About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Idua
iduronidase, alpha-L-
MGI:96418

42 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33215801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109096811fIdua : Locus-Region1SNP  A   T            A/T
rs33738142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109096818fIdua : Locus-Region1SNP  A   T            A/T
rs33755585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109096849fIdua : Locus-Region1SNP  A   G            A/G
rs33306947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109096908fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
1SNP  C   T  C         C/T
rs29773164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109096960fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
1SNP  C   T  C         C/T
rs33482431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109097632fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
2SNPTTTTTCCC TCCT TTTCCC/T
rs48952521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109097808fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
1SNPC CCCC T CCCC CCCCCC/T
rs47866792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109097984fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
1SNPC CCCT C CT C CCCC C/T
rs33098157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109098182fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
2SNPT TTTGGG TGGT TTTG G/T
rs6203026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109098316fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
2SNP  G   A GG         A/G
rs33240429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109098355fIdua : Locus-Region
Slc26a1 : Locus-Region
1SNP AA   G  A         A/G
rs50404997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109098599fIdua : Intron
Slc26a1 : Locus-Region
1SNPA AAAT T ATTA AAATTA/T
rs6217529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109098696fIdua : Intron
Slc26a1 : Locus-Region
1SNP      T C          C/T
rs46662326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109099006fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNPT TTTC T TCCT TTTCTC/T
rs51430937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109099080fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNPG GGGA G GAAG GGGAGA/G
rs48927922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109099096fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNPC CCCA C CAAC CCCACA/C
rs33570901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109099434fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNP  T   A  T         A/T
rs46609827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109099518fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNPG GGGT G GTTG GGGTGG/T
rs51033888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109100019fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG A GGGG GGGG A/G
rs51890126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109100228fIdua : Intron
Slc26a1 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG A GGGG GGGG A/G
rs46737915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109100575fIdua : Intron
Slc26a1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGA G GAAG GGGAGA/G
rs29545681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109100584fIdua : Intron
Slc26a1 : Coding-Synonymous
1SNP  T   C  T         C/T
rs29781307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109100599fIdua : Intron
Slc26a1 : Coding-Synonymous
1SNP  C   T  C         C/T
rs50750189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109101948fIdua : Intron
Slc26a1 : Intron
1SNPC CCCT T CTTC CCCT C/T
rs51974583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109102276fIdua : Intron
Slc26a1 : Intron
1SNPC CCCT C CTTC CCCT C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49767107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109103403fIdua : Intron
Slc26a1 : Intron
1SNPT TTTC C TCCT TTTCCC/T
rs48059119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109103590fIdua : Intron
Slc26a1 : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GGGGAA/G
rs48949384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109103990fIdua : Intron
Slc26a1 : Intron
1SNPG GGGA G GAAG GGGGGA/G
rs33534756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109104829fIdua : Intron
Slc26a1 : Locus-Region
1SNP CC   T  C         C/T
rs33437040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109105126fIdua : Intron1SNP TT   G  T         G/T
rs33634227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109105880fIdua : Intron1SNPC C   T  C         C/T
rs33546694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109105922fIdua : Intron1SNPA A   T  A         A/T
rs29733215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109107006fIdua : Intron1SNP TC   C  C         C/T
rs33544748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109108826fIdua : Coding-Synonymous1SNP TT   C  T         C/T
rs33430763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109109279fIdua : Intron1SNPA A   G  A         A/G
rs4225402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109109824rIdua : Intron1SNP  C CCCT C   C     C/T
rs33545790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109111020fIdua : Coding-NonSynonymous1SNP GG   A  G         A/G
rs29732451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109111296fIdua : Intron1SNP TT   C  T         C/T
rs33172548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109111322fIdua : Intron1SNP GG   C  G         C/G
rs33324086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109111524fIdua : Intron1SNP TT   C  T         C/T
rs33509181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109111547fIdua : Intron1SNP TT   C  T         C/T
rs33389682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:109113298fIdua : mRNA-UTR1SNP CC      A         A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory