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Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Jup
junction plakoglobin
MGI:96650

103 matching SNPs displayed
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Legend
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SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29390404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Corn2 : within coordinates of
Jup : 1441 bp downstream of
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stpm : within coordinates of
3SNP TC   T  T   T  C   C/T
rs27072860
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1SNPC CCCC T CCCC CC C CC/T
rs29392141
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Jup : 1166 bp downstream of
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stpm : within coordinates of
3SNP CA   C      C  A   A/C
rs27072859
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Jup : 983 bp downstream of
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4SNPGGCCGGGC GGGGGGGCG GC/G
rs29464330
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Jup : Locus-Region
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2SNP T    G             G/T
rs27072858
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Jup : mRNA-UTR
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1SNPC CCCC   CCTC CC C CC/T
rs27072857
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Jup : mRNA-UTR
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1SNPA AAAA   AATA AA A AA/T
rs258799084
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Jup : mRNA-UTR
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1SNP             G  A   A/G
rs6397691
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2SNP      A C    A  C   A/C
rs234394557
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Jup : Intron
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1SNP             C  T   C/T
rs249320387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Jup : Intron
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1SNP             G  A   A/G
rs218292996
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Jup : Intron
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1SNP             G  A   A/G
rs238734199
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Jup : Intron
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1SNP             T  G   G/T
rs265149052
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Jup : Intron
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1SNP             G  A   A/G
rs29400064
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Jup : Intron
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3SNPT A   T  T   T  A   A/T
rs52606820
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Jup : Intron
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2SNP GA      G   G  A   A/G
rs3676321
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Jup : Intron
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3SNP GA  GA  G   G  A   A/G
rs29461403
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Jup : Intron
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2SNPGGA      G          A/G
rs29408384
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Jup : Intron
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1SNPCCA      C          A/C
rs27072856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Jup : Intron
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3SNPGGA GGG  GGGGGGGAG GA/G
rs50236742
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Jup : Intron
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2SNP  C      T   T  C   C/T
rs29451365
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Jup : Intron
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3SNPC T   C  C   C  T   C/T
rs29425306
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Jup : Intron
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3SNP  T   C  C   C  T   C/T
rs27072855
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Jup : Intron
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1SNPT TTTT   TTCT TT T TC/T
rs45876800
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Corn2 : within coordinates of
Jup : Intron
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2SNP  G      G   G  A   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51021252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP AT                 A/T
rs27072854
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1SNPT TT T    TCT TT T TC/T
rs27072853
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1SNPC CCCC   CCTC CC C CC/T
rs29442652
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2SNP  T   A  A   A  T   A/T
rs29463888
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3SNP  C   T  T   T  C   C/T
rs27072852
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1SNPT TTTT   TTCT TT T TC/T
rs27072851
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Jup : Intron
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1SNPT TTTT   TTGT TT T TG/T
rs29470110
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Jup : Intron
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rs27072850
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Jup : Coding-Synonymous
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3SNPG AGGGG  GGGG GG G GA/G
rs27072849
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1SNP  CC C    CTC CC CT C/T
rs29383949
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Jup : Intron
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3SNP TC   T  T   T  C   C/T
rs29388926
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2SNP TC   T  T          C/T
rs6296744
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Jup : Intron
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2SNP  G  GG AGGA     GA A/G
rs234486628
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1SNP             C  G   C/G
rs13469625
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Jup : Coding-Synonymous
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1SNP  A  A A AA A  A AGAA/G
rs29465576
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1SNP CG      C          C/G
rs249000973
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Corn2 : within coordinates of
Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
1SNP             G  C   C/G
rs29394633
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Jup : Intron
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1SNP CA      C          A/C
rs218000074
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Jup : Intron
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1SNP             C  T   C/T
rs13469626
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Corn2 : within coordinates of
Jup : Coding-NonSynonymous
Jup : Coding-Synonymous
Mhdadsk9 : within coordinates of
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3SNP     A   AA  A  C C A/C
rs29414247
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Jup : Intron
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2SNP CT   C  C          C/T
rs29469320
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Jup : Intron
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2SNPGGC   G  G          C/G
rs29476217
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Jup : Intron
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3SNP AG   A  A   A  G   A/G
rs29406543
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2SNP TC   T  T          C/T
rs29418117
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Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
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2SNP AC   A  A          A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29405107
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Corn2 : within coordinates of
Jup : Intron
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3SNP CT   C  C   C  T   C/T
rs245634076
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Jup : Intron
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nmf148 : within coordinates of
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1SNP             G  A   A/G
rs266204752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Jup : Intron
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1SNP             C  T   C/T
rs29394073
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
2SNP GA   G             A/G
rs223265345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Corn2 : within coordinates of
Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
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1SNP             T  C   C/T
rs29439045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Jup : Intron
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2SNP TC   T             C/T
rs6368824
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Jup : Intron
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1SNP      C T           C/T
rs6368882
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Jup : Intron
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1SNP      A G           A/G
rs6272953
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1SNP      A G           A/G
rs49896372
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Jup : Intron
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2SNP T           T  C   C/T
rs256481120
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1SNP             T  G   G/T
rs27072847
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Jup : Intron
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1SNPG GG   A  GAG G  G  A/G
rs27072846
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Jup : Intron
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4SNPA G  AA      AA G   A/G
rs29399134
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Jup : Intron
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2SNPAAG   A             A/G
rs29448777
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Jup : Intron
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3SNPGGA   G      G  A   A/G
rs27072845
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1SNPT T  T G TTG  TT TG G/T
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2SNPA G   A  A          A/G
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2SNPC T   C  C          C/T
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2SNPGGA   G             A/G
rs29468853
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3SNPAAG   A      A  G   A/G
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Jup : Intron
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2SNPAAG   A  A          A/G
rs27072844
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Jup : Intron
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3SNPCCT CCCC CCCC CC CC C/T
rs27072843
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Jup : Intron
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1SNPC    C T  C C CC C  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27072842
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Jup : Intron
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2SNPGGA  GG  GGAG GG GA A/G
rs29394517
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Jup : Intron
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2SNPAAG   A  A          A/G
rs27072841
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Jup : Intron
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3SNPTTC  TT  TT   T     C/T
rs29420089
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Jup : Intron
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1SNP  C   T  T          C/T
rs27072840
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Jup : Intron
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4SNPA G  AAG  A  AAAGAG A/G
rs252157159
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Jup : Intron
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1SNP             G  A   A/G
rs29386325
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Jup : Intron
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2SNPGGA   G             A/G
rs27072839
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Jup : Intron
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3SNPTTC  TT  TTC  TT T  C/T
rs29444768
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Jup : Intron
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2SNP CT   C  C          C/T
rs27072838
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Jup : Intron
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3SNPAAGAAA G AAGA AA AG A/G
rs29407423
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Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
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2SNP  A   T  T          A/T
rs217213094
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Jup : Intron
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1SNP             C  G   C/G
rs29468529
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Jup : Intron
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2SNP  G   A  A   A  G   A/G
rs243223115
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Jup : Intron
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1SNP             T  G   G/T
rs29414691
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Jup : Intron
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2SNP GT   G  G          G/T
rs27072837
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Jup : Intron
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1SNPC C  C    CCC CC CT C/T
rs212184526
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Jup : Intron
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1SNP             G  A   A/G
rs29440245
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Jup : Intron
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2SNP  A      T          A/T
rs27072836
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Jup : Intron
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nmf148 : within coordinates of
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1SNPC C  C C  CG  CC CG C/G
rs27072835
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Jup : Intron
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4SNPAAG AAAG AA AAAAGAG A/G
rs29410868
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Jup : Intron
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3SNPTTC   T  T   T  C   C/T
rs29448555
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Corn2 : within coordinates of
Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
2SNPA G   A  A          A/G
rs27072834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:100397607favc6 : within coordinates of
Corn2 : within coordinates of
Jup : Intron
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
4SNPA G  AAG AAGAAAAGAG A/G
rs29384582
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Chr11:100397720favc6 : within coordinates of
Corn2 : within coordinates of
Jup : mRNA-UTR
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nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
3SNP AG      A   A  G   A/G
rs29444034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:100399014favc6 : within coordinates of
Corn2 : within coordinates of
Jup : Locus-Region
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
2SNP AG      A   A  G   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29396878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:100399175favc6 : within coordinates of
Corn2 : within coordinates of
Jup : Locus-Region
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
1SNP GA      G          A/G
rs27072833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:100399309favc6 : within coordinates of
Corn2 : within coordinates of
Jup : Locus-Region
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
1SNP  G  G C    C GG    C/G
rs27072832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:100399496favc6 : within coordinates of
Corn2 : within coordinates of
Jup : Locus-Region
Mhdadsk9 : within coordinates of
nmf148 : within coordinates of
stpm : within coordinates of
1SNPG G  G    G G GG GA A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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