About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Itk
IL2 inducible T cell kinase
MGI:96621

268 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26951410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46137097fItk : Locus-Region1SNPC CCCC   T  C C       C        C           C C/T
rs26951409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46138251fItk : Locus-Region1SNPC C CC   C CC C       C        C           T C/T
rs26951408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46138332fItk : Locus-Region1SNPC CCCC   T CC C       C        C           C C/T
rs29397284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46138602fItk : Locus-Region1SNP TT   C    T                                 C/T
rs26951407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46139069fItk : mRNA-UTR1SNPC  C C   C  C C       C        C           T C/T
rs26951406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46139432fItk : mRNA-UTR1SNPT T  T   T  T T       T        T           A A/T
rs26951405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46139894fItk : mRNA-UTR1SNPG GGGG   A GG G       G        G    G G    G A/G
rs26951404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46139906fItk : mRNA-UTR1SNPG GGGG   A GGGG       G        G    G G    G A/G
rs26951403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46139966fItk : mRNA-UTR1SNPT TTTT   G TTGT       T        T    T T    T G/T
rs26951402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46139989fItk : mRNA-UTR1SNPT TTTT   G TT T       T        T    T        G/T
rs26951401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46140138fItk : mRNA-UTR1SNPG GGGG   G GGGG       G        G    G A    G A/G
rs29456036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46140570fItk : mRNA-UTR1SNPTT    A    T                                 A/T
rs26951400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46140576fItk : mRNA-UTR1SNPC CCCC   C CC C       C        C    C T    C C/T
rs29469192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46140789fItk : mRNA-UTR1SNPTT    C    T                                 C/T
rs26951399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46140826fItk : mRNA-UTR1SNPC CCCC   A CC C       C        C    C A    C A/C
rs26951398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46141082fItk : Intron1SNPC CTCC   T  T C       C        C    C T    C C/T
rs26951397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46141435fItk : Intron1SNPG GGGG     GG G       G        G    G A    G A/G
rs26951396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46141489fItk : Intron1SNPC  C C   C CC C       C        C    C G    C C/G
rs26951395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46141892fItk : Intron1SNPC CCCC   A CC C       C        C    C A    C A/C
rs26951394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46141916fItk : Intron1SNPT TTTT   C TT T       T        T    T T    T C/T
rs26951393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46141947fItk : Intron1SNPA AAAA   G  A A       A        A    A G    A A/G
rs29391371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143053fItk : Intron1SNP AA   T    A                                 A/T
rs29444727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143303fItk : Intron1SNP CC   T    C                                 C/T
rs29473565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143316fItk : Intron1SNP AA   G    A                                 A/G
rs29459659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143348fItk : Intron1SNP GG   A    G                                 A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29411952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143380fItk : Intron1SNP CC   A    C                                 A/C
rs29435151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143413fItk : Intron1SNP CC   G    C                                 C/G
rs29420464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143549fItk : Intron1SNP TT   G    T                                 G/T
rs26951392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143734fItk : Intron1SNPA AAAA   A AA A       A        A      G    A A/G
rs26951391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46143961fItk : Intron1SNP  CTCT        T                       T      C/T
rs26951390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46144040fItk : Intron1SNPC  G C   G CG C       C        G      G    G C/G
rs26951389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46144505fItk : Intron1SNPA    A   A    A       A        A      G      A/G
rs26951388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46144536fItk : Intron1SNPC CCCC   T CC C       C        C    C T    C C/T
rs26951387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46144721fItk : Intron1SNPA  AAA   G AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145133fItk : Intron1SNPC CCCC   T CC C       C        C    C T    C C/T
rs26951385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145171fItk : Intron1SNPA    A      A A       A        A    A G    A A/G
rs26951384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145221fItk : Intron1SNPA  AAA   G AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145268fItk : Intron1SNPT    T     TT T       T        T    T C    T C/T
rs26951382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145314fItk : Intron1SNPG GGGG   T GG G       G        G    G T      G/T
rs26951381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145558fItk : Intron1SNPT TTTT   T TT T       T        T    T C    T C/T
rs26951380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145601fItk : Intron1SNPT  TTT   C  T T       T        T    T C    T C/T
rs26951379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145635fItk : Intron1SNPC CCCC   C  C C       C        C    C A    C A/C
rs26951378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145879fItk : Intron1SNPC CCCC   T CC C       C        C    C C    C C/T
rs29454474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46145982fItk : Intron1SNP  A   C                                      A/C
rs26951377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146015fItk : Intron2SNP  TT  G  G T                          T      G/T
rs29392294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146022fItk : Intron1SNP  A   G                                      A/G
rs29438250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146045fItk : Intron1SNP  T   C                                      C/T
rs29427370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146233fItk : Intron1SNPG G   A    G                                 A/G
rs26951376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146308fItk : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G        G    G G    G A/G
rs26951375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146419fItk : Intron1SNPT T TT   A TT T       T        T    T T    T A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26951374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146501fItk : Intron1SNPA AAAA   C AA A       A        A    A C    A A/C
rs29447555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46146794fItk : Intron1SNP GG   T    G                                 G/T
rs26951373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46147065fItk : Intron1SNPG GAGG   G GA G       G        G    G G    G A/G
rs26951372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46147300fItk : Intron1SNPC CCCC   C CC C       C        C    C G    C C/G
rs26951371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46147369fItk : Intron1SNPA AAAA   G AA A       A        A    A G    A A/G
rs29485171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46148029fItk : Intron1SNP  C   A    C                                 A/C
rs26951370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46148801fItk : Intron1SNPA AAAA   G  AGA       A        A    A G    A A/G
rs26951369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46153092fItk : Intron1SNP         G                                 A A/G
rs29442409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46153852fItk : Intron1SNP CC   A    C                                 A/C
rs29458190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46153996fItk : Intron1SNP TT   C    T                                 C/T
rs29468668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46154014fItk : Intron1SNP GG   A    G                                 A/G
rs29450481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46154317fItk : Intron1SNP  G   A    G                                 A/G
rs29449003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46154328fItk : Intron1SNP  A   C    A                                 A/C
rs29384707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46154394fItk : Intron1SNP  G   A    G                                 A/G
rs29426225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46158064fItk : Intron1SNP AA   T    A                                 A/T
rs29421999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46158312fItk : Intron1SNP TT   C    T                                 C/T
rs26951368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46160720fItk : Intron1SNPT  T T     TT T       T        T    T G    T G/T
rs26951367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46161199fItk : Intron1SNPT T TT        T       T        T           C C/T
rs26951366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46161299fItk : Intron1SNPG GGGG     GG G       G        G    G A    G A/G
rs26951365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46161471fItk : Intron1SNPT TTTT      T T       T        T    T C    T C/T
rs26951364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46161474fItk : Intron1SNPC  CCC      C C       C        C    C      T C/T
rs26951363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46162142fItk : Intron1SNPA AAAA   G AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46162233fItk : Intron1SNPT  TTT      T T       T        T    T C    T C/T
rs26951361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46162768fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C T    C C/T
rs29393841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46162811fItk : Intron1SNP  G   A    G                                 A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29459213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163141fItk : Intron1SNPC C   A    C                                 A/C
rs29397564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163160fItk : Intron1SNPC C   T    C                                 C/T
rs29411656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163218fItk : Intron1SNPC T   C    C                                 C/T
rs26951360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163484fItk : Intron1SNPT  CTT     TC T       T        T    T C    C C/T
rs26951359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163833fItk : Intron2SNPGGGAGGA    GA G       G        G    G A    A A/G
rs26951358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163853fItk : Intron1SNPC CGCC     CG C       C        C    C C    G C/G
rs26951357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46163962fItk : Intron1SNPA  G A     AG A       A        A    A G    G A/G
rs26951356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46164015fItk : Intron2SNPGGGA GA    GA G       G        G    G      A A/G
rs26951355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46165338fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C A    C A/C
rs6257081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46166748fItk : Intron1SNP      G   A                                  A/G
rs6257527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46166805fItk : Intron1SNP      C   T                                  C/T
rs6159944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46166920fItk : Intron1SNP      G   C                                  C/G
rs6161153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46167161fItk : Intron1SNP      A   T                                  A/T
rs29463046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46168330fItk : Intron1SNPGGG   A    G                                 A/G
rs29416492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46168396fItk : Intron1SNPCCC   T    C                                 C/T
rs29429886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46168683fItk : Intron1SNP GG   A    G                                 A/G
rs26951354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46168888fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C T    C C/T
rs26951353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46168928fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C G    C C/G
rs29405550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46169301fItk : Coding-Synonymous1SNPCCC   T    C                                 C/T
rs26951352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46170329fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C C    T C/T
rs26951351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46170478fItk : Intron1SNPG GGGG     GGAG       G        G    G A    G A/G
rs26951350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46171629fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C C    T C/T
rs26951349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46171760fItk : Intron1SNPG GGGG     GGGG       G        G    G A    G A/G
rs6251729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172344fItk : Intron2SNPC CCCCC   ACC C       C        C    C A    C A/C
rs6252231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172454fItk : Intron2SNPC CCCCC   TCCTC       C        C    C T    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3692820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172485fItk : Intron2SNPC CCCCT   CCC C       C        C    C C    T C/T
rs6252292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172496fItk : Intron2SNPT TTTTT   CTT T       T        T    T C    T C/T
rs6252753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172595fItk : Intron1SNP      A   G                                  A/G
rs6253165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172603fItk : Intron2SNPG GGGGG   AGGAG       G        G    G A    G A/G
rs3694601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172736fItk : Intron3SNPAAAAAAG    AA A       A        A    A G    G A/G
rs6253763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172750fItk : Intron1SNP      T   C                                  C/T
rs6253779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172754fItk : Intron1SNP      T   C                                  C/T
rs6253839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172795fItk : Intron1SNP      A   G                                  A/G
rs26951348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172861fItk : Intron1SNPA AAAA     AAGA       A        A    A A    A A/G
rs3695307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172900fItk : Intron3SNPTTTTTTG    TGGT       T        T    T G    G G/T
rs3709607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172978fItk : Intron2SNP  C C A    C                                 A/C
rs3709611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46172980fItk : Intron2SNP  C C T    C                                 C/T
rs26951347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46173218fItk : Intron1SNPA A AA     AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46173284fItk : Intron1SNPA AAAA     AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46173394fItk : Intron1SNPC  CCC     CC C       C        C    C T    C C/T
rs29470066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46173617fItk : Intron1SNP AA   T    A                                 A/T
rs29457984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46173735fItk : Intron1SNP CC   G    C                                 C/G
rs29430682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46173748fItk : Intron1SNP GG   A    G                                 A/G
rs26951344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46174123fItk : Intron1SNPA  A A     AA A       A        A    A G    A A/G
rs29393495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46174176fItk : Intron1SNP  A   C                                      A/C
rs29386719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46174465fItk : Intron1SNP  T   C                                      C/T
rs26951343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46174852fItk : Intron1SNPT  TTT     TT T       T        T    T A    T A/T
rs26951342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46175157fItk : Intron1SNPT TTTT     TTCT       T        T    T C    T C/T
rs3680088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46175551fItk : Intron3SNPGGGGGGA    GG G       G        G    G      A A/G
rs26951341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46175645fItk : Intron1SNPG GGGG     GG G       G        G    G A    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26951340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46175723fItk : Intron1SNPC CCCC     CCGC       C        C    C G    C C/G
rs26951339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46175758fItk : Intron1SNPA AAAA     AACA       A        A      C    A A/C
rs26951338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46176384fItk : Intron1SNPT TTTT     TTTT       T        T    T C    T C/T
rs26951337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46176460fItk : Intron2SNPAAAGAAG    AA A       A        A    A G    G A/G
rs29424095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46176782fItk : Intron1SNP  T   A    T                                 A/T
rs26951336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46177165fItk : Intron1SNPC  CCC     CC C       C        C    C T    C C/T
rs26951335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46177212fItk : Intron1SNPA GA A     AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46177285fItk : Intron1SNPT TTTT      T T       T        T    T C    T C/T
rs26951333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178023fItk : Intron1SNPC CCCC      C C       C        C    C A    C A/C
rs26951332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178070fItk : Intron1SNPA  A A      A A       A        A    A G    A A/G
rs26951331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178151fItk : Intron2SNPCCCA CA    CC C       C        C    C A    A A/C
rs26951330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178246fItk : Intron1SNPA AAAA     AAGA       A        A    A G    A A/G
rs26951329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178271fItk : Intron2SNPTTTCTTC    TTCT       T        T    T C    C C/T
rs29398556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178744fItk : Intron1SNP  G   A    G                                 A/G
rs29465331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178752fItk : Intron1SNPT T   C    T                                 C/T
rs29468222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178841fItk : Intron1SNPA A   G    A                                 A/G
rs29469619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178850fItk : Intron1SNPA A   G    A                                 A/G
rs26951328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46178943fItk : Intron1SNPT TTTT     TTAT       T        T    T A    T A/T
rs26951327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179000fItk : Intron1SNPA  A A     AAGA       A        A    A G    A A/G
rs26951326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179434fItk : Intron2SNPTTTC TC    T  T       T        T    T T    C C/T
rs29440580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179447fItk : Intron1SNPTTT   C    T                                 C/T
rs26951325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179581fItk : Intron1SNPC CTCC      CCC       C        C    C C    T C/T
rs26951324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179673fItk : Intron1SNPG GGGG      GGG       G        G    G A    G A/G
rs26951323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179719fItk : Intron1SNPA AGAA      AGA       A        A    A A    G A/G
rs29409878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179903fItk : Intron1SNP AA   T    A                                 A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29469762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46179938fItk : Intron1SNP TT   C    T                                 C/T
rs29432220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46180021fItk : Intron1SNP CC   T    C                                 C/T
rs29468174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46180022fItk : Intron1SNP TT   C    T                                 C/T
rs29478831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46180032fItk : Intron1SNP AA   G    A                                 A/G
rs29422064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46180869fItk : Intron1SNPGG    A    G                                 A/G
rs26951322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46181159fItk : Intron1SNPA  AAA     AA A       A        A    A G    A A/G
rs29392467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46181661fItk : Intron1SNP TT   C    T                                 C/T
rs29413652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46181764fItk : Intron1SNP AA   G    A                                 A/G
rs26951321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46182070fItk : Intron1SNP         A                                 G A/G
rs29393458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46183578fItk : Intron1SNPCCC   A    C                                 A/C
rs26951320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46183770fItk : Intron1SNP         A   G                             A A/G
rs3661316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46184187fItk : Intron2SNPC C C G    C                                 C/G
rs29470944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46184786fItk : Intron1SNP CC   T    C                                 C/T
rs29402931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46184859fItk : Intron1SNP CC   G    C                                 C/G
rs29424765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46184965fItk : Intron1SNP GG   C                                      C/G
rs29436138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46185093fItk : Intron1SNPTTT   C                                      C/T
rs26951319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46187377fItk : Intron1SNP         T                                 C C/T
rs26951318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46187385fItk : Intron1SNP             G                             C C/G
rs26951317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46187831fItk : Intron1SNP         G                                 A A/G
rs26951316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46188021fItk : Intron1SNP         G                                 A A/G
rs26951315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46188529fItk : Intron1SNPT        C                                 T C/T
rs26951314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46188788fItk : Intron1SNP         T   G                             G G/T
rs6350465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46189902fItk : Intron1SNP      G   A                                  A/G
rs6350604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46189995fItk : Intron1SNP      G   A                                  A/G
rs6352123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46190261fItk : Intron1SNP      T   C                                  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6352653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46190379fItk : Intron1SNP      A   G                                  A/G
rs26951313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46190908fItk : Intron1SNPC        A   C                               A/C
rs26951312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46191917fItk : Intron1SNPC    C     CC C       C             C C    T C/T
rs26951311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46191993fItk : Intron1SNPC   CC   T C          C        C    C C    T C/T
rs26951310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192001fItk : Intron1SNPG G GG   G GGGG       G        G    G G    A A/G
rs26951309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192158fItk : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G        G    G A    G A/G
rs26951308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192173fItk : Intron1SNPG G GG   A GGAG       G        G    G A    A A/G
rs26951307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192354fItk : Intron1SNPC CCCC     CC C       C        C    C C    T C/T
rs26951306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192373fItk : Intron1SNPA  A A   G AA A       A        A    A A    A A/G
rs26951305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192388fItk : Intron1SNPT  CTT   C TTCT       T        T    T C    C C/T
rs26951304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192708fItk : Intron1SNPT             T                T      C    T C/T
rs26951303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192754fItk : Intron1SNPC  C C      C C       C        C    C      T C/T
rs26951302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46192976fItk : Intron1SNPC    C   C CC C       C        C    C T    C C/T
rs26951301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193051fItk : Intron1SNPC  CCC   T CC C       C        C    C T    T C/T
rs26951300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193161fItk : Intron1SNPC    C     CC C       C        C           A A/C
rs26951299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193228fItk : Intron1SNPC CCCC   A CCCC       C        C    C C    C A/C
rs26951298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193401fItk : Intron1SNPT  T T   G TTGT       T        T    T G    G G/T
rs26951297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193468fItk : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C        C    C C    T C/T
rs26951296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193572fItk : Intron1SNPC    C     CC C       C        C    C C    T C/T
rs26951295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193583fItk : Intron1SNP   C C      C C                       C    T C/T
rs26951294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193625fItk : Intron1SNPA AAAA   A AAAA       A        A    A G    A A/G
rs26951293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193643fItk : Intron1SNPG G GG   G GGGG       G        G    G      T G/T
rs26951292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193672fItk : Intron1SNPG G GG     GG G       G        G    G T    T G/T
rs6408423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193735fItk : Intron1SNP      C   T                                  C/T
rs6161050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46193959fItk : Intron1SNP      G   A                                  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6161580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46194008fItk : Intron1SNP      C   T                                  C/T
rs6161633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46194036fItk : Intron1SNP      C   A                                  A/C
rs6162699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46194237fItk : Intron1SNP      A   C                                  A/C
rs29420456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46194461fItk : Intron1SNPCCC   T    C                                 C/T
rs26951291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46194998fItk : Intron2SNPTTTCTTC  C TTCT       T        T    T C    C C/T
rs26951290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46195020fItk : Intron1SNPG GGGG   G  G G       G        G    G A    G A/G
rs26951289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46195097fItk : Intron2SNPAAAGAAG  G A GA       A        A    A G    G A/G
rs29431131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46195287fItk : Intron1SNP GG   A                                      A/G
rs26951288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46195340fItk : Intron1SNPT TTTT     TT T       T        T    T C    T C/T
rs26951287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46195497fItk : Intron2SNPTTTTTTC  C TT T       T        T    T C    C C/T
rs26951286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46195798fItk : Intron1SNPT  TTT   T TTCT       T        T    T C    T C/T
rs26951285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196146fItk : Intron1SNPT  TTT   C TT T       T        T    T C    T C/T
rs26951284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196628fItk : Intron1SNPT  T T   T TTAT       T        T    T A    T A/T
rs6200638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196684fItk : Intron1SNP      G   A                                  A/G
rs26951283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196686fItk : Intron1SNPT  C T   C    T       T             T C    C C/T
rs6200984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196718fItk : Intron1SNP      T   C                                  C/T
rs6201000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196725fItk : Intron1SNP      C   T                                  C/T
rs6201054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196752fItk : Intron1SNP      A   G                                  A/G
rs6201081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196761fItk : Intron1SNP      A   G                                  A/G
rs26951282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196794fItk : Intron2SNPAAAAAAT  T AATA       A        A    A T    T A/T
rs6364850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46196932fItk : Intron2SNPG GGGGG  GAGGGG       G        G    G A    G A/G
rs6365385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197028fItk : Intron4SNPGGGGGGCCCGGGG GGGGGGGGGGCCCGGGGGGGGGGGGGGGGCGC/G
rs6365963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197145fItk : Intron2SNPT  TTTT  TGTT T       T        T    T G    T G/T
rs26951281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197279fItk : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G        G    G A    G A/G
rs26951280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197334fItk : Intron2SNPAAAGAAG  G A GA       A        A    A G    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26951279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197437fItk : Intron1SNPC C CC   C    C       C        C    C T    C C/T
rs26951278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197513fItk : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C        C    C T    C C/T
rs29422266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197609fItk : Intron1SNPGG    C    G                                 C/G
rs26951277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197668fItk : Intron1SNPT    T   T    T       T        T    T C    T C/T
rs26951276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197677fItk : Intron1SNP  C      T                          C        C/T
rs26951275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197681fItk : Intron2SNPAA GAAG  G AAGA       A        A    A G    G A/G
rs26951274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197756fItk : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C        C    C T    C C/T
rs26951273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46197809fItk : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T        T    T C    T C/T
rs26951272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198082fItk : Intron1SNPC C CC   G CC C       C        C    C G    C C/G
rs26951271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198196fItk : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T        T    T C    T C/T
rs29425203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198286fItk : Intron1SNP GG   A    G                                 A/G
rs29432300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198334fItk : Intron1SNP  G   A    G                                 A/G
rs26951270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198367fItk : Intron1SNPC    C   T    C       C             C T      C/T
rs26951269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198420fItk : Intron1SNPA  AAA   A AA A       A        A    A G    A A/G
rs26951268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198628fItk : Intron2SNPGGGGGGA  G GGGG       G        G    G G    A A/G
rs28253055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46198672fItk : Intron1SNPT  TTT   T TT T       T        T    T G    T G/T
rs28253054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46199137fItk : Intron1SNPG GGGG   G GGTG       G        G    G T    G G/T
rs28253053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46199186fItk : Intron1SNPA AAAA   A AA A       A        A    A G    A A/G
rs29411867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46199589fItk : Intron1SNP TT   C    T                                 C/T
rs28253052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200113fItk : Intron2SNPT T TTC    TT T       T        T    T C    C C/T
rs28253051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200115fItk : Intron1SNP         A                                 T A/T
rs28253050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200167fItk : Intron1SNPC  CCC   C CC C       C        C    C T    C C/T
rs28253049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200250fItk : Intron2SNPC CC CT    CCCC       C        C    C C    T C/T
rs28253048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200284fItk : Intron1SNPA AAAA   G AA A       A        A    A      A A/G
rs6159954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200348fItk : Intron1SNP      G   A                                  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3662381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200392fItk : Intron3SNPTTTTTTC  TTTTTT       T        T    T T    C C/T
rs3662874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200432fItk : Intron3SNPCCC CCA  CCCCCC       C        C    C C    A A/C
rs3662941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200472fItk : Intron3SNPGGGGGGA  GGGGGG       G        G    G A    A A/G
rs6161180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200592fItk : Intron2SNPA AAAAA  AGAAGA       A        A    A G    A A/G
rs29436248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200817fItk : Intron1SNP AA   G    A                                 A/G
rs29447107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200880fItk : Intron1SNP CC   T    C                                 C/T
rs29467578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200944fItk : Intron1SNP AA   T    A                                 A/T
rs29405546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46200974fItk : Intron1SNP AA   G    A                                 A/G
rs29477460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46201170fItk : Intron1SNP AA   C    A                                 A/C
rs29433503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46201270fItk : Intron1SNP  T   C    T                                 C/T
rs29392401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46201905fItk : Intron1SNPAAA   G                                      A/G
rs29437271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46202011fItk : Intron1SNPT T   C                                      C/T
rs29397763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46202023fItk : Intron1SNPT T   C                                      C/T
rs28253047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46202134fItk : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C        C    C C    C C/T
rs28253046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46202251fItk : Intron1SNPC CTCC   C CC C       C        C    C C    C C/T
rs28253045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46202520fItk : Intron1SNPA   AA   G AA A       A        A    A G    A A/G
rs28253044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46202790fItk : Coding-Synonymous1SNPA AGAA   G AAGA       A        A    A G    A A/G
rs28253043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:46203179fItk : Locus-Region1SNPA  G A   A AA A       A        A    A G    A A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory