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Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Nkx2-5
NK2 homeobox 5
MGI:97350

54 matching SNPs displayed
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Legend
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SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108434050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : 1717 bp downstream of
1SNP          T  C  C/T
rs47569419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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2SNPT TTTT TTTCTTCCCC/T
rs108501868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP          A  G  A/G
rs108064355
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1SNP          G  G  G
rs107898782
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Hst4 : within coordinates of
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1SNP          C  T  C/T
rs49815481
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2SNPA AAAA AAAGA GGGA/G
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : 1025 bp downstream of
1SNPA AAAA AAA A  GGA/G
rs107816581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : 901 bp downstream of
1SNP          G  A  A/G
rs33620859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : 826 bp downstream of
1SNPGGG   C         C/G
rs108310362
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1SNP          T  G  G/T
rs108271557
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1SNP          A  G  A/G
rs108201891
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Nkx2-5 : 731 bp downstream of
1SNP          A  C  A/C
rs260629901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          T  C  C/T
rs108401712
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          G  A  A/G
rs108099558
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          A  G  A/G
rs108634101
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          T  G  G/T
rs108369339
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          C  T  C/T
rs107680112
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Nkx2-5 : mRNA-UTR
1SNP          G  A  A/G
rs107981607
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Nkx2-5 : mRNA-UTR
1SNP          A  G  A/G
rs107772827
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Nkx2-5 : mRNA-UTR
1SNP          C  C  C
rs108811788
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Nkx2-5 : Coding-Synonymous
1SNP          C  T  C/T
rs108299684
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Nkx2-5 : Intron
1SNP          C  G  C/G
rs108710534
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Nkx2-5 : Intron
1SNP          A  G  A/G
rs108785099
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Nkx2-5 : Intron
1SNP          C  T  C/T
rs108933116
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Nkx2-5 : Intron
1SNP          C  T  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs107814951
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Nkx2-5 : Coding-NonSynonymous
1SNP          G  T  G/T
rs263011629
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Nkx2-5 : Coding-Synonymous
1SNP          A  G  A/G
rs224046247
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rs108199097
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Nkx2-5 : Locus-Region
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rs108154748
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rs108450216
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rs107696307
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Nkx2-5 : Locus-Region
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rs108483602
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          G  A  A/G
rs229834141
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          G  A  A/G
rs108829723
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Nkx2-5 : Locus-Region
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rs108857430
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Nkx2-5 : Locus-Region
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rs108108163
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          A  C  A/C
rs246998521
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1SNP          A  G  A/G
rs107872250
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1SNP          T  C  C/T
rs108209009
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1SNP          A  G  A/G
rs108691197
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1SNP          T  C  C/T
rs213830284
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1SNP          A  G  A/G
rs107614135
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1SNP          G  A  A/G
rs108318247
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          G  G  G
rs107697444
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1SNP          G  A  A/G
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1SNP          T  C  C/T
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          G  C  C/G
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1SNP          C  C  C
rs237138483
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1SNP          G  A  A/G
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1SNP          G  G  G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108695829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          C  A  A/C
rs108299656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          A  C  A/C
rs107661476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          A  T  A/T
rs229068139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Hst4 : within coordinates of
Nkx2-5 : Locus-Region
1SNP          G  A  A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory