743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26337436fNotch1 : Intron1SNP CT   C    T                                    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33518677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26337694fNotch1 : Intron1SNP  G   T    G                                    G/T
rs27184014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26338088fNotch1 : Intron1SNP    GG   A  GGG       G                G G    G A/G
rs29912295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26338252fNotch1 : Intron1SNPGGA        A                                    A/G
rs6227113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26338462fNotch1 : Intron4SNPGGAAAAAAAGGAAGAAAAAAGAGAAAAAAAAGGAGGGGAAGGAAGAAAA/G
rs27184013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26339130fNotch1 : Intron2SNP TT CCC  T TTTC       T                T T    T C/T
rs27184012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26339384fNotch1 : Intron1SNP    GG   G  GCG       G                G C    G C/G
rs27184011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26339495fNotch1 : Intron1SNP  A AA   C  AAA       A                A A    A A/C
rs27184010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26339756fNotch1 : Intron1SNP    GG   A  GGG       G                G G    G A/G
rs27184009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26339828fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP    AA   G  AAA       A                A A    A A/G
rs27184008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26340029fNotch1 : Coding-Synonymous1SNP    CC   T  CCC       C                C C    C C/T
rs27184007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26340179fNotch1 : Intron1SNP    GG   T  GGG       G                G G    G G/T
rs27184006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26340199fNotch1 : Intron1SNP    TT   G  TTT       T                T T    T G/T
rs27184005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26340431fNotch1 : Intron1SNP    CC   A  CCC       C                C C    C A/C
rs27184004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26340639fNotch1 : Intron1SNP    AA   G  AAA       A                A A    A A/G
rs27184003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26341476fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CCC       C                C T    C C/T
rs27184002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26341838fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CGC       C                C G    C C/G
rs27184001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26341861fNotch1 : Intron1SNP    TT   C  TTT       T                T T    T C/T
rs27184000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26342037fNotch1 : Intron1SNP    GG   G  GTG       G                G G    G G/T
rs27183999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26342052fNotch1 : Intron1SNP    AA   G  AAA       A                A A    A A/G
rs27183998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26342193fNotch1 : Intron1SNP    GG   G  GAG       G                G G    G A/G
rs27183997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26342978fNotch1 : Intron1SNP         C   G        G                  G      C/G
rs27183996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26343771fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CCC       C         C      C T    C C/T
rs27183995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26343784fNotch1 : Intron1SNP    TT   T  TTT       C         C      T T    T C/T
rs27183994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26343816fNotch1 : Intron1SNP     A   A   TA       A         A      A T    A A/T
rs27183993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26343990fNotch1 : Intron1SNP         C   GC       C         C      C C    C C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33616289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26344052fNotch1 : Intron1SNP CC   T    C                                    C/T
rs27183992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26344095fNotch1 : Intron1SNP    CC   T  CTC       C         C      C T    C C/T
rs27183991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26344263fNotch1 : Intron1SNP         T   C        C         C      C C    C C/T
rs27183990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345235fNotch1 : Intron2SNPAAG   A  G G G        A         A      A G      A/G
rs27183989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345498fNotch1 : Intron2SNPAAG AA   G GAGA       A         A      A G    A A/G
rs33484043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345537fNotch1 : Intron1SNPTTG        G                                    G/T
rs33286106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345597fNotch1 : Intron1SNPAAT        T                                    A/T
rs32999271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345630fNotch1 : Intron1SNPTTC        C                                    C/T
rs29537849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345639fNotch1 : Intron1SNPAAG        G                                    A/G
rs27183988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345653fNotch1 : Intron1SNP     C   T  CC        C         C      C C    C C/T
rs27183987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345850fNotch1 : Intron2SNP AG   A  G G GA       A         A      A G      A/G
rs27183986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26345971fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CAC       C         C      C A    C A/C
rs27183985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346028fNotch1 : Intron1SNP    G    A   A        G         G      G A    G A/G
rs32887498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346068fNotch1 : Intron1SNP GA   G    A                                    A/G
rs33339681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346144fNotch1 : Intron1SNP GA   G    A                                    A/G
rs32977428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346193fNotch1 : Intron1SNP AC   A    C                                    A/C
rs27183984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346261fNotch1 : Intron1SNP         G   A        G                  A    A A/G
rs29814599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346283fNotch1 : Intron1SNP TG   T    G                                    G/T
rs33618079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346349fNotch1 : Intron1SNP CT   C    T                                    C/T
rs27183983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346892fNotch1 : Intron1SNP         T   C        C         C      C C    C C/T
rs27183982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26346961fNotch1 : Intron2SNPG A GG   A AGAG       G         G      G A    G A/G
rs27183981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26347087fNotch1 : Intron1SNP    CC   T   T        C         C      C      C C/T
rs27183980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26347373fNotch1 : Intron1SNP    AA   C   C        A         A      A C    A A/C
rs27183979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26347765fNotch1 : Intron1SNP    CC   C  CTC       C         C      C T    C C/T
rs33500688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26348033fNotch1 : Intron1SNPC T   C    T                                    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27183978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26348083fNotch1 : Intron1SNP    TT   C  TCT       T         T      T C    T C/T
rs27183977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26348118fNotch1 : Intron2SNPA G AAA  G GAGA                 A        G    A A/G
rs27183976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26348290fNotch1 : Intron1SNP         T   T        C         C      C T      C/T
rs27183975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26348573fNotch1 : Intron1SNP    GG   A  GAG       G         G      G A    G A/G
rs27183974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26349062fNotch1 : Intron1SNP         G   G        G         G        A      A/G
rs32954459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26349065fNotch1 : Intron1SNPCCT        T                                    C/T
rs33486620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26349418fNotch1 : Intron1SNPTTT   C    T                                    C/T
rs29961946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26349431fNotch1 : Intron1SNPTTT   A    T                                    A/T
rs29865428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26349655fNotch1 : Intron1SNPC     T    T                                    C/T
rs29505553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26349745fNotch1 : Intron1SNPC     G    C                                    C/G
rs27183973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26350213fNotch1 : Intron1SNP    GG   G  GGG                        G A    G A/G
rs27183972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26350293fNotch1 : Intron1SNP     G   A  GG        G         G      G G    G A/G
rs27183971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26350555fNotch1 : Intron2SNPGGG TTT  G  TGT       G         G      T G    T G/T
rs27183970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26350662fNotch1 : Intron1SNP     C   T  CC        C         C      C C      C/T
rs33201851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26351348fNotch1 : Intron1SNP  T        T                                    T
rs27183969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26351634fNotch1 : Intron1SNP         C   AA       C         C        A      A/C
rs29500331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26351680fNotch1 : Intron1SNP  A   G                                         A/G
rs27183968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26351730fNotch1 : Intron2SNP CC   T  C  TT        C                T C      C/T
rs27183967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26352042fNotch1 : Intron1SNP    AA   G  AAA       A         A      A G    A A/G
rs27183966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26352064fNotch1 : Intron1SNP     G   G   AG       G         G      G G    G A/G
rs27183965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26352429fNotch1 : Intron1SNP    TT   A  TTT       T         T      T T    T A/T
rs27183964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26353083fNotch1 : Intron1SNP         C   C        T         T      T C      C/T
rs27183963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26353298fNotch1 : Intron1SNP    CC   T  CC        C         C      C C    C C/T
rs27183962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26353398fNotch1 : Intron1SNP    TT   G  TGT       T         T      T G    T G/T
rs27183961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26353576fNotch1 : Intron1SNPT TTTT   C  TCT       T         T      T C    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29763068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26353619fNotch1 : Intron1SNPGGG   A                                         A/G
rs29952953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26354321fNotch1 : Intron1SNPCCC   T    C                                    C/T
rs33681075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26354572fNotch1 : Intron1SNPCCT   T    T                                    C/T
rs29540559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26354596fNotch1 : Intron1SNPTTA   T    A                                    A/T
rs32903363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26356320fNotch1 : Intron1SNP AC   C    C                                    A/C
rs33380527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26356930fNotch1 : Intron1SNP CA        A                                    A/C
rs33683971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26358969fNotch1 : Intron1SNPGGA   A    A                                    A/G
rs33444546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:26359569fNotch1 : Locus-Region1SNPGGT   T    T                                    G/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory