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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Htr5a 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A MGI:96283 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs32111759 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166545 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | T | C | C | C | C | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111756 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166560 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111043 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166583 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111040 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166591 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111037 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166787 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111034 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166843 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | T | A | A | T | T | A | T | T | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110291 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28166855 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110288 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28167929 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110285 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28167965 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | G | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109422 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28167998 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | T | A | A | A | A | T | T | A | T | T | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109419 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168104 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | C | A | A | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109416 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168173 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | G | C | C | C | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108703 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168200 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108700 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168228 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108697 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168405 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | G | G | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108694 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168492 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | G | G | G | G | G | A | A | G | A | A | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107831 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168659 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107828 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28168802 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | T | T | T | T | C | C | T | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225110 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28169717 | f | Htr5a : Coding-Synonymous | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | |
| rs4225111 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28169753 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225112 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28169791 | f | Htr5a : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4225113 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28169793 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107824 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28169810 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6278230 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28169863 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29525644 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28170162 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs32107131 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28170380 | f | Htr5a : Intron | 2 | SNP | G | A | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29537618 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28170976 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107128 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28170978 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107125 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171039 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32114281 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171120 | f | Htr5a : Intron | 2 | SNP | G | G | C | C | G | G | G | C | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32114278 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171171 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32114275 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171212 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113402 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171298 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33616571 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171350 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4135670 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171354 | f | Htr5a : Intron | 2 | SNP | G | G | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4136235 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171416 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29563932 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171585 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33247107 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171704 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33555486 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28171873 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29823888 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172229 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113399 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172508 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113396 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172640 | f | Htr5a : Intron | 2 | SNP | T | T | C | C | C | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112583 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172742 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112580 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172767 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112577 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172792 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112574 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172886 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29682715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172893 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33451963 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28172894 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111721 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173116 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173370 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs32111715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173414 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110962 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173510 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110959 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173537 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110956 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173848 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110243 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173880 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110240 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173887 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110237 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28173929 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110234 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28174097 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | T | T | G | T | T | T | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109441 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28174185 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | A | C | C | C | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109438 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28174224 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33757154 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28174382 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | A | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29550702 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28174466 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33472380 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28174755 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109435 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28175337 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108692 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28175494 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108689 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28175771 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | C | C | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108686 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28175956 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107873 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28175983 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107870 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177002 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107867 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177039 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107864 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177081 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107102 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177159 | f | Htr5a : Intron | 1 | SNP | G | A | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107099 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177332 | f | Htr5a : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33575678 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177353 | f | Htr5a : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107096 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177599 | f | Htr5a : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs32113842 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177708 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113839 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177796 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113836 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28177962 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113003 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178182 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | C | C | A | A | C | A | A | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33215798 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178359 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113000 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178534 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | C | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112997 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178812 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 2 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33190105 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178820 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29671570 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178839 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112994 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178885 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112111 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28178993 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112108 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179030 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32112105 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179065 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111262 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179197 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111259 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179243 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111257 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179529 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33338789 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179578 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32111254 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179635 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110861 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179654 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110858 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179733 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32110855 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179770 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109932 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179842 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109929 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179866 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109926 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179867 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109183 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28179944 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs32109180 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180053 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109177 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180065 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32109174 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180322 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108511 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180358 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108508 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180429 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32108505 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180610 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107742 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28180698 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107739 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28181170 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107736 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28181371 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107063 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28181500 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107060 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28181535 | f | Htr5a : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107057 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28181820 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32107054 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28181970 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32114294 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28182094 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32113342 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr5:28182095 | f | Htr5a : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | A | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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