About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Il1b
interleukin 1 beta
MGI:96543

100 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27447610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129362785fGm14039 : within coordinates of
Il1b : 1785 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A  AAGA            A   A    A  A/G
rs27447609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129362889fIl1b : 1681 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C  CCCC            C   C    CAAA/C
rs27447608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129362940fIl1b : 1630 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCG C CCCGC            C   C    CCCC/G
rs27447607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129362976fIl1b : 1594 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGT G GGGTG            G   G    GGGG/T
rs27447606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129362996fIl1b : 1574 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAA A GAAAA            A   A    AGGA/G
rs27447605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363197fIl1b : 1373 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCA C CCCCC            C   C    CCCA/C
rs27447604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363224fIl1b : 1346 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPA A   A TAA A            A   A    ATTA/T
rs27447603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363355fIl1b : 1215 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T CTTCT            T   T    TCCC/T
rs27447602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363401fIl1b : 1169 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAA A GAAAA            A   A    AGGA/G
rs27447601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363435fIl1b : 1135 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TT  T  TTAT            T   T    TT A/T
rs27447600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363441fIl1b : 1129 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AA  A CAA A            A   A    ACCA/C
rs27447599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363625fIl1b : 945 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
2SNPG GGA G GGGAG            G   G  A GG A/G
rs27447598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363628fIl1b : 942 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C TCCCC            C   C    CTTC/T
rs108825613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363717fIl1b : 853 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNP CC      C                      A    A/C
rs108541423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363776fIl1b : 794 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNP CC                             T    C/T
rs108067680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363790fIl1b : 780 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNP  A                             G    A/G
rs108717522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363794fIl1b : 776 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNP  A                             G    A/G
rs108737277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363833fIl1b : 737 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
1SNP  T                             C    C/T
rs27447597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129363878fIl1b : 692 bp downstream of
nmf62 : within coordinates of
2SNPAAAAC A CAACA            A   A  C ACCA/C
rs27447596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129364449fIl1b : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GAAA/G
rs3022904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129364647rIl1b : mRNA-UTR
nmf62 : within coordinates of
3SNPC CCA C CCCAC   CCC CC AACCCCCC  CCA A/C
rs3022903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129364705rIl1b : mRNA-UTR
nmf62 : within coordinates of
3SNPC CCT C CCCTC   CCC CC TTCCCCCC  CCTTC/T
rs27447595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129364905fIl1b : mRNA-UTR
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CT C/T
rs27447594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129364918fIl1b : mRNA-UTR
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CTTC/T
rs27447593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365041fIl1b : Coding-Synonymous
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27447592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365098fIl1b : Coding-Synonymous
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CT C/T
rs27447591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365197fIl1b : Coding-Synonymous
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T TTTCT            T   T    TCCC/T
rs27447590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365205fIl1b : Coding-NonSynonymous
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTG   TTTG             T        T GG/T
rs27447589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365310fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGGG            G   G    GC C/G
rs27447588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365333fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A AAAGA            A   A    AGGA/G
rs27447587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365389fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAA A AAAAA            A   A    AGAA/G
rs27447586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365622fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTA T ATTAT            T   T    T AA/T
rs27447585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365630fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAA A AAAAA            A   A    AGAA/G
rs27447584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365646fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C CCCCC            C   C    CCCC/T
rs27447583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365686fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAA A AAAAA            A   A    AAGA/G
rs27447582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365702fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTT T TTTTT            T   T    TCTC/T
rs27447581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365720fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CCTC/T
rs27447580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129365858fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTT T GTTTT            T   T    TTTG/T
rs27447579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366236fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTG T GTTGT            T   T    TGTG/T
rs27447578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366306fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCG C GCCGC            C   C    CCCC/G
rs27447577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366329fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C CCCTC            C   C    CCCC/T
rs27447576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366390fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C TCCTC            C   C    C CC/T
rs27447575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366445fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T CTTCT            T   T    TT C/T
rs27447574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366644fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT T C T  TT T            T   T    TTTC/T
rs27447573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366791fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGGG            G   G    GAGA/G
rs27447572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366797fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GGGA/G
rs27447571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366832fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T CTT T            T   T    TCTC/T
rs27447570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366859fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TT  T  TT T            T   T    TATA/T
rs27447569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129366923fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A GAAGA            A   A    AGAA/G
rs27447568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367155fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA A      AA              A        AT A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27447567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367292fIl1b : Coding-Synonymous
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGGG            G   G    GAGA/G
rs27447566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367343fIl1b : Coding-Synonymous
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T CTTCT            T   T    TCTC/T
rs27447565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367435fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTG T GTTGT            T   T    TTTG/T
rs27447564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367630fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G AGGAG            G   G    GGGA/G
rs27447563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367733fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G TGGGG            G   G    GGGG/T
rs27447562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367809fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAA A AAACA            A   A    AAAA/C
rs27447561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367841fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TT  T CTTCT            T   T    TCTC/T
rs27447560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129367883fIl1b : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGGG            G   G    GAGA/G
rs27447559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368099fIl1b : Coding-Synonymous
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C TCCTC            C   C    CTCC/T
rs27447558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368126fIl1b : Coding-Synonymous
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAT A TAATA            A   A    ATAA/T
rs27447557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368216fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CTCC/T
rs27447556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368223fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A GAAGA            A   A    AAAA/G
rs27447555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368324fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GAGA/G
rs27447554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368617fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C TCCTC            C   C    CTCC/T
rs27447553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368716fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAC A AAACA            A   A    AA A/C
rs27447552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368768fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC C C C  CCCC            C   C    CTCC/T
rs27447551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368782fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTG T  TTGT            T   T    TG G/T
rs27447550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368823fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A GAAGA            A   A    AGAA/G
rs27447549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129368902fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C CCCTC            C   C    CCCC/T
rs27447548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369011fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTT T TTTTT            T   T    TCTC/T
rs27447547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369078fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G AGGGG            G   G    GAGA/G
rs27447546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369112fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTG T  TTGT            T   T    T GG/T
rs27447545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369169fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPA A G A GAAGA            A   A    AGAA/G
rs27447544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369209fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T TTTCT            T   T    TTTC/T
rs27447543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369420fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C ACCCC            C   C    CACA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27447542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369609fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGT G GGGTG            G   G    G GG/T
rs27447541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369680fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A GAAGA            A   A    AG A/G
rs27447540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369863fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC C C C TCCC             C   C    CC C/T
rs27447539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369887fIl1b : Intron
Il1bos : Locus-Region
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C TCCCC            C   C    CCCC/T
rs27447538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369906fIl1b : Intron
Il1bos : Noncoding-Transcript-Variant
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GGGA/G
rs27447537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369939fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT T G T  TTGT            T         G G/T
rs27447536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129369956fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C TCCCC            C   C    CTCC/T
rs27447535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370047fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C CCCTC            C   C    CCCC/T
rs27447534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370071fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAT A TAATA            A   A    ATAA/T
rs27447533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370146fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T CTTCT            T   T    TCTC/T
rs27447532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370223fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPT TTC T TTTCT            T   T    TTTC/T
rs27447531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370252fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GGGA/G
rs27447530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370439fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CACA/C
rs27447529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129370481fIl1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGA G GGGAG            G   G    GAGA/G
rs52120445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371030fD2Mit135 : within coordinates of
D2Nds3 : within coordinates of
Il1b : Intron
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNP  A                                  A
rs27447528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371123fD2Mit135 : within coordinates of
Il1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC            C   C    CACA/C
rs27447527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371342fIl1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A GAAGA            A   A    AGAA/G
rs27447526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371492fIl1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G AGGGG            G   G    GGGA/G
rs27447525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371635fIl1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPA AAG A GAAGA            A   A    AGAA/G
rs27447524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371690fIl1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPC CCT C CCCTC            C   C    C CC/T
rs27447523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371736fIl1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGGG            G   G    GAGA/G
rs27447522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129371994fIl1b : Locus-Region
Il1bos : Intron
nmf62 : within coordinates of
1SNP           G                       A A/G
rs8252248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129373061rIl1b : Locus-Region
Il1bos : Noncoding-Transcript-Variant
nmf62 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCTC   CCC   C  C        C C   C/T
rs8252247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129373070rIl1b : Locus-Region
Il1bos : Noncoding-Transcript-Variant
nmf62 : within coordinates of
1SNP  AAGGAAGA   AGA   A  A        A A   A/G
rs8252246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:129373089rIl1b : Locus-Region
Il1bos : Noncoding-Transcript-Variant
nmf62 : within coordinates of
1SNP  AAGGAAAA   AAA   A  A        A A   A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/23/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory