About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Plin2
perilipin 2
MGI:87920

75 matching SNPs displayed
Exclude SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28111077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86301167fPlin2 : Locus-Region1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs28111076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86301516fPlin2 : Locus-Region1SNP    T  T   C TTTCTC/T
rs31786390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302146fPlin2 : Locus-Region1SNP TT   G  T        G/T
rs28111075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302404fPlin2 : Locus-Region1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs28111074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302438fPlin2 : Locus-Region1SNPA AAAA A AAGAAAA AA/G
rs32345591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302440fPlin2 : Locus-Region1SNPGGG   A  G        A/G
rs28111073
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302528fPlin2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs13473283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302713rPlin2 : mRNA-UTR2SNP?G?CCCCC ?CGCCCCGCC/G
rs28111071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302825fPlin2 : mRNA-UTR1SNP  T        CT TTCTC/T
rs28111070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86302882fPlin2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA A AATAAAATAA/T
rs28111069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303009fPlin2 : Coding-Synonymous1SNPA AGAA G AGGGAGGGGA/G
rs28111068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303408fPlin2 : Intron1SNPA A AA A AAGAAA GAA/G
rs28095167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303439fPlin2 : Intron1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs31999974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303500fPlin2 : Intron1SNP  G   T  G        G/T
rs32842989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303503fPlin2 : Intron1SNP  T   A  T        A/T
rs32415284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303513fPlin2 : Intron1SNP  C   A           A/C
rs32006109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303524fPlin2 : Intron1SNP  T   C           C/T
rs32010507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303546fPlin2 : Intron1SNP  G   A           A/G
rs28095166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303645fPlin2 : Intron1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs28095165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303717fPlin2 : Intron1SNPC CCCC C CC CCCCGCC/G
rs28095164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303759fPlin2 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs28095163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303838fPlin2 : Intron1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs28095162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86303887fPlin2 : Intron1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs32469469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304012fPlin2 : Intron1SNPTTT   G           G/T
rs3691335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304077fPlin2 : Intron2SNPGGG  GC           C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31908377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304124fPlin2 : Intron1SNPCCC   A           A/C
rs28095161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304650fPlin2 : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs28095160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304658fPlin2 : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs28095159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304677fPlin2 : Intron1SNPC CCCC A CCACCCCACA/C
rs28095158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304690fPlin2 : Intron1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs28095157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304734fPlin2 : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs32906243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304972fPlin2 : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs33036447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86304994fPlin2 : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs28095156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86305240fPlin2 : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAGAA/G
rs28095155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86305778fPlin2 : Intron1SNPT TTTT C TT TTTT TC/T
rs28095154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86305824fPlin2 : Intron1SNPC CCCC T CC CCCC CC/T
rs28095153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86305924fPlin2 : Intron1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs28095152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86305998fPlin2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs28095151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86306436fPlin2 : Intron1SNPC C CC T C TTCTTTTC/T
rs28095150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86306490fPlin2 : Intron1SNPG AG G A   AG AGAGA/G
rs28095149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86308143fPlin2 : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs28095148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86308163fPlin2 : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs28095144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86309556fPlin2 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs6375225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86309625fPlin2 : Intron1SNP      A T         A/T
rs6376178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86309752fPlin2 : Intron1SNP      A C         A/C
rs28095143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86309934fPlin2 : Intron1SNPT TTTT T TTGTTTTGTG/T
rs28095142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310045fPlin2 : Intron1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs28095141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310056fPlin2 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs28095140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310086fPlin2 : Intron1SNPG GGGG T GGTGGGGTGG/T
rs28095139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310115fPlin2 : Intron1SNPT TTT  C TTCTTTTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28095138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310127fPlin2 : Intron1SNPT TTTT G TTGTTTTGTG/T
rs28095137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310214fPlin2 : Intron2SNPAAACACCC ACCCACCCCA/C
rs28095136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310225fPlin2 : Intron2SNPTTTCT CC TCCCTCCCCC/T
rs28095135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310249fPlin2 : Intron1SNPA AAAA G AA AAAAGAA/G
rs28095134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310534fPlin2 : Intron1SNPG GGGG T GGTGGGGTGG/T
rs28095133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86310671fPlin2 : Intron1SNPG GGGG   GGAGGGGAGA/G
rs28095132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86311029fPlin2 : Intron1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs32579306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86311608fPlin2 : Intron1SNP TT   C  T        C/T
rs28095131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86312400fPlin2 : Intron1SNP  T TT G T        G/T
rs28095130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86312472fPlin2 : Intron1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs31794255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86313458fPlin2 : Intron1SNP  A   G  A        A/G
rs28095129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86314093fPlin2 : Intron1SNPT T T  G TT TTTT TG/T
rs13473286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86314296rPlin2 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs13473285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86314329rPlin2 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs6204980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86314757fPlin2 : Intron1SNP      G C         C/G
rs6205607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86314885fPlin2 : Intron1SNP      C T         C/T
rs6205643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86314909fPlin2 : Intron1SNP      A C         A/C
rs6206743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315117fPlin2 : Intron2SNPA AAAAAGGAAAAAAAAAA/G
rs28095128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315133fPlin2 : Intron1SNPG GGGG G GGTGGGGTGG/T
rs6207151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315161fPlin2 : Intron1SNP      G T         G/T
rs32451504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315214fPlin2 : Intron1SNPA A   T  A        A/T
rs6207743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315273fPlin2 : Intron2SNPA AAAAAGGAAGAAAAGAA/G
rs28095127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315365fPlin2 : Intron1SNPT TT     TTCTTTTCTC/T
rs28095126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315374fPlin2 : Intron1SNP    C  C  T TC TCTC/T
rs32193223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:86315554fPlin2 : Intron1SNPC C   G  C        C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory