About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Rsph4a
radial spoke head 4 homolog A (Chlamydomonas)
MGI:3027894

78 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48294130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903152fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP  G      G     A   A/G
rs48425245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903171fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP GG      G     A   A/G
rs46474475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903216rGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP AA      A         A
rs52046776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903277fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP  G      G     A   A/G
rs45835680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903283fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP  T      T     C   C/T
rs51227261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903573fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP  G      G         G
rs108929379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903585rGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP C                 C
rs108543287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903589rGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
2SNP TT      A         A/T
rs50841853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903625fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP TA      T         A/T
rs33798394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903752fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGG GG GTGG/T
rs33798396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903820fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C T C TT TCTC/T
rs33798398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33903943fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTA TT TATA/T
rs33798400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33904158fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAGGG GAGA/G
rs33798402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33904195fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TT  TT T TA/T
rs33799214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33904365fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAG AA AGAA/G
rs33799216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33904446fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs33799218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33904927fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGG GGGA/G
rs33799220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905062fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCTTT TCTC/T
rs33799222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905076fGn : within coordinates of
Rsph4a : Locus-Region
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTT TT TTTA/T
rs33800104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905480fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-NonSynonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAG AA AGAA/G
rs33800106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905492fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-NonSynonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGGGG GAGA/G
rs33800108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905513fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-NonSynonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGC GG GCGC/G
rs33800110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905698fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-Synonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGAAA AGAA/G
rs33800112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33905773fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-Synonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs33800824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906114fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGG GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33800826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906441fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAAAA AAAA/G
rs33800828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906502fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs33800830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906646fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAA AGAA/G
rs33800832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906673fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAAAAA AGAA/G
rs33801634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906913fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTCCC CTCC/T
rs33801636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33906971fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs33801638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33907974fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTATTT TTTA/T
rs33801640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33908381fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs33801642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33908409fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAA AGAA/G
rs33802524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33909082fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-NonSynonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA T AAAAAA AAAA/T
rs33802526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33910067fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG G GG A GGGGGG GGGA/G
rs33802528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33910531fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC G C  CCC CGCC/G
rs33802530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33910976fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA T AAAAAA AAAA/T
rs33802532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911026fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAGGG GAGA/G
rs33795135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911204fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCCCCC CCCA/C
rs33795137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911321fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAA AGAA/G
rs33795139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911360fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGG GGGA/G
rs33795141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911382fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TT TTT TCTC/T
rs33795143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911417fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACAAA ACAA/C
rs33795865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911484fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTATTT TATA/T
rs33795867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33911503fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCCCC CTCC/T
rs33795869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33912001fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs49655892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33912540rGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP  G      G     A   A/G
rs33795871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33912900fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAGGG GAGA/G
rs33795873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33913190fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33796545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33913235fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAA AGAA/G
rs33796547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33913300fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTCCC CTCC/T
rs33796549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33913347fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AAAAAA AAAA/C
rs33796551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33913595fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGAAA AGAA/G
rs33796553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33913624fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGCCC CGCC/G
rs33797225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33914066fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAAAA AA A/G
rs33797227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33914082fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAA AGAA/G
rs33797229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33914130fGn : within coordinates of
Rsph4a : Intron
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAAAA AAAA/G
rs33797231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33914532fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-NonSynonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAGGG GGGA/G
rs33797233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33914558fGn : within coordinates of
Rsph4a : Coding-Synonymous
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTT TTTC/T
rs29319976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33915777fGn : within coordinates of
Rsph4a : mRNA-UTR
Xiaf3 : within coordinates of
3SNPGGCGCGGG GGGGGG GGGC/G
rs33798316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33915831fGn : within coordinates of
Rsph4a : mRNA-UTR
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs33798318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33915926fGn : within coordinates of
Rsph4a : mRNA-UTR
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCTTT TCTC/T
rs33798320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916738fGn : within coordinates of
Rsph4a : 855 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCCCC CC C/T
rs33798322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916765fGn : within coordinates of
Rsph4a : 882 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCACCC CACA/C
rs6157779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916919fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1036 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPA AAAAATTAATAAA ATAA/T
rs6157830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916952fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1069 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPA AAAAACCAA AAA A AA/C
rs6157845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916964fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1081 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP      A G          A/G
rs6157846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916965fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1082 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP      A G          A/G
rs6157854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916972fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1089 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP      G A          A/G
rs6157857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916975fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1092 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP      A G          A/G
rs6157873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916981fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1098 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNP      A G          A/G
rs6157892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33916992fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1109 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPT TTTTTCCTT TTT T TC/T
rs6158962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33917155fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1272 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPC CCCCCTTCCTCCC CTCC/T
rs6158994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33917168fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1285 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPA AAAAA CAACAAA ACAA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6159482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33917227fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1344 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPC CCCCCGGCCGCCC CGCC/G
rs6173448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33917496fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1613 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
2SNPT TTTTTTATTATTT TATA/T
rs33799231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:33917815fGn : within coordinates of
Rsph4a : 1932 bp downstream of
Xiaf3 : within coordinates of
1SNPT TTTT G TTGTTT TGGG/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory